183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2684 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2684  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
109 aa  211  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2328  heavy metal transport/detoxification protein  45.54 
 
 
125 aa  90.9  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0113  mercuric transport protein periplasmic component  52.05 
 
 
91 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.827734  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0798  heavy metal transport/detoxification protein  57.97 
 
 
98 aa  78.6  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.885696 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2902  mercuric transport protein periplasmic component  59.42 
 
 
98 aa  77.4  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3158  heavy metal transport/detoxification protein  56.52 
 
 
97 aa  77  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.299489  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0239  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  42.86 
 
 
94 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0240  mercuric transport protein periplasmic component  45.21 
 
 
98 aa  72.4  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1663  PBP/HMA domain-containing protein  45.71 
 
 
94 aa  72.4  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140862  normal  0.759256 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0169  mercuric transport protein periplasmic component  45.21 
 
 
91 aa  72  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01410  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  42.67 
 
 
94 aa  70.5  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0081  mercuric transport protein periplasmic component  43.66 
 
 
91 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.675229 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2131  mercuric transport protein periplasmic component  43.66 
 
 
91 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0484  mercuric transport protein periplasmic component  40.45 
 
 
92 aa  67.4  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4796  mercuric transport protein periplasmic protein  42.25 
 
 
94 aa  67  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4313  mercuric transport protein periplasmic component  42.47 
 
 
91 aa  66.6  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3490  mercuric transport protein periplasmic component  41.89 
 
 
95 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02958  putative mercuric transport protein periplasmic binding protein  45.76 
 
 
61 aa  66.2  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000221082  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2230  mercuric transport protein periplasmic protein  41.1 
 
 
91 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1476  mercuric transport protein periplasmic component  40.85 
 
 
94 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.241266  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0166  mercuric transport protein periplasmic component MerP  40.85 
 
 
91 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.695125  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0092  mercuric transport protein periplasmic component  42.47 
 
 
91 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6496  mercuric transport protein periplasmic protein  40.85 
 
 
91 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43034  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1340  mercuric transport protein periplasmic protein  43.48 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.023175  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2339  mercuric transport protein periplasmic component  40.85 
 
 
91 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832464  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6173  Hg(II) resistance protein MerP  40.85 
 
 
91 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000203357  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6346  Hg(II) resistance protein MerP  40.85 
 
 
91 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000621364  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15470  periplasmic mercuric ion binding protein, MerP  40.85 
 
 
91 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000149366  unclonable  3.5058299999999997e-22 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1211  mercuric transport protein periplasmic component  42.25 
 
 
91 aa  65.1  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154152  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0103  mercuric transport protein periplasmic component  40.85 
 
 
91 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4417  mercuric transport protein periplasmic protein  41.56 
 
 
94 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192588  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1215  periplasmic mecuric binding protein, MerP  39.44 
 
 
91 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2314  mercuric transport protein periplasmic protein  42.25 
 
 
95 aa  64.3  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118185  hitchhiker  0.0000281671 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2511  mercuric transport protein periplasmic protein  47.22 
 
 
99 aa  64.3  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.356859 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1299  mercuric transport protein periplasmic component  42.25 
 
 
95 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4343  mercuric transport protein periplasmic component  39.44 
 
 
91 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4012  mercuric transport protein periplasmic component  40 
 
 
100 aa  63.9  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1785  mercuric transport protein periplasmic component  38.57 
 
 
90 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37235  normal  0.942363 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2271  mercuric transport protein periplasmic component  38.03 
 
 
94 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.618304  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1393  mercuric transport protein periplasmic component  33.72 
 
 
98 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02043  Mercury scavenger protein:Heavy-metal-associated domain  42.31 
 
 
85 aa  59.7  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525841  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2583  Heavy metal transport/detoxification protein  35.29 
 
 
82 aa  57.4  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.130658  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1945  mercuric transport protein periplasmic component  39.6 
 
 
112 aa  55.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.230476  normal  0.0101145 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1541  heavy metal transport/detoxification protein  40.91 
 
 
125 aa  54.7  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.45566  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 
67 aa  54.3  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1638  putative MerP, periplasmic heavy metal binding/chaperone protein  36.11 
 
 
74 aa  52.8  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.240185  hitchhiker  0.000119681 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0141  Heavy metal transport/detoxification protein  46.03 
 
 
65 aa  53.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0143  heavy metal translocating P-type ATPase  33.78 
 
 
871 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  36.92 
 
 
954 aa  52  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0143  Heavy metal transport/detoxification protein  42.86 
 
 
65 aa  52  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.816482  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  39.34 
 
 
70 aa  52  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0789  heavy metal translocating P-type ATPase  36 
 
 
820 aa  51.6  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.222821 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  36.07 
 
 
71 aa  51.2  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  37.14 
 
 
806 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  37.14 
 
 
806 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  37.14 
 
 
805 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  37.14 
 
 
805 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  37.14 
 
 
805 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  37.14 
 
 
805 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  37.14 
 
 
805 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  37.14 
 
 
805 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  35 
 
 
836 aa  50.4  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1873  heavy metal translocating P-type ATPase  34.38 
 
 
821 aa  50.4  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  41.38 
 
 
750 aa  50.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1553  heavy metal translocating P-type ATPase  37.93 
 
 
859 aa  50.4  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.534956  normal  0.0124284 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  35.71 
 
 
805 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  36.36 
 
 
942 aa  49.7  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1872  heavy metal transport/detoxification protein  34.72 
 
 
74 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.230412  unclonable  0.0000667879 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1882  mercury ion binding protein  33.33 
 
 
68 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.174635  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  35.71 
 
 
806 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1697  copper ion-binding  32.31 
 
 
69 aa  48.9  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000580158  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1492  heavy metal transport/detoxification protein  35.71 
 
 
102 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  35.94 
 
 
68 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  39.39 
 
 
849 aa  48.9  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11220  copper/silver-translocating P-type ATPase  36.76 
 
 
925 aa  48.1  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.363514 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  38.24 
 
 
71 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  41.18 
 
 
67 aa  47.4  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0385  copper-transporter ATPase CopA  32.86 
 
 
744 aa  47.4  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2692  heavy metal translocating P-type ATPase  31.58 
 
 
887 aa  47  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0975857 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1752  Heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 
65 aa  47  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  30.77 
 
 
826 aa  47  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000573179  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  35 
 
 
837 aa  47  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  32.79 
 
 
68 aa  46.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  32.39 
 
 
976 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  36.07 
 
 
752 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3165  copper exporting ATPase  33.72 
 
 
961 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.517155  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1265  copper exporting ATPase  33.72 
 
 
955 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.057349 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3052  heavy metal translocating P-type ATPase  35.82 
 
 
866 aa  46.2  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  35.94 
 
 
867 aa  46.6  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  33.75 
 
 
861 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  35.38 
 
 
1071 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  36.47 
 
 
827 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.62 
 
 
473 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  33.82 
 
 
1087 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  32.47 
 
 
837 aa  45.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000289142  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  30.99 
 
 
833 aa  45.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  27.87 
 
 
817 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  30.3 
 
 
796 aa  45.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0021  copper ion binding protein  35.48 
 
 
70 aa  45.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00208737  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  36.21 
 
 
837 aa  45.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>