More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2132 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  100 
 
 		 68 aa  139  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  61.19 
 
 		 68 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  61.19 
 
 		 68 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  55.88 
 
 		 68 aa  80.5  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  57.14 
 
 		 67 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  54.84 
 
 		 67 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  54.84 
 
 		 67 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1149  copper ion binding protein  52.38 
 
 		 74 aa  73.2  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  47.62 
 
 		 67 aa  70.1  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  48.53 
 
 		 68 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  48.53 
 
 		 68 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  51.61 
 
 		 70 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  48.53 
 
 		 68 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1163  copper ion binding protein  49.21 
 
 		 74 aa  69.7  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3742  copper-ion-binding protein  48.53 
 
 		 68 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000142681 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3576  copper-ion-binding protein  48.53 
 
 		 68 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000264411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3476  copper-ion-binding protein  48.53 
 
 		 68 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3488  copper-ion-binding protein  48.53 
 
 		 68 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000382962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3860  copper-ion-binding protein  48.53 
 
 		 68 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00109748  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  48.48 
 
 		 68 aa  68.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  49.21 
 
 		 71 aa  67.8  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3759  copper-ion-binding protein  47.06 
 
 		 68 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206021  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  49.21 
 
 		 77 aa  65.5  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  45.16 
 
 		 67 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1715  copper ion binding protein  48.39 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0879446  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1697  copper ion-binding  43.28 
 
 		 69 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000580158  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  45.59 
 
 		 68 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1882  mercury ion binding protein  45.45 
 
 		 68 aa  63.5  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.174635  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0021  copper ion binding protein  43.08 
 
 		 70 aa  63.2  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00208737  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 67 aa  60.8  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2455  Heavy metal transport/detoxification protein  43.94 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000343237  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2139  heavy metal transport/detoxification protein  47.76 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  38.46 
 
 		 818 aa  59.3  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  37.31 
 
 		 889 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  37.31 
 
 		 889 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0698  copper ion binding protein  39.39 
 
 		 71 aa  58.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.031698  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  40.91 
 
 		 68 aa  58.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  35.82 
 
 		 894 aa  57.8  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0294  copper ion binding protein  40.91 
 
 		 71 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  43.33 
 
 		 798 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  43.33 
 
 		 798 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1809  copper ion binding protein  45.16 
 
 		 75 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.865359  normal  0.918649 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1389  Mercuric transport protein MerT  40.98 
 
 		 209 aa  57  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000264548  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1638  putative MerP, periplasmic heavy metal binding/chaperone protein  34.92 
 
 		 74 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.240185  hitchhiker  0.000119681 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1872  heavy metal transport/detoxification protein  34.92 
 
 		 74 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.230412  unclonable  0.0000667879 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  37.88 
 
 		 867 aa  55.5  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3877  copper-translocating P-type ATPase  36.92 
 
 		 760 aa  55.1  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00336349  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  39.68 
 
 		 861 aa  55.1  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0905  heavy metal translocating P-type ATPase  41.94 
 
 		 802 aa  55.1  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.631984  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2021  copper-translocating P-type ATPase  40 
 
 		 811 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0162  Heavy metal transport/detoxification protein  40.58 
 
 		 228 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.988191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1659  copper ion binding protein  35.82 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.842806 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1686  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 811 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  41.94 
 
 		 942 aa  54.7  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1873  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 821 aa  54.7  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0745  Heavy metal transport/detoxification protein  38.46 
 
 		 471 aa  54.3  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000126874  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2271  mercuric transport protein periplasmic component  36.92 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.618304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0119  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 816 aa  54.7  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1785  mercuric transport protein periplasmic component  36.67 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37235  normal  0.942363 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  40 
 
 		 954 aa  53.9  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  42.42 
 
 		 837 aa  53.5  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0334  heavy metal-binding domain-containing protein  40.32 
 
 		 68 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000340547  normal  0.151356 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  38.1 
 
 		 839 aa  53.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1053  heavy metal transport/detoxification protein  36.36 
 
 		 68 aa  52.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1666  copper ion binding protein  37.7 
 
 		 73 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1877  Heavy metal transport/detoxification protein  42.86 
 
 		 65 aa  52.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3586  heavy metal translocating P-type ATPase  37.31 
 
 		 824 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845066  hitchhiker  0.000954776 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2476  Heavy metal transport/detoxification protein  42.62 
 
 		 69 aa  53.5  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.270205  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  45 
 
 		 833 aa  53.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0789  heavy metal translocating P-type ATPase  45 
 
 		 820 aa  53.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.222821 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 849 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1856  copper-translocating P-type ATPase  38.1 
 
 		 890 aa  52.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3237  Heavy metal transport/detoxification protein  36.51 
 
 		 70 aa  52.8  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.28951  normal  0.700425 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1215  periplasmic mecuric binding protein, MerP  35.38 
 
 		 91 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0297  heavy metal translocating P-type ATPase  37.1 
 
 		 744 aa  52.8  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4343  mercuric transport protein periplasmic component  35.38 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.68 
 
 		 473 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  38.46 
 
 		 798 aa  51.6  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2692  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 887 aa  51.6  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0975857 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2230  mercuric transport protein periplasmic protein  31.82 
 
 		 91 aa  51.6  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  39.39 
 
 		 826 aa  51.6  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000573179  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  45 
 
 		 838 aa  52  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1546  cation transport ATPase  35.29 
 
 		 742 aa  52  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  36.51 
 
 		 817 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2460  heavy metal translocating P-type ATPase  37.1 
 
 		 836 aa  51.2  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00836136  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0611  mercuric ion binding protein, putative  38.71 
 
 		 68 aa  51.2  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.259599  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1291  Heavy metal transport/detoxification protein  36.36 
 
 		 69 aa  51.2  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09570  copper chaperone  29.85 
 
 		 75 aa  51.2  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.344611  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0092  mercuric transport protein periplasmic component  34.43 
 
 		 91 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1233  hypothetical protein  36.92 
 
 		 810 aa  50.8  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  37.31 
 
 		 69 aa  50.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  41.54 
 
 		 976 aa  50.4  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1476  mercuric transport protein periplasmic component  36.92 
 
 		 94 aa  50.4  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.241266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0212  copper-translocating P-type ATPase  40.98 
 
 		 759 aa  50.4  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0143  heavy metal translocating P-type ATPase  36.07 
 
 		 871 aa  50.4  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  41.79 
 
 		 817 aa  50.4  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13340  Heavy metal transport/detoxification protein  39.06 
 
 		 69 aa  50.4  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000868167  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4424  heavy metal transport/detoxification protein  34.33 
 
 		 71 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2900  heavy metal translocating P-type ATPase  34.33 
 
 		 795 aa  50.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0179481  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  30.77 
 
 		 750 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>