More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3434 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2307  copper-translocating P-type ATPase  66.92 
 
 
783 aa  1031    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3504  heavy metal translocating P-type ATPase  70.1 
 
 
743 aa  963    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2633  copper-translocating P-type ATPase  68.98 
 
 
787 aa  1064    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0966887  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0206  copper-transporting P-type ATPase  74.41 
 
 
821 aa  1107    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4394  heavy metal translocating P-type ATPase  62.23 
 
 
715 aa  815    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880078  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  51.99 
 
 
752 aa  655    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2554  heavy metal translocating P-type ATPase  65.05 
 
 
786 aa  1004    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00876306 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4834  heavy metal translocating P-type ATPase  68.98 
 
 
796 aa  1044    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.311359  normal  0.100077 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0311  copper-translocating P-type ATPase  54.05 
 
 
842 aa  801    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2345  heavy metal translocating P-type ATPase  59.94 
 
 
831 aa  816    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.541257 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0030  copper-translocating P-type ATPase  56.61 
 
 
791 aa  838    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000836932 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1804  heavy metal translocating P-type ATPase  57.74 
 
 
806 aa  809    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.75515 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3368  copper-translocating P-type ATPase  56.88 
 
 
768 aa  793    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1596  hypothetical protein  62.2 
 
 
735 aa  917    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2356  hypothetical protein  61.89 
 
 
736 aa  919    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1397  hypothetical protein  62.82 
 
 
735 aa  926    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1587  copper/silver efflux P-type ATPase  58.03 
 
 
814 aa  872    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.602341  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2267  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  57.01 
 
 
772 aa  852    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.270801  normal  0.567344 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0385  heavy metal translocating P-type ATPase  66.3 
 
 
729 aa  904    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.530219  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7880  heavy metal translocating P-type ATPase  67.22 
 
 
788 aa  1047    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862817  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0911  heavy metal translocating P-type ATPase  83.85 
 
 
831 aa  1355    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  49.49 
 
 
753 aa  640    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0506  copper-translocating P-type ATPase  55.79 
 
 
807 aa  812    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1533  heavy metal translocating P-type ATPase  64.91 
 
 
724 aa  919    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2054  copper-translocating P-type ATPase  54.9 
 
 
842 aa  819    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860111  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9859  copper-translocating P-type ATPase  70.6 
 
 
737 aa  1013    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1712  cation transporting P-type ATPase  60.86 
 
 
767 aa  936    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000183407  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2599  heavy metal translocating P-type ATPase  60.7 
 
 
836 aa  858    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.283973 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2110  heavy metal translocating P-type ATPase  55.81 
 
 
776 aa  863    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  73.38 
 
 
804 aa  1196    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1223  heavy metal translocating P-type ATPase  55.38 
 
 
721 aa  826    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2191  heavy metal translocating P-type ATPase  57.83 
 
 
780 aa  811    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2005  heavy metal translocating P-type ATPase  54.74 
 
 
753 aa  750    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0713  heavy metal translocating P-type ATPase  55.12 
 
 
872 aa  884    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0185288 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0283  copper-translocating P-type ATPase  56.65 
 
 
807 aa  823    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.572876  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3941  heavy metal translocating P-type ATPase  59.55 
 
 
781 aa  848    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3871  heavy metal translocating P-type ATPase  75.16 
 
 
908 aa  1126    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2142  heavy metal translocating P-type ATPase  67.26 
 
 
781 aa  1026    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000033244  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2153  heavy metal translocating P-type ATPase  68.34 
 
 
724 aa  944    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00626662  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0418  heavy metal translocating P-type ATPase  58.6 
 
 
816 aa  882    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1144  heavy metal translocating P-type ATPase  59.74 
 
 
851 aa  838    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0307276  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1935  copper-translocating P-type ATPase  53.13 
 
 
822 aa  858    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3818  heavy metal translocating P-type ATPase  72.49 
 
 
895 aa  1173    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1178  heavy metal translocating P-type ATPase  57.2 
 
 
796 aa  867    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2964  copper-translocating P-type ATPase  57.94 
 
 
753 aa  787    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0264  heavy metal translocating P-type ATPase  61.27 
 
 
815 aa  963    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1480  heavy metal translocating P-type ATPase  73.28 
 
 
811 aa  1168    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4609  heavy metal translocating P-type ATPase  57.76 
 
 
786 aa  866    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4380  copper-translocating P-type ATPase  76.47 
 
 
818 aa  1291    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4630  copper-translocating P-type ATPase  77.97 
 
 
801 aa  1285    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0029  copper-translocating P-type ATPase  56.61 
 
 
795 aa  838    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.747408  normal  0.269109 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3434  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
833 aa  1678    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1777  heavy metal translocating P-type ATPase  58.26 
 
 
814 aa  872    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0428003 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6119  copper efflux ATPase CopF  58.48 
 
 
805 aa  848    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.161419  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2214  heavy metal translocating P-type ATPase  57.21 
 
 
846 aa  889    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563688  normal  0.39359 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  69.62 
 
 
1020 aa  1042    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3074  heavy metal translocating P-type ATPase  52.2 
 
 
845 aa  732    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0031  copper-translocating P-type ATPase  56.61 
 
 
838 aa  839    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0708  heavy metal translocating P-type ATPase  58.82 
 
 
736 aa  798    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1849  heavy metal translocating P-type ATPase  56.88 
 
 
762 aa  800    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191422  hitchhiker  0.000000000440646 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2429  copper-translocating P-type ATPase  67.99 
 
 
773 aa  1058    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2453  heavy metal translocating P-type ATPase  68.14 
 
 
765 aa  1019    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2544  heavy metal translocating P-type ATPase  67.59 
 
 
787 aa  1049    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.874956  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3603  heavy metal translocating P-type ATPase  59.55 
 
 
781 aa  848    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.385449 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1072  heavy metal translocating P-type ATPase  73.52 
 
 
755 aa  1110    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2667  heavy metal translocating P-type ATPase  55.45 
 
 
846 aa  914    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1856  heavy metal translocating P-type ATPase  76.66 
 
 
973 aa  1164    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.121057  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  69.48 
 
 
795 aa  1112    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5360  heavy metal translocating P-type ATPase  57.56 
 
 
797 aa  810    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.647165  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  57.97 
 
 
746 aa  778    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3972  heavy metal translocating P-type ATPase  57.97 
 
 
782 aa  871    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16922  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4100  heavy metal translocating P-type ATPase  60.89 
 
 
785 aa  838    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0322653  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3091  copper-translocating P-type ATPase  68.1 
 
 
868 aa  973    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344658  normal  0.403922 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  67.36 
 
 
823 aa  1083    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  52.12 
 
 
840 aa  637    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0324  copper-translocating P-type ATPase  54.78 
 
 
842 aa  816    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245948  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0180  copper-translocating P-type ATPase  57.69 
 
 
801 aa  926    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0446  heavy metal translocating P-type ATPase  58.42 
 
 
826 aa  866    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1836  heavy metal translocating P-type ATPase  64.77 
 
 
794 aa  964    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4302  heavy metal translocating P-type ATPase  61.15 
 
 
815 aa  962    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4911  heavy metal translocating P-type ATPase  68.94 
 
 
793 aa  1060    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1000  heavy metal translocating P-type ATPase  67.33 
 
 
809 aa  1053    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.111426 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4130  copper-translocating P-type ATPase  67.35 
 
 
799 aa  1028    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2229  copper-translocating P-type ATPase  55.6 
 
 
787 aa  843    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.76869  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1098  copper-translocating P-type ATPase  69.62 
 
 
806 aa  1070    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0763477  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2020  heavy metal translocating P-type ATPase  57.71 
 
 
809 aa  899    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0131  copper-translocating P-type ATPase  67.28 
 
 
786 aa  1013    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0671969  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0148  heavy metal translocating P-type ATPase  57.77 
 
 
730 aa  744    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3420  heavy metal translocating P-type ATPase  61.27 
 
 
815 aa  963    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1645  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  57.41 
 
 
744 aa  808    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.321264 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2230  copper-translocating P-type ATPase  54.9 
 
 
842 aa  819    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4547  heavy metal translocating P-type ATPase  58.75 
 
 
798 aa  890    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.291191  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1258  heavy metal translocating P-type ATPase  58.11 
 
 
778 aa  878    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123345  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6008  heavy metal translocating P-type ATPase  58.31 
 
 
841 aa  889    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903237  normal  0.0729123 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1469  heavy metal translocating P-type ATPase  56.99 
 
 
777 aa  843    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2604  heavy metal translocating P-type ATPase  60.88 
 
 
735 aa  801    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.335287 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0177  heavy metal translocating P-type ATPase  69.57 
 
 
755 aa  1068    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.963495  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2710  heavy metal translocating P-type ATPase  53.79 
 
 
835 aa  843    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.3034  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3038  copper-translocating P-type ATPase  54.78 
 
 
842 aa  818    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0191  heavy metal translocating P-type ATPase  52.81 
 
 
837 aa  757    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.562672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>