More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0837 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  85.51 
 
 
828 aa  1464    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2388  heavy-metal transporting P-type ATPase  43.61 
 
 
819 aa  644    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168329  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  45.17 
 
 
837 aa  696    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  44.73 
 
 
794 aa  675    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  46.51 
 
 
743 aa  667    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  46.33 
 
 
805 aa  708    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1686  heavy metal translocating P-type ATPase  42.21 
 
 
811 aa  635    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  43.17 
 
 
826 aa  648    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  47.32 
 
 
821 aa  718    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  43.26 
 
 
833 aa  654    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  45.05 
 
 
798 aa  674    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  45.97 
 
 
805 aa  686    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  45.84 
 
 
805 aa  682    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  45.97 
 
 
805 aa  687    Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  45.78 
 
 
797 aa  725    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  45.98 
 
 
806 aa  685    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  47.74 
 
 
837 aa  665    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  46.09 
 
 
805 aa  688    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  42.68 
 
 
840 aa  650    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  43.98 
 
 
954 aa  647    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  44.11 
 
 
833 aa  654    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  47.57 
 
 
836 aa  771    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  45.91 
 
 
753 aa  666    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  44.11 
 
 
826 aa  663    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  43.33 
 
 
796 aa  663    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1596  copper-translocating P-type ATPase  44.73 
 
 
834 aa  662    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  47.59 
 
 
831 aa  657    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1690  copper-translocating P-type ATPase  46.85 
 
 
740 aa  648    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  43.66 
 
 
802 aa  673    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  44.59 
 
 
841 aa  679    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  46.22 
 
 
806 aa  687    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  45.97 
 
 
805 aa  686    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  45.98 
 
 
806 aa  683    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2539  heavy metal translocating P-type ATPase  44.55 
 
 
838 aa  643    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.687698  normal  0.311305 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0477  copper-exporting ATPase  47.66 
 
 
742 aa  657    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  41.74 
 
 
857 aa  665    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  45.69 
 
 
837 aa  699    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  47 
 
 
759 aa  647    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  45.51 
 
 
798 aa  717    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  45.84 
 
 
805 aa  684    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2021  copper-translocating P-type ATPase  42.21 
 
 
811 aa  635    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  44.93 
 
 
797 aa  642    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  44.72 
 
 
849 aa  689    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  41.9 
 
 
885 aa  666    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  47.56 
 
 
750 aa  687    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  46.07 
 
 
752 aa  664    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  43.86 
 
 
818 aa  654    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  44.04 
 
 
942 aa  672    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  44.06 
 
 
827 aa  658    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  43.65 
 
 
841 aa  642    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  43.31 
 
 
852 aa  649    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00395  Cation transport ATPase  46.3 
 
 
747 aa  638    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  44.03 
 
 
894 aa  688    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  43.78 
 
 
835 aa  639    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  43.88 
 
 
838 aa  698    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  44.1 
 
 
836 aa  704    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  44.31 
 
 
833 aa  673    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  47 
 
 
759 aa  676    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  45.51 
 
 
815 aa  704    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  44.9 
 
 
826 aa  673    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0133  ATPase, P type cation/copper-transporter  52.58 
 
 
751 aa  739    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  46.01 
 
 
817 aa  743    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1876  heavy metal translocating P-type ATPase  47.51 
 
 
748 aa  640    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.972303  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  44.96 
 
 
855 aa  659    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  44.09 
 
 
889 aa  684    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  44.95 
 
 
889 aa  692    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  47.18 
 
 
758 aa  658    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  46.73 
 
 
803 aa  684    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_824  cation transport ATPase  87.92 
 
 
828 aa  1490    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  44.48 
 
 
799 aa  666    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  47 
 
 
759 aa  676    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5724  heavy metal translocating P-type ATPase  43.7 
 
 
839 aa  647    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.788276 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  47.31 
 
 
797 aa  711    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  44.59 
 
 
814 aa  695    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
828 aa  1670    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  45.29 
 
 
827 aa  695    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  46.6 
 
 
839 aa  717    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  46.66 
 
 
786 aa  671    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  44.5 
 
 
976 aa  637    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  45.05 
 
 
798 aa  674    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  44.75 
 
 
758 aa  635    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  43.66 
 
 
802 aa  673    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  44.47 
 
 
827 aa  662    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  45.9 
 
 
1087 aa  644    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  42.19 
 
 
836 aa  634  1e-180  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  42.19 
 
 
836 aa  634  1e-180  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1381  copper-translocating P-type ATPase  42.19 
 
 
844 aa  633  1e-180  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1570  heavy metal translocating P-type ATPase  45.2 
 
 
747 aa  629  1e-179  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.706467  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4145  copper-translocating P-type ATPase  46.12 
 
 
778 aa  631  1e-179  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.418825  normal  0.147287 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  45.3 
 
 
762 aa  628  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0212  copper-translocating P-type ATPase  45.01 
 
 
759 aa  627  1e-178  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3106  copper-translocating P-type ATPase  44.02 
 
 
742 aa  628  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.138352  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3243  heavy metal translocating P-type ATPase  42.72 
 
 
841 aa  622  1e-177  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  45.03 
 
 
762 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00355  Cation transport ATPase  44.77 
 
 
782 aa  624  1e-177  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  42.74 
 
 
837 aa  623  1e-177  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000289142  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0325  heavy metal translocating P-type ATPase  42.41 
 
 
821 aa  625  1e-177  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1899  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  44.9 
 
 
767 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  45.82 
 
 
1071 aa  622  1e-177  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21010  copper-translocating P-type ATPase  43.74 
 
 
829 aa  619  1e-176  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>