More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2454 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  47.6 
 
 
837 aa  688    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  45.3 
 
 
803 aa  649    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  42.86 
 
 
828 aa  669    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  55.67 
 
 
1020 aa  646    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  46.75 
 
 
821 aa  677    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  51.04 
 
 
759 aa  642    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  48.12 
 
 
833 aa  658    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  43.47 
 
 
805 aa  654    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  46.27 
 
 
826 aa  653    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2679  heavy metal translocating P-type ATPase  46.34 
 
 
857 aa  655    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.668216 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  43.19 
 
 
805 aa  635    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3584  copper-translocating P-type ATPase  51.74 
 
 
805 aa  674    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  43.31 
 
 
805 aa  636    Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1596  hypothetical protein  51.6 
 
 
735 aa  660    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2356  hypothetical protein  54.1 
 
 
736 aa  668    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1397  hypothetical protein  51.45 
 
 
735 aa  669    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1587  copper/silver efflux P-type ATPase  50.73 
 
 
814 aa  659    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.602341  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0177  heavy metal translocating P-type ATPase  56.43 
 
 
755 aa  684    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.963495  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4394  heavy metal translocating P-type ATPase  54.9 
 
 
715 aa  662    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880078  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  55.47 
 
 
795 aa  689    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0911  heavy metal translocating P-type ATPase  56.25 
 
 
831 aa  658    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  48.83 
 
 
753 aa  742    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1533  heavy metal translocating P-type ATPase  53.13 
 
 
724 aa  655    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0264  heavy metal translocating P-type ATPase  54.09 
 
 
815 aa  685    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  45 
 
 
827 aa  640    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  54.75 
 
 
831 aa  721    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1712  cation transporting P-type ATPase  54.93 
 
 
767 aa  690    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000183407  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0446  heavy metal translocating P-type ATPase  52.75 
 
 
826 aa  635    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0713  heavy metal translocating P-type ATPase  51.11 
 
 
872 aa  658    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0185288 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5724  heavy metal translocating P-type ATPase  47.62 
 
 
839 aa  665    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.788276 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2110  heavy metal translocating P-type ATPase  48.5 
 
 
776 aa  646    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  43.19 
 
 
805 aa  635    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1223  heavy metal translocating P-type ATPase  47.01 
 
 
721 aa  640    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1570  heavy metal translocating P-type ATPase  53.18 
 
 
747 aa  672    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.706467  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4911  heavy metal translocating P-type ATPase  55.44 
 
 
793 aa  663    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2633  copper-translocating P-type ATPase  54.12 
 
 
787 aa  649    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0966887  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  45.16 
 
 
857 aa  665    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3496  copper-translocating P-type ATPase  51.23 
 
 
805 aa  659    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3871  heavy metal translocating P-type ATPase  54.92 
 
 
908 aa  643    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  45.58 
 
 
885 aa  658    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3603  heavy metal translocating P-type ATPase  52.05 
 
 
781 aa  646    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.385449 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  50.59 
 
 
840 aa  715    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0418  heavy metal translocating P-type ATPase  52.71 
 
 
816 aa  643    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1144  heavy metal translocating P-type ATPase  51.5 
 
 
851 aa  636    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0307276  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1935  copper-translocating P-type ATPase  50.76 
 
 
822 aa  654    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3818  heavy metal translocating P-type ATPase  53.71 
 
 
895 aa  637    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2554  heavy metal translocating P-type ATPase  56.28 
 
 
786 aa  668    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00876306 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4834  heavy metal translocating P-type ATPase  54.16 
 
 
796 aa  644    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.311359  normal  0.100077 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  43.23 
 
 
828 aa  668    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  44.09 
 
 
942 aa  638    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1480  heavy metal translocating P-type ATPase  54.16 
 
 
811 aa  652    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  43.29 
 
 
806 aa  637    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4380  copper-translocating P-type ATPase  55.99 
 
 
818 aa  681    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4630  copper-translocating P-type ATPase  55.84 
 
 
801 aa  680    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3504  heavy metal translocating P-type ATPase  54.41 
 
 
743 aa  649    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3434  heavy metal translocating P-type ATPase  56.4 
 
 
833 aa  657    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1777  heavy metal translocating P-type ATPase  51.93 
 
 
814 aa  662    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0428003 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1072  heavy metal translocating P-type ATPase  55.22 
 
 
755 aa  650    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2214  heavy metal translocating P-type ATPase  53.46 
 
 
846 aa  654    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563688  normal  0.39359 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  47.58 
 
 
838 aa  671    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  47.65 
 
 
836 aa  697    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  48.13 
 
 
833 aa  662    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2080  heavy metal translocating P-type ATPase  50.06 
 
 
814 aa  692    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0351429  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2429  copper-translocating P-type ATPase  54.17 
 
 
773 aa  643    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  49.21 
 
 
836 aa  677    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2544  heavy metal translocating P-type ATPase  56.06 
 
 
787 aa  657    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.874956  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0133  ATPase, P type cation/copper-transporter  58.14 
 
 
751 aa  651    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3941  heavy metal translocating P-type ATPase  52.05 
 
 
781 aa  646    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2667  heavy metal translocating P-type ATPase  54.02 
 
 
846 aa  666    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  48.91 
 
 
855 aa  673    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  47.2 
 
 
827 aa  656    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  40.56 
 
 
889 aa  643    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  40.56 
 
 
889 aa  642    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  49.37 
 
 
758 aa  676    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0325  heavy metal translocating P-type ATPase  48.72 
 
 
821 aa  644    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1899  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  55.18 
 
 
804 aa  673    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1856  heavy metal translocating P-type ATPase  54.95 
 
 
973 aa  654    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.121057  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0180  copper-translocating P-type ATPase  52.04 
 
 
801 aa  643    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1259  heavy metal translocating P-type ATPase  49.34 
 
 
834 aa  652    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.499676  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  42.3 
 
 
796 aa  637    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  49.88 
 
 
814 aa  707    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2345  heavy metal translocating P-type ATPase  53.28 
 
 
831 aa  639    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.541257 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4302  heavy metal translocating P-type ATPase  53.79 
 
 
815 aa  683    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0191  heavy metal translocating P-type ATPase  40.26 
 
 
837 aa  642    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.562672  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  56.46 
 
 
786 aa  735    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  41.94 
 
 
802 aa  639    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  41.81 
 
 
797 aa  639    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1849  heavy metal translocating P-type ATPase  52.73 
 
 
762 aa  647    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191422  hitchhiker  0.000000000440646 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  41.94 
 
 
802 aa  639    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1381  copper-translocating P-type ATPase  41.59 
 
 
844 aa  660    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2020  heavy metal translocating P-type ATPase  51.56 
 
 
809 aa  656    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0131  copper-translocating P-type ATPase  53.39 
 
 
786 aa  639    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0671969  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  50.79 
 
 
836 aa  726    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3420  heavy metal translocating P-type ATPase  54.09 
 
 
815 aa  685    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4547  heavy metal translocating P-type ATPase  52.26 
 
 
798 aa  642    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.291191  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1258  heavy metal translocating P-type ATPase  52.71 
 
 
778 aa  637    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123345  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  48.68 
 
 
852 aa  676    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  47.69 
 
 
833 aa  660    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1469  heavy metal translocating P-type ATPase  51.81 
 
 
777 aa  640    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  49.21 
 
 
836 aa  677    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>