More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_824 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  85.14 
 
 		 828 aa  1462    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  42.84 
 
 		 794 aa  670    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  46.27 
 
 		 803 aa  700    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  45.52 
 
 		 805 aa  710    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  44.02 
 
 		 802 aa  677    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  41.15 
 
 		 826 aa  639    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  43.11 
 
 		 818 aa  660    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  45.53 
 
 		 798 aa  688    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  45.08 
 
 		 805 aa  685    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  45.04 
 
 		 805 aa  684    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  45.08 
 
 		 805 aa  686    Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  44.96 
 
 		 805 aa  684    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  43.51 
 
 		 833 aa  655    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  43.83 
 
 		 826 aa  659    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  44.71 
 
 		 954 aa  654    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  45.09 
 
 		 753 aa  655    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  44.81 
 
 		 752 aa  647    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  42.84 
 
 		 827 aa  643    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1596  copper-translocating P-type ATPase  44 
 
 		 834 aa  656    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3106  copper-translocating P-type ATPase  45.3 
 
 		 742 aa  641    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.138352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  45.43 
 
 		 797 aa  728    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  41.71 
 
 		 840 aa  655    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  45.08 
 
 		 805 aa  685    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  45.2 
 
 		 805 aa  688    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  44.14 
 
 		 827 aa  686    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  43.15 
 
 		 852 aa  637    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  40.52 
 
 		 857 aa  640    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  45.76 
 
 		 839 aa  714    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  44.13 
 
 		 758 aa  638    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  42.25 
 
 		 796 aa  669    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  45.6 
 
 		 759 aa  640    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  43.93 
 
 		 826 aa  663    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  44.15 
 
 		 849 aa  694    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  46.11 
 
 		 743 aa  664    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  44.31 
 
 		 837 aa  692    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  47.11 
 
 		 750 aa  685    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  44.93 
 
 		 806 aa  683    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  46.29 
 
 		 831 aa  647    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  43.28 
 
 		 942 aa  670    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0477  copper-exporting ATPase  45.65 
 
 		 742 aa  637    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  42.82 
 
 		 841 aa  642    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  45.21 
 
 		 815 aa  706    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  44.15 
 
 		 841 aa  666    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  87.92 
 
 		 828 aa  1490    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  44.7 
 
 		 806 aa  680    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  45.27 
 
 		 817 aa  732    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  43.12 
 
 		 894 aa  682    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  43.79 
 
 		 838 aa  700    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  43.61 
 
 		 836 aa  708    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  43.68 
 
 		 833 aa  662    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  46.11 
 
 		 837 aa  652    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_824  cation transport ATPase  100 
 
 		 828 aa  1672    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  45.45 
 
 		 798 aa  713    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  43.86 
 
 		 827 aa  655    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0133  ATPase, P type cation/copper-transporter  51.66 
 
 		 751 aa  727    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  45.88 
 
 		 759 aa  660    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  45.88 
 
 		 759 aa  660    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  44.47 
 
 		 855 aa  662    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  44.34 
 
 		 889 aa  698    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  44.34 
 
 		 889 aa  694    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  45.95 
 
 		 758 aa  649    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  43 
 
 		 833 aa  644    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  47.13 
 
 		 821 aa  729    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  45.53 
 
 		 798 aa  688    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  44.36 
 
 		 799 aa  671    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  44.34 
 
 		 814 aa  692    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  44.02 
 
 		 802 aa  677    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  45.05 
 
 		 806 aa  683    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  45.96 
 
 		 786 aa  671    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  44.69 
 
 		 976 aa  644    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  46.45 
 
 		 797 aa  716    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  45.08 
 
 		 837 aa  702    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  46.58 
 
 		 836 aa  772    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  41.57 
 
 		 885 aa  670    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  41.96 
 
 		 836 aa  632  1e-180  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  41.96 
 
 		 836 aa  632  1e-180  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3243  heavy metal translocating P-type ATPase  42.5 
 
 		 841 aa  633  1e-180  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  43.21 
 
 		 835 aa  633  1e-180  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2388  heavy-metal transporting P-type ATPase  42.81 
 
 		 819 aa  630  1e-179  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168329  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1690  copper-translocating P-type ATPase  45.11 
 
 		 740 aa  630  1e-179  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00395  Cation transport ATPase  45.54 
 
 		 747 aa  630  1e-179  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1686  heavy metal translocating P-type ATPase  41.92 
 
 		 811 aa  631  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2021  copper-translocating P-type ATPase  41.92 
 
 		 811 aa  631  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  45.02 
 
 		 1087 aa  629  1e-179  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5724  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 839 aa  629  1e-179  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.788276 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  41.94 
 
 		 837 aa  626  1e-178  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000289142  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  43.89 
 
 		 797 aa  627  1e-178  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1381  copper-translocating P-type ATPase  41.53 
 
 		 844 aa  628  1e-178  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2539  heavy metal translocating P-type ATPase  43.2 
 
 		 838 aa  627  1e-178  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.687698  normal  0.311305 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1570  heavy metal translocating P-type ATPase  44.47 
 
 		 747 aa  622  1e-177  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.706467  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0325  heavy metal translocating P-type ATPase  41.51 
 
 		 821 aa  625  1e-177  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  44.96 
 
 		 762 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  44.75 
 
 		 1071 aa  620  1e-176  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21010  copper-translocating P-type ATPase  43.08 
 
 		 829 aa  617  1e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1876  heavy metal translocating P-type ATPase  46.52 
 
 		 748 aa  619  1e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.972303  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  44.83 
 
 		 762 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  44.83 
 
 		 762 aa  613  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  44.69 
 
 		 767 aa  614  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0924  heavy metal translocating P-type ATPase  41.28 
 
 		 835 aa  613  9.999999999999999e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  44.83 
 
 		 762 aa  615  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>