More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2761 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00435  copper transporter  51.33 
 
 
834 aa  694    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3126  copper-translocating P-type ATPase  51.33 
 
 
834 aa  694    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1265  copper exporting ATPase  48.13 
 
 
955 aa  682    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.057349 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0577  copper exporting ATPase  51.46 
 
 
834 aa  697    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1689  cation transporter E1-E2 family ATPase  91.24 
 
 
753 aa  1384    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2772  copper-translocating P-type ATPase  66.58 
 
 
757 aa  1014    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0527  copper exporting ATPase  51.33 
 
 
834 aa  696    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1408  copper-translocating P-type ATPase  84.06 
 
 
744 aa  1253    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.659936  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00440  hypothetical protein  51.33 
 
 
834 aa  694    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3818  copper-translocating P-type ATPase  52.32 
 
 
747 aa  749    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.585028  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3027  copper exporting ATPase  48.27 
 
 
955 aa  685    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004188  copper-translocating P-type ATPase  49.8 
 
 
909 aa  714    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3220  copper exporting ATPase  48.94 
 
 
907 aa  706    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1485  copper-translocating P-type ATPase  66.93 
 
 
752 aa  988    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.391625 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0419  copper exporting ATPase  51.2 
 
 
834 aa  694    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0270  copper-translocating P-type ATPase  52.58 
 
 
748 aa  748    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1505  copper-translocating P-type ATPase  82.74 
 
 
744 aa  1234    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1535  copper-translocating P-type ATPase  82.6 
 
 
744 aa  1233    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.639562  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3191  copper-translocating P-type ATPase  65.97 
 
 
760 aa  994    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.427707  normal  0.767066 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3006  copper-translocating P-type ATPase  48.81 
 
 
850 aa  701    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40662  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00355  Cation transport ATPase  51.39 
 
 
782 aa  743    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0962  copper exporting ATPase  50.8 
 
 
832 aa  718    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.220688  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0552  copper exporting ATPase  50.8 
 
 
833 aa  701    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0802  copper-transporting P-type ATPase  46.47 
 
 
902 aa  670    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00395  Cation transport ATPase  52.32 
 
 
747 aa  741    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2846  copper-translocating P-type ATPase  82.87 
 
 
744 aa  1236    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.515584  hitchhiker  0.000113532 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1031  copper-translocating P-type ATPase  49.67 
 
 
913 aa  704    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01268  cation transport ATPase  48.94 
 
 
898 aa  701    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2091  copper-translocating P-type ATPase  51.88 
 
 
750 aa  759    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3132  copper exporting ATPase  51.06 
 
 
834 aa  689    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.142794  hitchhiker  0.000000556714 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0563  copper exporting ATPase  51.06 
 
 
834 aa  689    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0523  copper exporting ATPase  51.33 
 
 
834 aa  696    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2587  copper-translocating P-type ATPase  96.97 
 
 
758 aa  1480    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0901243 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2654  copper-translocating P-type ATPase  97.23 
 
 
758 aa  1478    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0212  copper-translocating P-type ATPase  50.8 
 
 
746 aa  701    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2255  copper-translocating P-type ATPase  47.43 
 
 
869 aa  692    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1690  copper-translocating P-type ATPase  48.66 
 
 
740 aa  704    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0547  copper exporting ATPase  50.8 
 
 
833 aa  700    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4145  copper-translocating P-type ATPase  50.73 
 
 
778 aa  730    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.418825  normal  0.147287 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3027  copper-translocating P-type ATPase  49.93 
 
 
939 aa  716    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2761  copper-translocating P-type ATPase  100 
 
 
753 aa  1519    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1499  copper-translocating P-type ATPase  83.27 
 
 
744 aa  1240    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0545  copper exporting ATPase  50.8 
 
 
833 aa  701    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1381  copper-translocating P-type ATPase  49.6 
 
 
844 aa  724    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0606  copper exporting ATPase  50.8 
 
 
833 aa  701    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3789  copper-translocating P-type ATPase  49.4 
 
 
860 aa  711    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1097  copper exporting ATPase  49.07 
 
 
907 aa  716    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3165  copper exporting ATPase  48.27 
 
 
961 aa  684    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.517155  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0477  copper-exporting ATPase  48.79 
 
 
742 aa  704    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0562  copper exporting ATPase  50.67 
 
 
833 aa  699    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.304776  normal  0.828863 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1807  cation transporter E1-E2 family ATPase  49.67 
 
 
915 aa  698    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2072  copper-translocating P-type ATPase  46.36 
 
 
725 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  45.12 
 
 
837 aa  601  1e-170  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  44.65 
 
 
826 aa  599  1e-170  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  45 
 
 
836 aa  592  1e-168  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  45 
 
 
836 aa  592  1e-168  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  44.9 
 
 
827 aa  592  1e-168  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  44.1 
 
 
836 aa  582  1.0000000000000001e-165  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  43.73 
 
 
762 aa  584  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  43.73 
 
 
762 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  43.73 
 
 
767 aa  582  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  44.43 
 
 
841 aa  580  1e-164  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  43.73 
 
 
762 aa  580  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  43.92 
 
 
833 aa  579  1e-164  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  50.63 
 
 
823 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  43.59 
 
 
762 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  44.08 
 
 
833 aa  573  1.0000000000000001e-162  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1596  hypothetical protein  47.42 
 
 
735 aa  575  1.0000000000000001e-162  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  42.8 
 
 
835 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1259  heavy metal translocating P-type ATPase  44.85 
 
 
834 aa  574  1.0000000000000001e-162  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.499676  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2080  heavy metal translocating P-type ATPase  42.17 
 
 
814 aa  569  1e-161  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0351429  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0713  heavy metal translocating P-type ATPase  46.52 
 
 
872 aa  569  1e-161  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0185288 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1397  hypothetical protein  47.16 
 
 
735 aa  568  1e-160  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6890  copper-translocating P-type ATPase  42.91 
 
 
754 aa  568  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  43.25 
 
 
852 aa  567  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2388  heavy-metal transporting P-type ATPase  43.08 
 
 
819 aa  565  1e-160  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168329  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  42.37 
 
 
841 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  43.34 
 
 
826 aa  562  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5724  heavy metal translocating P-type ATPase  42.99 
 
 
839 aa  563  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.788276 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11723  heavy-metal transporting P-type ATPase  44.03 
 
 
835 aa  562  1.0000000000000001e-159  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0439709  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  44.25 
 
 
827 aa  562  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  49.92 
 
 
1020 aa  560  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2429  copper-translocating P-type ATPase  48.26 
 
 
773 aa  560  1e-158  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  43.03 
 
 
855 aa  562  1e-158  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  42.43 
 
 
828 aa  560  1e-158  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  47.25 
 
 
804 aa  559  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4394  heavy metal translocating P-type ATPase  46.35 
 
 
715 aa  556  1e-157  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880078  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2356  hypothetical protein  46.03 
 
 
736 aa  557  1e-157  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  42.36 
 
 
836 aa  556  1e-157  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1533  heavy metal translocating P-type ATPase  48.51 
 
 
724 aa  556  1e-157  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  41.81 
 
 
759 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  41.81 
 
 
759 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3818  heavy metal translocating P-type ATPase  47.56 
 
 
895 aa  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4630  copper-translocating P-type ATPase  48.57 
 
 
801 aa  556  1e-157  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  43.93 
 
 
831 aa  558  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  42.76 
 
 
752 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  43.63 
 
 
840 aa  556  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  43.92 
 
 
837 aa  555  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4380  copper-translocating P-type ATPase  49.05 
 
 
818 aa  555  1e-156  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0177  heavy metal translocating P-type ATPase  49.13 
 
 
755 aa  555  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.963495  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>