More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1800 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  100 
 
 
67 aa  135  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  77.61 
 
 
68 aa  111  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  76.12 
 
 
67 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  69.7 
 
 
67 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  69.7 
 
 
67 aa  101  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  66.67 
 
 
67 aa  97.8  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  51.61 
 
 
68 aa  77.8  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  51.61 
 
 
68 aa  77.8  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1163  copper ion binding protein  50.77 
 
 
74 aa  72  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  47.62 
 
 
68 aa  70.1  0.000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1149  copper ion binding protein  46.15 
 
 
74 aa  68.9  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  51.52 
 
 
68 aa  68.2  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  46.88 
 
 
71 aa  67.8  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  55.22 
 
 
67 aa  66.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  45.31 
 
 
68 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  45.31 
 
 
68 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  45.31 
 
 
68 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3576  copper-ion-binding protein  45.31 
 
 
68 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000264411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3476  copper-ion-binding protein  45.31 
 
 
68 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3488  copper-ion-binding protein  45.31 
 
 
68 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000382962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3860  copper-ion-binding protein  45.31 
 
 
68 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00109748  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3742  copper-ion-binding protein  45.31 
 
 
68 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000142681 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3759  copper-ion-binding protein  45.31 
 
 
68 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206021  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0933  heavy metal transport/detoxification protein  49.23 
 
 
96 aa  63.5  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1697  copper ion-binding  45.16 
 
 
69 aa  63.5  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000580158  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  43.55 
 
 
68 aa  62.8  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  47.62 
 
 
77 aa  63.2  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1389  Mercuric transport protein MerT  53.33 
 
 
209 aa  63.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000264548  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1211  mercuric transport protein periplasmic component  45.31 
 
 
91 aa  62.4  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154152  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  44.44 
 
 
70 aa  62.4  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0081  mercuric transport protein periplasmic component  45.31 
 
 
91 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.675229 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2131  mercuric transport protein periplasmic component  45.31 
 
 
91 aa  62  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  43.28 
 
 
954 aa  61.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  43.55 
 
 
67 aa  61.6  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1809  copper ion binding protein  43.08 
 
 
75 aa  61.6  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.865359  normal  0.918649 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0021  copper ion binding protein  43.94 
 
 
70 aa  61.2  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00208737  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1715  copper ion binding protein  45.31 
 
 
77 aa  60.8  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0879446  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2086  heavy metal transport/detoxification protein  42.42 
 
 
68 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000331725  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1785  mercuric transport protein periplasmic component  44.44 
 
 
90 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37235  normal  0.942363 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0890  mercuric reductase  46.97 
 
 
66 aa  60.1  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000328424  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2455  Heavy metal transport/detoxification protein  46.03 
 
 
108 aa  58.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000343237  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0166  mercuric transport protein periplasmic component MerP  42.19 
 
 
91 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.695125  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0103  mercuric transport protein periplasmic component  40.62 
 
 
91 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6496  mercuric transport protein periplasmic protein  40.62 
 
 
91 aa  58.2  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43034  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1882  mercury ion binding protein  39.34 
 
 
68 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.174635  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1215  periplasmic mecuric binding protein, MerP  41.27 
 
 
91 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6173  Hg(II) resistance protein MerP  40.62 
 
 
91 aa  58.2  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000203357  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6346  Hg(II) resistance protein MerP  40.62 
 
 
91 aa  58.2  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000621364  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  42.42 
 
 
818 aa  58.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15470  periplasmic mercuric ion binding protein, MerP  40.62 
 
 
91 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000149366  unclonable  3.5058299999999997e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  39.06 
 
 
68 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4343  mercuric transport protein periplasmic component  41.27 
 
 
91 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2339  mercuric transport protein periplasmic component  40.62 
 
 
91 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832464  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0092  mercuric transport protein periplasmic component  45.16 
 
 
91 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1291  Heavy metal transport/detoxification protein  46.03 
 
 
69 aa  57.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3169  Heavy metal transport/detoxification protein  42.42 
 
 
65 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145614 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1340  mercuric transport protein periplasmic protein  43.75 
 
 
108 aa  57.4  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.023175  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0131  Heavy metal transport/detoxification protein  42.19 
 
 
67 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2230  mercuric transport protein periplasmic protein  37.5 
 
 
91 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4448  heavy metal transport/detoxification protein  43.75 
 
 
67 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866926  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  44.62 
 
 
68 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3258  Heavy metal transport/detoxification protein  46.48 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  42.42 
 
 
942 aa  55.1  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  46.27 
 
 
67 aa  55.5  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  42.42 
 
 
69 aa  54.7  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1312  mercuric transport protein periplasmic component  40 
 
 
68 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629911  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1299  mercuric transport protein periplasmic component  42.19 
 
 
95 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2314  mercuric transport protein periplasmic protein  42.19 
 
 
95 aa  54.3  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118185  hitchhiker  0.0000281671 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3726  copper ion binding protein  46.27 
 
 
64 aa  53.9  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.663439  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0240  mercuric transport protein periplasmic component  40.62 
 
 
98 aa  53.9  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 
65 aa  53.5  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  43.94 
 
 
78 aa  53.9  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2476  Heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 
69 aa  53.1  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.270205  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  40.62 
 
 
976 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2844  Heavy metal transport/detoxification protein  49.21 
 
 
68 aa  53.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1212  Heavy metal transport/detoxification protein  39.68 
 
 
78 aa  53.5  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1021  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2989  Heavy metal transport/detoxification protein  44.44 
 
 
68 aa  52.4  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84044  copper-transporting ATPase (Cu(2+)-ATPase)  34.33 
 
 
1196 aa  52.8  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00231928  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2514  heavy metal translocating P-type ATPase  40.62 
 
 
845 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.229137  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  43.94 
 
 
79 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4022  Heavy metal transport/detoxification protein  45.45 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  39.39 
 
 
67 aa  52  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0485  heavy metal translocating P-type ATPase  34.85 
 
 
724 aa  52.8  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.265664  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  39.39 
 
 
67 aa  52  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1856  copper-translocating P-type ATPase  33.85 
 
 
890 aa  52.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 
65 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4313  mercuric transport protein periplasmic component  40.62 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  43.75 
 
 
69 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  39.39 
 
 
67 aa  52  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0008  copper-translocating P-type ATPase  43.28 
 
 
891 aa  52  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 
65 aa  51.6  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1386  Heavy metal transport/detoxification protein  43.94 
 
 
79 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  hitchhiker  0.000957123 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2271  mercuric transport protein periplasmic component  34.43 
 
 
94 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.618304  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0745  Heavy metal transport/detoxification protein  37.31 
 
 
471 aa  52  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000126874  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1393  mercuric transport protein periplasmic component  36.51 
 
 
98 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36140  copper chaperone  43.28 
 
 
100 aa  52  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.237573  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11220  copper/silver-translocating P-type ATPase  39.06 
 
 
925 aa  51.2  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.363514 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0018  heavy metal transport/detoxification protein  40.91 
 
 
65 aa  51.6  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1849  heavy metal transport/detoxification protein  36.51 
 
 
499 aa  51.6  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>