More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2314 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2314  mercuric transport protein periplasmic protein  100 
 
 		 95 aa  184  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118185  hitchhiker  0.0000281671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1299  mercuric transport protein periplasmic component  100 
 
 		 95 aa  184  5e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0484  mercuric transport protein periplasmic component  78.95 
 
 		 92 aa  142  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0092  mercuric transport protein periplasmic component  77.92 
 
 		 91 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2230  mercuric transport protein periplasmic protein  67.37 
 
 		 91 aa  124  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1393  mercuric transport protein periplasmic component  58.51 
 
 		 98 aa  116  7.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1215  periplasmic mecuric binding protein, MerP  76.06 
 
 		 91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4343  mercuric transport protein periplasmic component  76.06 
 
 		 91 aa  114  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0103  mercuric transport protein periplasmic component  76.06 
 
 		 91 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2339  mercuric transport protein periplasmic component  76.06 
 
 		 91 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6496  mercuric transport protein periplasmic protein  76.06 
 
 		 91 aa  113  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43034  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6173  Hg(II) resistance protein MerP  76.06 
 
 		 91 aa  113  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000203357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6346  Hg(II) resistance protein MerP  76.06 
 
 		 91 aa  113  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000621364  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15470  periplasmic mercuric ion binding protein, MerP  76.06 
 
 		 91 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000149366  unclonable  3.5058299999999997e-22 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1211  mercuric transport protein periplasmic component  78.87 
 
 		 91 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154152  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2131  mercuric transport protein periplasmic component  77.46 
 
 		 91 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0081  mercuric transport protein periplasmic component  77.46 
 
 		 91 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.675229 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2271  mercuric transport protein periplasmic component  63.64 
 
 		 94 aa  110  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.618304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0240  mercuric transport protein periplasmic component  63.1 
 
 		 98 aa  110  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1785  mercuric transport protein periplasmic component  75.71 
 
 		 90 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37235  normal  0.942363 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0166  mercuric transport protein periplasmic component MerP  74.65 
 
 		 91 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.695125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4012  mercuric transport protein periplasmic component  59.78 
 
 		 100 aa  107  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4796  mercuric transport protein periplasmic protein  57.83 
 
 		 94 aa  104  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1476  mercuric transport protein periplasmic component  62.16 
 
 		 94 aa  103  9e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.241266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3490  mercuric transport protein periplasmic component  54.74 
 
 		 95 aa  96.3  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0169  mercuric transport protein periplasmic component  64 
 
 		 91 aa  95.5  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4313  mercuric transport protein periplasmic component  63.51 
 
 		 91 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02043  Mercury scavenger protein:Heavy-metal-associated domain  58.44 
 
 		 85 aa  92.4  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525841  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01410  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  59.46 
 
 		 94 aa  91.7  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1340  mercuric transport protein periplasmic protein  63.77 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.023175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2902  mercuric transport protein periplasmic component  50 
 
 		 98 aa  90.9  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0113  mercuric transport protein periplasmic component  53.12 
 
 		 91 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.827734  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3158  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 97 aa  88.6  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.299489  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1663  PBP/HMA domain-containing protein  60 
 
 		 94 aa  88.6  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140862  normal  0.759256 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0798  heavy metal transport/detoxification protein  45.83 
 
 		 98 aa  82.8  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.885696 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2511  mercuric transport protein periplasmic protein  51.58 
 
 		 99 aa  81.3  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.356859 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0239  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  48.42 
 
 		 94 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4417  mercuric transport protein periplasmic protein  42.55 
 
 		 94 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192588  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2328  heavy metal transport/detoxification protein  40.19 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2684  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02958  putative mercuric transport protein periplasmic binding protein  49.18 
 
 		 61 aa  65.5  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000221082  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0890  mercuric reductase  52.46 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000328424  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1305  Heavy metal transport/detoxification protein  42.7 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.497858  normal  0.921756 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  47.69 
 
 		 68 aa  61.6  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  42.62 
 
 		 67 aa  60.5  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3072  heavy metal transport/detoxification protein  42.7 
 
 		 94 aa  60.8  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1407  mercuric transport periplasmic protein MerP, putative  37.89 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3215  heavy metal transport/detoxification protein  42.7 
 
 		 94 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.501127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3281  heavy metal translocating P-type ATPase  35.94 
 
 		 699 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3058  heavy metal transport/detoxification protein  43.59 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1541  heavy metal transport/detoxification protein  37.23 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.45566  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1149  copper ion binding protein  42.19 
 
 		 74 aa  57.4  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0119  heavy metal translocating P-type ATPase  43.08 
 
 		 816 aa  57  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  43.28 
 
 		 1087 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2066  mercuric transport protein periplasmic component  41.46 
 
 		 85 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.131974  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0117  mercuric transport protein periplasmic component  40.48 
 
 		 84 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  44.62 
 
 		 833 aa  56.6  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1209  mercuric reductase  52.46 
 
 		 565 aa  56.6  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.375903  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1163  copper ion binding protein  39.06 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  41.27 
 
 		 71 aa  55.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 837 aa  55.5  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000289142  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 759 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  37.7 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 759 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  35.21 
 
 		 794 aa  54.7  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0045  putative mercuric reductase  49.18 
 
 		 564 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00619698  normal  0.422186 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2133  putative mercuric reductase  49.18 
 
 		 564 aa  55.1  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  42.19 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  32.81 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  32.81 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  44.62 
 
 		 838 aa  54.3  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2967  heavy metal transport/detoxification protein  40.45 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.986526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  36.62 
 
 		 796 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  47.69 
 
 		 837 aa  53.9  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3052  heavy metal translocating P-type ATPase  43.84 
 
 		 866 aa  53.9  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  36.11 
 
 		 797 aa  53.5  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  37.14 
 
 		 802 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2773  heavy metal translocating P-type ATPase  45.71 
 
 		 824 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  40.62 
 
 		 954 aa  52.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  42.42 
 
 		 849 aa  53.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  37.14 
 
 		 802 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2871  heavy metal transport/detoxification protein  36.46 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4541  heavy metal transport/detoxification protein  38.24 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  43.94 
 
 		 1071 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1265  copper exporting ATPase  37.18 
 
 		 955 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.057349 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3165  copper exporting ATPase  37.18 
 
 		 961 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.517155  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  37.14 
 
 		 753 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2317  heavy metal translocating P-type ATPase  38.1 
 
 		 829 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1213  putative mercuric reductase  50.82 
 
 		 561 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  39.34 
 
 		 818 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1872  heavy metal transport/detoxification protein  30 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.230412  unclonable  0.0000667879 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1389  Mercuric transport protein MerT  42.03 
 
 		 209 aa  52.4  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000264548  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3027  copper exporting ATPase  37.18 
 
 		 955 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2788  heavy metal transport/detoxification protein  36.46 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.863319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4345  putative mercuric reductase  50.82 
 
 		 561 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  43.08 
 
 		 821 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2021  copper-translocating P-type ATPase  40.32 
 
 		 811 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3726  copper ion binding protein  43.75 
 
 		 64 aa  51.6  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.663439  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1686  heavy metal translocating P-type ATPase  40.32 
 
 		 811 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1945  mercuric transport protein periplasmic component  53.42 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.230476  normal  0.0101145 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>