More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1215 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1215  periplasmic mecuric binding protein, MerP  100 
 
 		 91 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2230  mercuric transport protein periplasmic protein  86.81 
 
 		 91 aa  160  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4343  mercuric transport protein periplasmic component  96.7 
 
 		 91 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0166  mercuric transport protein periplasmic component MerP  82.42 
 
 		 91 aa  134  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.695125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0092  mercuric transport protein periplasmic component  73.63 
 
 		 91 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0103  mercuric transport protein periplasmic component  84.62 
 
 		 91 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6496  mercuric transport protein periplasmic protein  84.62 
 
 		 91 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43034  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2339  mercuric transport protein periplasmic component  84.62 
 
 		 91 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6173  Hg(II) resistance protein MerP  84.62 
 
 		 91 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000203357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6346  Hg(II) resistance protein MerP  84.62 
 
 		 91 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000621364  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15470  periplasmic mercuric ion binding protein, MerP  84.62 
 
 		 91 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000149366  unclonable  3.5058299999999997e-22 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1785  mercuric transport protein periplasmic component  87.14 
 
 		 90 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37235  normal  0.942363 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1211  mercuric transport protein periplasmic component  84.62 
 
 		 91 aa  127  4.0000000000000003e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154152  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0081  mercuric transport protein periplasmic component  83.52 
 
 		 91 aa  125  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.675229 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2131  mercuric transport protein periplasmic component  83.52 
 
 		 91 aa  125  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2271  mercuric transport protein periplasmic component  71.91 
 
 		 94 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.618304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0484  mercuric transport protein periplasmic component  67.39 
 
 		 92 aa  121  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1393  mercuric transport protein periplasmic component  61.54 
 
 		 98 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0240  mercuric transport protein periplasmic component  61.96 
 
 		 98 aa  115  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2314  mercuric transport protein periplasmic protein  76.06 
 
 		 95 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118185  hitchhiker  0.0000281671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1299  mercuric transport protein periplasmic component  76.06 
 
 		 95 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1476  mercuric transport protein periplasmic component  62.92 
 
 		 94 aa  111  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.241266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4796  mercuric transport protein periplasmic protein  58.43 
 
 		 94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4012  mercuric transport protein periplasmic component  70.42 
 
 		 100 aa  106  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4313  mercuric transport protein periplasmic component  57.14 
 
 		 91 aa  100  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0169  mercuric transport protein periplasmic component  54.95 
 
 		 91 aa  98.6  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1340  mercuric transport protein periplasmic protein  56.18 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.023175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3490  mercuric transport protein periplasmic component  51.61 
 
 		 95 aa  89.7  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01410  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  56.16 
 
 		 94 aa  89  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02043  Mercury scavenger protein:Heavy-metal-associated domain  53.42 
 
 		 85 aa  88.6  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525841  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0113  mercuric transport protein periplasmic component  46.15 
 
 		 91 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.827734  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0239  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  51.09 
 
 		 94 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2902  mercuric transport protein periplasmic component  50 
 
 		 98 aa  82  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4417  mercuric transport protein periplasmic protein  45.74 
 
 		 94 aa  80.1  0.000000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192588  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3158  heavy metal transport/detoxification protein  47.78 
 
 		 97 aa  78.6  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.299489  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0798  heavy metal transport/detoxification protein  47.78 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.885696 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2511  mercuric transport protein periplasmic protein  49.35 
 
 		 99 aa  77  0.00000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.356859 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1663  PBP/HMA domain-containing protein  52.86 
 
 		 94 aa  76.3  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140862  normal  0.759256 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2328  heavy metal transport/detoxification protein  46.48 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02958  putative mercuric transport protein periplasmic binding protein  47.54 
 
 		 61 aa  67  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000221082  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  46.97 
 
 		 68 aa  65.1  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  40.62 
 
 		 67 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  40.62 
 
 		 67 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2684  heavy metal transport/detoxification protein  41.1 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1666  copper ion binding protein  37.14 
 
 		 73 aa  60.8  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1638  putative MerP, periplasmic heavy metal binding/chaperone protein  34.72 
 
 		 74 aa  60.5  0.000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.240185  hitchhiker  0.000119681 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  40.32 
 
 		 68 aa  60.8  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  53.97 
 
 		 67 aa  60.5  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3089  heavy metal transport/detoxification protein  34.72 
 
 		 199 aa  60.5  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  43.08 
 
 		 759 aa  59.7  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  46.15 
 
 		 833 aa  59.7  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2066  mercuric transport protein periplasmic component  40.22 
 
 		 85 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.131974  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1305  Heavy metal transport/detoxification protein  40.45 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.497858  normal  0.921756 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  40.62 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  44.78 
 
 		 1087 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  41.27 
 
 		 68 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 		 67 aa  58.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  39.34 
 
 		 68 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  41.27 
 
 		 67 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3072  heavy metal transport/detoxification protein  40.45 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  39.34 
 
 		 68 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1163  copper ion binding protein  42.19 
 
 		 74 aa  58.2  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  39.68 
 
 		 71 aa  58.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1389  Mercuric transport protein MerT  40.58 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000264548  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  43.08 
 
 		 821 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3215  heavy metal transport/detoxification protein  40.45 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.501127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1149  copper ion binding protein  43.75 
 
 		 74 aa  57.4  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1872  heavy metal transport/detoxification protein  31.94 
 
 		 74 aa  57.4  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.230412  unclonable  0.0000667879 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1945  mercuric transport protein periplasmic component  43.33 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.230476  normal  0.0101145 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  41.27 
 
 		 67 aa  57  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  42.19 
 
 		 759 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1541  heavy metal transport/detoxification protein  41.43 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.45566  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1882  mercury ion binding protein  36.36 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.174635  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  40.98 
 
 		 818 aa  56.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  44.62 
 
 		 838 aa  56.6  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  42.19 
 
 		 759 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0119  heavy metal translocating P-type ATPase  38.46 
 
 		 816 aa  55.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1110  heavy metal translocating P-type ATPase  45.31 
 
 		 938 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0214095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3726  copper ion binding protein  45.31 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.663439  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0890  mercuric reductase  45.9 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000328424  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  40.3 
 
 		 839 aa  56.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  43.94 
 
 		 1071 aa  56.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  38.24 
 
 		 954 aa  55.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0205  heavy metal translocating P-type ATPase  36 
 
 		 823 aa  55.1  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3058  heavy metal transport/detoxification protein  38.2 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2967  heavy metal transport/detoxification protein  39.77 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.986526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  41.54 
 
 		 849 aa  54.7  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  34.92 
 
 		 70 aa  54.7  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  38.81 
 
 		 753 aa  53.9  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0789  heavy metal translocating P-type ATPase  35.38 
 
 		 820 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.222821 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 837 aa  53.5  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000289142  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  34.85 
 
 		 68 aa  52.8  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6742  Heavy metal transport/detoxification protein  35.94 
 
 		 196 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.685267 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4421  copper-translocating P-type ATPase  41.18 
 
 		 762 aa  52.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.900391  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0469  heavy metal translocating P-type ATPase  38.24 
 
 		 758 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.472881  normal  0.330055 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  37.7 
 
 		 806 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  37.7 
 
 		 806 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  44.44 
 
 		 836 aa  53.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  45.31 
 
 		 885 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  44.44 
 
 		 855 aa  52.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>