More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3191 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00435  copper transporter  48.01 
 
 		 834 aa  665    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3126  copper-translocating P-type ATPase  48.01 
 
 		 834 aa  665    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3220  copper exporting ATPase  48.07 
 
 		 907 aa  693    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3818  copper-translocating P-type ATPase  50.33 
 
 		 747 aa  729    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.585028  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3132  copper exporting ATPase  47.47 
 
 		 834 aa  656    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.142794  hitchhiker  0.000000556714 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1689  cation transporter E1-E2 family ATPase  64.96 
 
 		 753 aa  980    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2772  copper-translocating P-type ATPase  65.45 
 
 		 757 aa  1002    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2846  copper-translocating P-type ATPase  65.96 
 
 		 744 aa  976    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.515584  hitchhiker  0.000113532 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3027  copper-translocating P-type ATPase  46.68 
 
 		 939 aa  672    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0545  copper exporting ATPase  47.07 
 
 		 833 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3165  copper exporting ATPase  47.33 
 
 		 961 aa  673    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.517155  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1408  copper-translocating P-type ATPase  66.89 
 
 		 744 aa  982    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.659936  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00395  Cation transport ATPase  51.08 
 
 		 747 aa  723    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1505  copper-translocating P-type ATPase  65.83 
 
 		 744 aa  975    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0477  copper-exporting ATPase  47.72 
 
 		 742 aa  689    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0527  copper exporting ATPase  47.74 
 
 		 834 aa  661    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0523  copper exporting ATPase  47.87 
 
 		 834 aa  662    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01268  cation transport ATPase  46.67 
 
 		 898 aa  684    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3027  copper exporting ATPase  47.27 
 
 		 955 aa  672    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00440  hypothetical protein  48.01 
 
 		 834 aa  665    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1485  copper-translocating P-type ATPase  75.13 
 
 		 752 aa  1129    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.391625 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1807  cation transporter E1-E2 family ATPase  46.82 
 
 		 915 aa  677    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0419  copper exporting ATPase  47.61 
 
 		 834 aa  657    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0270  copper-translocating P-type ATPase  51.13 
 
 		 748 aa  746    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0577  copper exporting ATPase  47.87 
 
 		 834 aa  665    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3006  copper-translocating P-type ATPase  47.29 
 
 		 850 aa  667    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40662  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1031  copper-translocating P-type ATPase  47.54 
 
 		 913 aa  665    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0606  copper exporting ATPase  47.61 
 
 		 833 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1499  copper-translocating P-type ATPase  65.96 
 
 		 744 aa  976    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2091  copper-translocating P-type ATPase  49.13 
 
 		 750 aa  733    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0552  copper exporting ATPase  47.61 
 
 		 833 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3191  copper-translocating P-type ATPase  100 
 
 		 760 aa  1532    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.427707  normal  0.767066 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1690  copper-translocating P-type ATPase  47.72 
 
 		 740 aa  691    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2587  copper-translocating P-type ATPase  65.71 
 
 		 758 aa  982    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0901243 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2654  copper-translocating P-type ATPase  65.58 
 
 		 758 aa  989    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1265  copper exporting ATPase  47.2 
 
 		 955 aa  670    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.057349 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0212  copper-translocating P-type ATPase  49.93 
 
 		 746 aa  711    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0962  copper exporting ATPase  46.12 
 
 		 832 aa  663    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.220688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0562  copper exporting ATPase  47.34 
 
 		 833 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.304776  normal  0.828863 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00355  Cation transport ATPase  50.33 
 
 		 782 aa  744    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4145  copper-translocating P-type ATPase  51.54 
 
 		 778 aa  732    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.418825  normal  0.147287 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2761  copper-translocating P-type ATPase  65.97 
 
 		 753 aa  994    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1097  copper exporting ATPase  47.49 
 
 		 907 aa  691    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1535  copper-translocating P-type ATPase  65.96 
 
 		 744 aa  971    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.639562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1381  copper-translocating P-type ATPase  50.93 
 
 		 844 aa  744    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004188  copper-translocating P-type ATPase  47.2 
 
 		 909 aa  683    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3789  copper-translocating P-type ATPase  48.29 
 
 		 860 aa  694    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2255  copper-translocating P-type ATPase  46.81 
 
 		 869 aa  674    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0547  copper exporting ATPase  47.61 
 
 		 833 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0563  copper exporting ATPase  47.47 
 
 		 834 aa  656    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0802  copper-transporting P-type ATPase  45.04 
 
 		 902 aa  621  1e-176  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2072  copper-translocating P-type ATPase  45.48 
 
 		 725 aa  592  1e-168  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  42.73 
 
 		 767 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  44.25 
 
 		 833 aa  576  1.0000000000000001e-163  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  42.22 
 
 		 827 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  42.73 
 
 		 762 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  42.6 
 
 		 762 aa  575  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  42.6 
 
 		 762 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  42.62 
 
 		 826 aa  573  1.0000000000000001e-162  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  42.73 
 
 		 762 aa  574  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  42.69 
 
 		 837 aa  572  1e-161  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  43.03 
 
 		 841 aa  570  1e-161  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  42.42 
 
 		 836 aa  568  1e-160  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  43.63 
 
 		 855 aa  567  1e-160  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  42.42 
 
 		 836 aa  568  1e-160  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  41.18 
 
 		 836 aa  562  1.0000000000000001e-159  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5724  heavy metal translocating P-type ATPase  42.27 
 
 		 839 aa  561  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.788276 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  42.67 
 
 		 836 aa  558  1e-157  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  43.7 
 
 		 818 aa  558  1e-157  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  42.2 
 
 		 833 aa  556  1e-157  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  46.55 
 
 		 795 aa  553  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  41.49 
 
 		 753 aa  549  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  41.93 
 
 		 750 aa  549  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  43.47 
 
 		 831 aa  547  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  43.43 
 
 		 837 aa  547  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1223  heavy metal translocating P-type ATPase  44.02 
 
 		 721 aa  547  1e-154  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1570  heavy metal translocating P-type ATPase  41.75 
 
 		 747 aa  546  1e-154  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.706467  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  41.95 
 
 		 835 aa  547  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2388  heavy-metal transporting P-type ATPase  41.82 
 
 		 819 aa  548  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168329  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 821 aa  548  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2667  heavy metal translocating P-type ATPase  47.09 
 
 		 846 aa  546  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  45.86 
 
 		 804 aa  547  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  40.69 
 
 		 826 aa  543  1e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9859  copper-translocating P-type ATPase  44.92 
 
 		 737 aa  542  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1533  heavy metal translocating P-type ATPase  48.38 
 
 		 724 aa  544  1e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  41.3 
 
 		 852 aa  543  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0212  copper-translocating P-type ATPase  40.66 
 
 		 759 aa  540  9.999999999999999e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  42.11 
 
 		 797 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  40.94 
 
 		 828 aa  539  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  41.36 
 
 		 827 aa  542  9.999999999999999e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2633  copper-translocating P-type ATPase  47.42 
 
 		 787 aa  539  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0966887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4380  copper-translocating P-type ATPase  46.71 
 
 		 818 aa  539  9.999999999999999e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21010  copper-translocating P-type ATPase  42.15 
 
 		 829 aa  541  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  45.33 
 
 		 823 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0713  heavy metal translocating P-type ATPase  45.16 
 
 		 872 aa  539  9.999999999999999e-153  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185288 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  41.24 
 
 		 797 aa  537  1e-151  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1712  cation transporting P-type ATPase  48.2 
 
 		 767 aa  536  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000183407  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  41.8 
 
 		 838 aa  535  1e-151  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2429  copper-translocating P-type ATPase  46.17 
 
 		 773 aa  536  1e-151  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  40.49 
 
 		 759 aa  538  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>