More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0562 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00435  copper transporter  93.16 
 
 
834 aa  1522    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3126  copper-translocating P-type ATPase  93.16 
 
 
834 aa  1522    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3132  copper exporting ATPase  92.92 
 
 
834 aa  1516    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.142794  hitchhiker  0.000000556714 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2072  copper-translocating P-type ATPase  50 
 
 
725 aa  649    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0962  copper exporting ATPase  86.18 
 
 
832 aa  1463    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.220688  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1689  cation transporter E1-E2 family ATPase  50.67 
 
 
753 aa  705    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2255  copper-translocating P-type ATPase  45.66 
 
 
869 aa  706    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1535  copper-translocating P-type ATPase  51.55 
 
 
744 aa  704    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.639562  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01268  cation transport ATPase  49.7 
 
 
898 aa  798    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1485  copper-translocating P-type ATPase  48.59 
 
 
752 aa  663    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.391625 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0802  copper-transporting P-type ATPase  50.89 
 
 
902 aa  835    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0527  copper exporting ATPase  93.4 
 
 
834 aa  1524    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0562  copper exporting ATPase  100 
 
 
833 aa  1683    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.304776  normal  0.828863 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1031  copper-translocating P-type ATPase  67.86 
 
 
913 aa  1137    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  43.53 
 
 
835 aa  637    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3165  copper exporting ATPase  67.19 
 
 
961 aa  1179    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.517155  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1265  copper exporting ATPase  67.31 
 
 
955 aa  1182    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.057349 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0545  copper exporting ATPase  99.76 
 
 
833 aa  1679    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0552  copper exporting ATPase  99.88 
 
 
833 aa  1683    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0563  copper exporting ATPase  92.92 
 
 
834 aa  1516    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1505  copper-translocating P-type ATPase  51.82 
 
 
744 aa  709    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1807  cation transporter E1-E2 family ATPase  50.48 
 
 
915 aa  771    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0547  copper exporting ATPase  99.76 
 
 
833 aa  1680    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00395  Cation transport ATPase  51.48 
 
 
747 aa  742    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004188  copper-translocating P-type ATPase  49.65 
 
 
909 aa  799    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1499  copper-translocating P-type ATPase  51.82 
 
 
744 aa  706    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2772  copper-translocating P-type ATPase  48.87 
 
 
757 aa  706    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00355  Cation transport ATPase  50.78 
 
 
782 aa  758    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3006  copper-translocating P-type ATPase  49.52 
 
 
850 aa  738    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40662  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3191  copper-translocating P-type ATPase  47.47 
 
 
760 aa  675    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.427707  normal  0.767066 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3818  copper-translocating P-type ATPase  50.13 
 
 
747 aa  707    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.585028  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0577  copper exporting ATPase  92.8 
 
 
834 aa  1518    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3027  copper-translocating P-type ATPase  68.13 
 
 
939 aa  1154    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0477  copper-exporting ATPase  48.15 
 
 
742 aa  706    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0606  copper exporting ATPase  99.76 
 
 
833 aa  1679    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2091  copper-translocating P-type ATPase  51.01 
 
 
750 aa  743    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1408  copper-translocating P-type ATPase  50.74 
 
 
744 aa  692    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.659936  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2846  copper-translocating P-type ATPase  51.96 
 
 
744 aa  710    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.515584  hitchhiker  0.000113532 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0419  copper exporting ATPase  92.92 
 
 
834 aa  1518    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2587  copper-translocating P-type ATPase  50.99 
 
 
758 aa  712    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0901243 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2654  copper-translocating P-type ATPase  51.26 
 
 
758 aa  713    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0212  copper-translocating P-type ATPase  50.94 
 
 
746 aa  721    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1690  copper-translocating P-type ATPase  48.15 
 
 
740 aa  706    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0523  copper exporting ATPase  93.04 
 
 
834 aa  1518    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3027  copper exporting ATPase  66.93 
 
 
955 aa  1172    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4145  copper-translocating P-type ATPase  52.16 
 
 
778 aa  756    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.418825  normal  0.147287 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2761  copper-translocating P-type ATPase  50.8 
 
 
753 aa  709    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1097  copper exporting ATPase  71.17 
 
 
907 aa  1194    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0270  copper-translocating P-type ATPase  50.81 
 
 
748 aa  731    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1381  copper-translocating P-type ATPase  47.82 
 
 
844 aa  782    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3220  copper exporting ATPase  70.42 
 
 
907 aa  1179    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3789  copper-translocating P-type ATPase  49.82 
 
 
860 aa  766    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  42.72 
 
 
837 aa  651    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00440  hypothetical protein  93.16 
 
 
834 aa  1522    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  42.59 
 
 
827 aa  634  1e-180  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 
826 aa  628  1e-178  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  42.36 
 
 
852 aa  624  1e-177  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  42 
 
 
841 aa  620  1e-176  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  42.69 
 
 
839 aa  619  1e-175  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  42.09 
 
 
827 aa  610  1e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  40.68 
 
 
836 aa  608  1e-173  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  42.06 
 
 
855 aa  610  1e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  41.33 
 
 
833 aa  612  1e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  40.95 
 
 
833 aa  608  9.999999999999999e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  40.87 
 
 
827 aa  607  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  42.72 
 
 
836 aa  606  9.999999999999999e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  42.72 
 
 
836 aa  606  9.999999999999999e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  42.14 
 
 
826 aa  601  1e-170  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5724  heavy metal translocating P-type ATPase  42.13 
 
 
839 aa  601  1e-170  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.788276 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  40.96 
 
 
840 aa  597  1e-169  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1596  copper-translocating P-type ATPase  41.53 
 
 
834 aa  596  1e-169  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  41.49 
 
 
836 aa  597  1e-169  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  43.41 
 
 
767 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  43.28 
 
 
762 aa  595  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  43.41 
 
 
762 aa  594  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  43.55 
 
 
762 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  41 
 
 
837 aa  595  1e-168  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3243  heavy metal translocating P-type ATPase  42.64 
 
 
841 aa  594  1e-168  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2388  heavy-metal transporting P-type ATPase  40.87 
 
 
819 aa  593  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168329  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  43.28 
 
 
762 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  41.04 
 
 
841 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2080  heavy metal translocating P-type ATPase  40.8 
 
 
814 aa  589  1e-167  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0351429  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3067  heavy metal translocating P-type ATPase  41.52 
 
 
824 aa  589  1e-167  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  40.73 
 
 
826 aa  592  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  43.56 
 
 
786 aa  590  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  40.49 
 
 
838 aa  587  1e-166  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  42.02 
 
 
814 aa  588  1e-166  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  38.31 
 
 
818 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0986  heavy metal translocating P-type ATPase  46.39 
 
 
810 aa  580  1e-164  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  42.69 
 
 
831 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  41.44 
 
 
837 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000289142  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  43.49 
 
 
837 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0212  copper-translocating P-type ATPase  43.87 
 
 
759 aa  576  1.0000000000000001e-163  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  40.89 
 
 
833 aa  576  1.0000000000000001e-163  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0264  heavy metal translocating P-type ATPase  47.27 
 
 
815 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3420  heavy metal translocating P-type ATPase  47.27 
 
 
815 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21010  copper-translocating P-type ATPase  40.61 
 
 
829 aa  572  1.0000000000000001e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4302  heavy metal translocating P-type ATPase  47.12 
 
 
815 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2020  heavy metal translocating P-type ATPase  46.42 
 
 
809 aa  572  1.0000000000000001e-162  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4911  heavy metal translocating P-type ATPase  47.94 
 
 
793 aa  571  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>