75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6226 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6226  Heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 123 aa  254  3e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3112  Heavy metal transport/detoxification protein  39.09 
 
 		 113 aa  80.9  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.533336 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1516  Heavy metal transport/detoxification protein  43.9 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0275841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1506  cation-transporting ATPase  33.63 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000147666  normal  0.111213 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1677  Heavy metal transport/detoxification protein  32.71 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.172839  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3324  hypothetical protein  32.14 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.943882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1452  heavy metal transport/detoxification protein  33.03 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5685  TonB-dependent receptor  34.86 
 
 		 773 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0785655  normal  0.623805 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  32.86 
 
 		 794 aa  50.8  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  32.39 
 
 		 803 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  32 
 
 		 805 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  35.29 
 
 		 68 aa  47.8  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3055  hypothetical protein  31.9 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.242531  decreased coverage  0.000503951 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6742  Heavy metal transport/detoxification protein  31.08 
 
 		 196 aa  47  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.685267 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  35.48 
 
 		 805 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  35.48 
 
 		 806 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3064  hypothetical protein  30.19 
 
 		 283 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.88495  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4626  heavy metal translocating P-type ATPase  30.49 
 
 		 754 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.617338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  35.48 
 
 		 805 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  35.48 
 
 		 805 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  35.48 
 
 		 805 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  35.48 
 
 		 805 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  35.48 
 
 		 805 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 758 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 786 aa  45.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  34.57 
 
 		 954 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  33.87 
 
 		 806 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01410  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  31.82 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  41.51 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  37.5 
 
 		 71 aa  45.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00260  putative copper transport-related membrane protein  35.19 
 
 		 741 aa  45.1  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.348825  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  35.38 
 
 		 759 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  35.38 
 
 		 759 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  25 
 
 		 837 aa  45.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4796  mercuric transport protein periplasmic protein  28.89 
 
 		 94 aa  44.7  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  33.93 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1666  copper ion binding protein  35.29 
 
 		 73 aa  43.5  0.0009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121778  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  28.79 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  32.73 
 
 		 1087 aa  42.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  28.79 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  32.26 
 
 		 806 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0982  copper chaperone  33.87 
 
 		 76 aa  42  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0469  heavy metal translocating P-type ATPase  38.18 
 
 		 758 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.472881  normal  0.330055 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  30.77 
 
 		 857 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  34.55 
 
 		 750 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  35.09 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  29.41 
 
 		 802 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  35.71 
 
 		 821 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  29.41 
 
 		 802 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 836 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  29.51 
 
 		 68 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  29.51 
 
 		 68 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1465  heavy metal translocating P-type ATPase  27.38 
 
 		 825 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.338501  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0240  mercuric transport protein periplasmic component  33.33 
 
 		 98 aa  41.2  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1960  heavy metal translocating P-type ATPase  25.84 
 
 		 828 aa  41.2  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0484  mercuric transport protein periplasmic component  28.75 
 
 		 92 aa  41.2  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  35.85 
 
 		 818 aa  41.2  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  33.33 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0113  mercuric transport protein periplasmic component  28.09 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.827734  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2583  Heavy metal transport/detoxification protein  31.58 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.130658  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1876  heavy metal translocating P-type ATPase  35.44 
 
 		 748 aa  40.8  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.972303  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2328  heavy metal transport/detoxification protein  28.04 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2314  mercuric transport protein periplasmic protein  31.82 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118185  hitchhiker  0.0000281671 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  28.57 
 
 		 889 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  28.57 
 
 		 889 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1299  mercuric transport protein periplasmic component  31.82 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1532  cation-transporting ATPase  29.27 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00495755  normal  0.325005 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1215  periplasmic mecuric binding protein, MerP  31.75 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2279  copper ion binding protein  36.92 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3412  copper ion binding protein  33.33 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0277616 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0169  mercuric transport protein periplasmic component  30.67 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2465  heavy metal translocating P-type ATPase  37.04 
 
 		 876 aa  40.8  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4343  mercuric transport protein periplasmic component  31.75 
 
 		 91 aa  40.4  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2021  copper-translocating P-type ATPase  28.92 
 
 		 811 aa  40.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1686  heavy metal translocating P-type ATPase  28.92 
 
 		 811 aa  40.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>