More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1546 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  46.41 
 
 
794 aa  646    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  46.8 
 
 
867 aa  664    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0385  copper-transporter ATPase CopA  57.7 
 
 
744 aa  878    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  45.65 
 
 
798 aa  640    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  47.39 
 
 
839 aa  691    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3067  heavy metal translocating P-type ATPase  46.27 
 
 
824 aa  694    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  44.16 
 
 
753 aa  638    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  48.33 
 
 
836 aa  683    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1313  heavy metal translocating P-type ATPase  47.02 
 
 
868 aa  693    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000605467  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  45.78 
 
 
798 aa  657    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  49.8 
 
 
894 aa  737    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3170  heavy metal translocating P-type ATPase  46.19 
 
 
936 aa  654    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158229 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01260  copper/silver-translocating P-type ATPase  45.68 
 
 
905 aa  653    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  50.67 
 
 
837 aa  724    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000289142  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  51.15 
 
 
818 aa  770    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  47.63 
 
 
797 aa  659    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  45.53 
 
 
827 aa  645    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  47.04 
 
 
815 aa  640    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  52.44 
 
 
889 aa  785    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  53.25 
 
 
889 aa  790    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  48.03 
 
 
758 aa  711    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1546  cation transport ATPase  100 
 
 
742 aa  1511    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3877  copper-translocating P-type ATPase  48.09 
 
 
760 aa  687    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00336349  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  45.11 
 
 
905 aa  668    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  46.7 
 
 
797 aa  672    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  45.65 
 
 
798 aa  640    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  46.63 
 
 
743 aa  650    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  45.76 
 
 
836 aa  632  1e-180  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  44.69 
 
 
752 aa  634  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11220  copper/silver-translocating P-type ATPase  43.42 
 
 
925 aa  629  1e-179  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.363514 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  46.42 
 
 
838 aa  626  1e-178  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6890  copper-translocating P-type ATPase  43.26 
 
 
754 aa  625  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  46.21 
 
 
803 aa  620  1e-176  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  44 
 
 
805 aa  621  1e-176  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  45.2 
 
 
802 aa  619  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  45.2 
 
 
802 aa  619  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0008  copper-translocating P-type ATPase  44.12 
 
 
891 aa  616  1e-175  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  45.2 
 
 
806 aa  615  1e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  46.02 
 
 
821 aa  617  1e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  43.88 
 
 
837 aa  617  1e-175  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  43.65 
 
 
826 aa  613  9.999999999999999e-175  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  43.97 
 
 
796 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  45.38 
 
 
817 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  45.07 
 
 
806 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3058  copper-translocating P-type ATPase  43.59 
 
 
740 aa  610  1e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1233  hypothetical protein  45.1 
 
 
810 aa  610  1e-173  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  44.46 
 
 
805 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  44.46 
 
 
805 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  44.53 
 
 
762 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  44.84 
 
 
942 aa  607  9.999999999999999e-173  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  44.34 
 
 
750 aa  606  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  44.53 
 
 
762 aa  605  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  44.46 
 
 
805 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  44.4 
 
 
762 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  44.42 
 
 
759 aa  604  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  44.46 
 
 
805 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  44.33 
 
 
805 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  44.27 
 
 
767 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  44.24 
 
 
814 aa  603  1.0000000000000001e-171  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  44.33 
 
 
805 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1876  heavy metal translocating P-type ATPase  43.85 
 
 
789 aa  605  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  44.42 
 
 
759 aa  604  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  44.27 
 
 
806 aa  602  1e-170  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1553  heavy metal translocating P-type ATPase  45.82 
 
 
859 aa  602  1e-170  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.534956  normal  0.0124284 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  44.27 
 
 
762 aa  601  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  46.35 
 
 
833 aa  600  1e-170  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  43.18 
 
 
828 aa  597  1e-169  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  43.65 
 
 
833 aa  598  1e-169  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1570  heavy metal translocating P-type ATPase  42.65 
 
 
747 aa  595  1e-168  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.706467  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  44.59 
 
 
839 aa  595  1e-168  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  43.35 
 
 
758 aa  592  1e-168  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  44 
 
 
827 aa  594  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00260  putative copper transport-related membrane protein  44.1 
 
 
741 aa  589  1e-167  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.348825  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  43.03 
 
 
837 aa  589  1e-167  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3106  copper-translocating P-type ATPase  43.69 
 
 
742 aa  589  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.138352  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  45.6 
 
 
799 aa  591  1e-167  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  43.79 
 
 
833 aa  588  1e-166  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  42.86 
 
 
826 aa  586  1e-166  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  43.94 
 
 
954 aa  586  1e-166  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6644  copper-translocating P-type ATPase  41.49 
 
 
753 aa  588  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.935468  normal  0.257295 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  42.58 
 
 
828 aa  586  1e-166  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  44.14 
 
 
837 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_824  cation transport ATPase  41.47 
 
 
828 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0212  copper-translocating P-type ATPase  42.99 
 
 
759 aa  583  1.0000000000000001e-165  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  42.63 
 
 
840 aa  582  1.0000000000000001e-165  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2080  heavy metal translocating P-type ATPase  41.6 
 
 
814 aa  585  1.0000000000000001e-165  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0351429  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  44.11 
 
 
831 aa  585  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  42.13 
 
 
836 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  43.05 
 
 
841 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  43.27 
 
 
786 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  42.13 
 
 
836 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  41.88 
 
 
885 aa  581  1e-164  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  43.83 
 
 
827 aa  579  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1596  copper-translocating P-type ATPase  42.4 
 
 
834 aa  580  1e-164  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2925  heavy metal translocating P-type ATPase  41.7 
 
 
767 aa  581  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  42.37 
 
 
976 aa  578  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  43.11 
 
 
852 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  43.24 
 
 
841 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  44.02 
 
 
849 aa  578  1.0000000000000001e-163  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4950  copper-translocating P-type ATPase  44.2 
 
 
748 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.113213 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>