222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01410 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01410  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  100 
 
 
94 aa  186  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3490  mercuric transport protein periplasmic component  61.54 
 
 
95 aa  115  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0169  mercuric transport protein periplasmic component  65.93 
 
 
91 aa  110  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02043  Mercury scavenger protein:Heavy-metal-associated domain  62.2 
 
 
85 aa  107  8.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525841  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4313  mercuric transport protein periplasmic component  65.93 
 
 
91 aa  106  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0240  mercuric transport protein periplasmic component  52.17 
 
 
98 aa  94.4  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1393  mercuric transport protein periplasmic component  48.31 
 
 
98 aa  94.4  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0239  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  50 
 
 
94 aa  91.3  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0484  mercuric transport protein periplasmic component  53.76 
 
 
92 aa  90.9  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1215  periplasmic mecuric binding protein, MerP  51.11 
 
 
91 aa  89.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4796  mercuric transport protein periplasmic protein  43.62 
 
 
94 aa  89  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4012  mercuric transport protein periplasmic component  49.43 
 
 
100 aa  88.2  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2314  mercuric transport protein periplasmic protein  60 
 
 
95 aa  88.2  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118185  hitchhiker  0.0000281671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1299  mercuric transport protein periplasmic component  60 
 
 
95 aa  88.2  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1785  mercuric transport protein periplasmic component  55.71 
 
 
90 aa  87.8  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37235  normal  0.942363 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0092  mercuric transport protein periplasmic component  52.7 
 
 
91 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6496  mercuric transport protein periplasmic protein  47.78 
 
 
91 aa  85.9  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43034  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6173  Hg(II) resistance protein MerP  47.78 
 
 
91 aa  85.9  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000203357  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6346  Hg(II) resistance protein MerP  47.78 
 
 
91 aa  85.9  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000621364  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15470  periplasmic mercuric ion binding protein, MerP  47.78 
 
 
91 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000149366  unclonable  3.5058299999999997e-22 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4343  mercuric transport protein periplasmic component  56.52 
 
 
91 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1663  PBP/HMA domain-containing protein  58.82 
 
 
94 aa  85.5  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140862  normal  0.759256 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2339  mercuric transport protein periplasmic component  47.78 
 
 
91 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832464  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0103  mercuric transport protein periplasmic component  47.78 
 
 
91 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2131  mercuric transport protein periplasmic component  48.35 
 
 
91 aa  85.1  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0081  mercuric transport protein periplasmic component  48.35 
 
 
91 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.675229 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2271  mercuric transport protein periplasmic component  50.56 
 
 
94 aa  84.7  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.618304  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0113  mercuric transport protein periplasmic component  48.89 
 
 
91 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.827734  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1476  mercuric transport protein periplasmic component  50 
 
 
94 aa  84  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.241266  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0166  mercuric transport protein periplasmic component MerP  46.67 
 
 
91 aa  84.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.695125  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2230  mercuric transport protein periplasmic protein  46.67 
 
 
91 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4417  mercuric transport protein periplasmic protein  49.4 
 
 
94 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192588  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2511  mercuric transport protein periplasmic protein  55.41 
 
 
99 aa  80.9  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.356859 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1211  mercuric transport protein periplasmic component  47.25 
 
 
91 aa  80.5  0.000000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154152  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1340  mercuric transport protein periplasmic protein  48.42 
 
 
108 aa  78.6  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.023175  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2902  mercuric transport protein periplasmic component  44.44 
 
 
98 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3158  heavy metal transport/detoxification protein  45.21 
 
 
97 aa  72  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.299489  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0798  heavy metal transport/detoxification protein  41.67 
 
 
98 aa  72  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.885696 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2328  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02958  putative mercuric transport protein periplasmic binding protein  52.63 
 
 
61 aa  60.8  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000221082  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2684  heavy metal transport/detoxification protein  40.91 
 
 
109 aa  60.8  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2066  mercuric transport protein periplasmic component  37.78 
 
 
85 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.131974  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0117  mercuric transport protein periplasmic component  37.78 
 
 
84 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  34.15 
 
 
954 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  37.31 
 
 
71 aa  55.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1389  Mercuric transport protein MerT  41.43 
 
 
209 aa  55.1  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000264548  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  43.08 
 
 
68 aa  54.7  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0119  heavy metal translocating P-type ATPase  39.39 
 
 
816 aa  53.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1945  mercuric transport protein periplasmic component  43.33 
 
 
112 aa  52  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.230476  normal  0.0101145 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  34.29 
 
 
758 aa  50.4  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0890  mercuric reductase  42.62 
 
 
66 aa  50.1  0.000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000328424  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  38.81 
 
 
1071 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1232  Heavy metal transport/detoxification protein  29.73 
 
 
115 aa  50.1  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0066446  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  35.62 
 
 
1087 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1882  mercury ion binding protein  35 
 
 
68 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.174635  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  36.07 
 
 
68 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  37.5 
 
 
833 aa  48.9  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  35.82 
 
 
758 aa  48.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2967  heavy metal transport/detoxification protein  36.56 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.986526  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3281  heavy metal translocating P-type ATPase  31.25 
 
 
699 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  29.76 
 
 
802 aa  48.1  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0143  heavy metal translocating P-type ATPase  31.94 
 
 
871 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  29.76 
 
 
802 aa  48.1  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  33.78 
 
 
753 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  35.94 
 
 
861 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  40.62 
 
 
838 aa  48.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0143  Heavy metal transport/detoxification protein  37.5 
 
 
65 aa  47.8  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.816482  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4541  heavy metal transport/detoxification protein  27.54 
 
 
75 aa  47.8  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  39.39 
 
 
837 aa  47.8  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1305  Heavy metal transport/detoxification protein  35.63 
 
 
94 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.497858  normal  0.921756 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1541  heavy metal transport/detoxification protein  38.46 
 
 
125 aa  47  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.45566  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  30.95 
 
 
794 aa  47  0.00009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  26.51 
 
 
797 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1465  heavy metal translocating P-type ATPase  35.94 
 
 
825 aa  46.6  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.338501  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1638  putative MerP, periplasmic heavy metal binding/chaperone protein  26.47 
 
 
74 aa  46.2  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.240185  hitchhiker  0.000119681 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6226  Heavy metal transport/detoxification protein  29.79 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2086  heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000331725  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3215  heavy metal transport/detoxification protein  35.63 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.501127  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0911  Heavy metal transport/detoxification protein  32.26 
 
 
78 aa  46.6  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1873  heavy metal translocating P-type ATPase  31.82 
 
 
821 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3058  heavy metal transport/detoxification protein  35.63 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3165  copper exporting ATPase  38.36 
 
 
961 aa  46.2  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.517155  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1265  copper exporting ATPase  38.36 
 
 
955 aa  46.2  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.057349 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  35.82 
 
 
805 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  32.81 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2938  copper-translocating P-type ATPase  37.31 
 
 
795 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2871  heavy metal transport/detoxification protein  34.83 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3027  copper exporting ATPase  38.36 
 
 
955 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4421  copper-translocating P-type ATPase  39.39 
 
 
762 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.900391  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2479  putative cation transport P-type ATPase  38.98 
 
 
765 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354353  normal  0.180774 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  32.35 
 
 
797 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  31.25 
 
 
67 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  32.81 
 
 
759 aa  45.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  30.77 
 
 
750 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  42.19 
 
 
855 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  33.33 
 
 
67 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2788  heavy metal transport/detoxification protein  34.78 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.863319  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  31.25 
 
 
67 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3072  heavy metal transport/detoxification protein  35.63 
 
 
94 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1110  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 
938 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0214095  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>