More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3220 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00435  copper transporter  71.02 
 
 		 834 aa  1164    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3126  copper-translocating P-type ATPase  71.02 
 
 		 834 aa  1164    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0270  copper-translocating P-type ATPase  49.66 
 
 		 748 aa  721    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0545  copper exporting ATPase  70.42 
 
 		 833 aa  1159    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2072  copper-translocating P-type ATPase  49.04 
 
 		 725 aa  639    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1689  cation transporter E1-E2 family ATPase  49.27 
 
 		 753 aa  711    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00440  hypothetical protein  71.02 
 
 		 834 aa  1164    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00395  Cation transport ATPase  48.71 
 
 		 747 aa  707    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1265  copper exporting ATPase  69.71 
 
 		 955 aa  1328    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.057349 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3191  copper-translocating P-type ATPase  48.07 
 
 		 760 aa  693    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.427707  normal  0.767066 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0563  copper exporting ATPase  71.14 
 
 		 834 aa  1165    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3132  copper exporting ATPase  71.14 
 
 		 834 aa  1165    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.142794  hitchhiker  0.000000556714 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0577  copper exporting ATPase  71.14 
 
 		 834 aa  1170    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0527  copper exporting ATPase  70.9 
 
 		 834 aa  1168    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1097  copper exporting ATPase  92.28 
 
 		 907 aa  1697    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1535  copper-translocating P-type ATPase  50.27 
 
 		 744 aa  691    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.639562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0552  copper exporting ATPase  70.54 
 
 		 833 aa  1161    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3818  copper-translocating P-type ATPase  49.2 
 
 		 747 aa  707    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.585028  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0523  copper exporting ATPase  71.02 
 
 		 834 aa  1165    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0562  copper exporting ATPase  70.42 
 
 		 833 aa  1160    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.304776  normal  0.828863 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1690  copper-translocating P-type ATPase  48.83 
 
 		 740 aa  707    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3027  copper exporting ATPase  69.29 
 
 		 955 aa  1325    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1807  cation transporter E1-E2 family ATPase  48.83 
 
 		 915 aa  794    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1031  copper-translocating P-type ATPase  73.66 
 
 		 913 aa  1348    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3006  copper-translocating P-type ATPase  48.42 
 
 		 850 aa  720    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40662  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2772  copper-translocating P-type ATPase  50.07 
 
 		 757 aa  707    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0962  copper exporting ATPase  70.3 
 
 		 832 aa  1181    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.220688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3027  copper-translocating P-type ATPase  72.96 
 
 		 939 aa  1354    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004188  copper-translocating P-type ATPase  47.49 
 
 		 909 aa  796    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1408  copper-translocating P-type ATPase  49.66 
 
 		 744 aa  685    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.659936  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2255  copper-translocating P-type ATPase  46.89 
 
 		 869 aa  723    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01268  cation transport ATPase  48.19 
 
 		 898 aa  822    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2091  copper-translocating P-type ATPase  50.81 
 
 		 750 aa  733    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0802  copper-transporting P-type ATPase  46.86 
 
 		 902 aa  810    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2846  copper-translocating P-type ATPase  50.54 
 
 		 744 aa  695    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.515584  hitchhiker  0.000113532 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2587  copper-translocating P-type ATPase  48.87 
 
 		 758 aa  704    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0901243 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2654  copper-translocating P-type ATPase  49.27 
 
 		 758 aa  710    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0212  copper-translocating P-type ATPase  48.99 
 
 		 746 aa  696    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0606  copper exporting ATPase  70.54 
 
 		 833 aa  1161    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0547  copper exporting ATPase  70.54 
 
 		 833 aa  1160    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00355  Cation transport ATPase  50.8 
 
 		 782 aa  749    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1505  copper-translocating P-type ATPase  50.27 
 
 		 744 aa  689    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4145  copper-translocating P-type ATPase  50.81 
 
 		 778 aa  753    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.418825  normal  0.147287 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3220  copper exporting ATPase  100 
 
 		 907 aa  1828    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2761  copper-translocating P-type ATPase  48.94 
 
 		 753 aa  706    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0477  copper-exporting ATPase  49.11 
 
 		 742 aa  709    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1499  copper-translocating P-type ATPase  50.34 
 
 		 744 aa  695    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1381  copper-translocating P-type ATPase  46.16 
 
 		 844 aa  760    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3165  copper exporting ATPase  69.48 
 
 		 961 aa  1332    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.517155  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3789  copper-translocating P-type ATPase  49.11 
 
 		 860 aa  771    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0419  copper exporting ATPase  71.26 
 
 		 834 aa  1172    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1485  copper-translocating P-type ATPase  49.73 
 
 		 752 aa  681    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.391625 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  41.75 
 
 		 835 aa  626  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  41.35 
 
 		 837 aa  619  1e-176  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  42.92 
 
 		 826 aa  619  1e-176  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  40.98 
 
 		 852 aa  608  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  42.3 
 
 		 839 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  40.16 
 
 		 827 aa  590  1e-167  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  39.58 
 
 		 833 aa  587  1e-166  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  40.16 
 
 		 836 aa  588  1e-166  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  40.14 
 
 		 855 aa  587  1e-166  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  41.5 
 
 		 827 aa  588  1e-166  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  39.81 
 
 		 833 aa  584  1.0000000000000001e-165  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  40.3 
 
 		 837 aa  585  1.0000000000000001e-165  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  39.81 
 
 		 827 aa  581  1e-164  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  39.27 
 
 		 841 aa  581  1e-164  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_824  cation transport ATPase  39.65 
 
 		 828 aa  579  1e-164  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  39.65 
 
 		 836 aa  581  1e-164  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  39.24 
 
 		 826 aa  572  1.0000000000000001e-162  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  39.75 
 
 		 840 aa  575  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  42.28 
 
 		 762 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1596  copper-translocating P-type ATPase  40.85 
 
 		 834 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  42.28 
 
 		 762 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  42.42 
 
 		 762 aa  575  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  41.12 
 
 		 836 aa  575  1.0000000000000001e-162  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  41.12 
 
 		 836 aa  575  1.0000000000000001e-162  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  43.82 
 
 		 814 aa  574  1.0000000000000001e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  39.17 
 
 		 828 aa  569  1e-161  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  42.28 
 
 		 767 aa  572  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  42.15 
 
 		 762 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  40.26 
 
 		 838 aa  566  1e-160  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2080  heavy metal translocating P-type ATPase  39.55 
 
 		 814 aa  567  1e-160  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0351429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  38.66 
 
 		 797 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  39.02 
 
 		 818 aa  565  1.0000000000000001e-159  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2388  heavy-metal transporting P-type ATPase  39.53 
 
 		 819 aa  563  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168329  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1570  heavy metal translocating P-type ATPase  44.92 
 
 		 747 aa  565  1.0000000000000001e-159  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.706467  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  39.58 
 
 		 826 aa  564  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2667  heavy metal translocating P-type ATPase  45.6 
 
 		 846 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0325  heavy metal translocating P-type ATPase  40.24 
 
 		 821 aa  564  1.0000000000000001e-159  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  39.33 
 
 		 828 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1313  heavy metal translocating P-type ATPase  40.32 
 
 		 868 aa  562  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000605467  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3243  heavy metal translocating P-type ATPase  40.09 
 
 		 841 aa  562  1e-158  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5724  heavy metal translocating P-type ATPase  39.63 
 
 		 839 aa  560  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.788276 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  39.58 
 
 		 805 aa  559  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  38.26 
 
 		 841 aa  558  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3067  heavy metal translocating P-type ATPase  39.65 
 
 		 824 aa  557  1e-157  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  42.77 
 
 		 831 aa  556  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  34.64 
 
 		 889 aa  556  1e-157  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0212  copper-translocating P-type ATPase  41.34 
 
 		 759 aa  553  1e-156  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2020  heavy metal translocating P-type ATPase  45.29 
 
 		 809 aa  555  1e-156  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>