181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3169 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_3169  Heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
65 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145614 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0933  heavy metal transport/detoxification protein  68.75 
 
 
96 aa  99.4  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1312  mercuric transport protein periplasmic component  58.82 
 
 
68 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629911  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  52.38 
 
 
67 aa  66.6  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  45.31 
 
 
65 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  52.46 
 
 
67 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0968  Heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
66 aa  63.5  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2471  Heavy metal transport/detoxification protein  48.28 
 
 
108 aa  61.6  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  38.46 
 
 
65 aa  60.8  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1877  Heavy metal transport/detoxification protein  44.62 
 
 
65 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  42.86 
 
 
67 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  42.86 
 
 
67 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6797  Heavy metal transport/detoxification protein  43.75 
 
 
70 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
69 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4238  Heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 
68 aa  60.1  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  50.82 
 
 
71 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  42.37 
 
 
78 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  44.44 
 
 
70 aa  58.2  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  42.42 
 
 
67 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2601  Heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 
68 aa  57.4  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854669  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0467  Heavy metal transport/detoxification protein  46.77 
 
 
70 aa  56.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1572  heavy metal translocating P-type ATPase  51.67 
 
 
856 aa  56.2  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10610  copper chaperone  50 
 
 
69 aa  55.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201144  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3668  Heavy metal transport/detoxification protein  46.77 
 
 
74 aa  55.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2139  heavy metal transport/detoxification protein  49.18 
 
 
66 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2847  heavy metal transport/detoxification protein  45.61 
 
 
115 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.179669 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  41.94 
 
 
68 aa  55.1  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3726  copper ion binding protein  46.88 
 
 
64 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.663439  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  38.98 
 
 
69 aa  55.1  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  45.31 
 
 
71 aa  54.3  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  38.71 
 
 
68 aa  54.3  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4497  heavy metal transport/detoxification protein  45.61 
 
 
69 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.499051 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  42.19 
 
 
67 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0890  mercuric reductase  40.32 
 
 
66 aa  52.8  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000328424  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2375  heavy metal-binding domain-containing protein  38.46 
 
 
67 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00029773  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36140  copper chaperone  38.03 
 
 
100 aa  52.4  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.237573  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 
65 aa  52.4  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1163  copper ion binding protein  46.77 
 
 
74 aa  52.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0131  Heavy metal transport/detoxification protein  49.06 
 
 
67 aa  52.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0910  heavy metal transport/detoxification protein  42.19 
 
 
70 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  38.1 
 
 
69 aa  51.6  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1882  mercury ion binding protein  40.98 
 
 
68 aa  51.6  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.174635  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4552  heavy metal transport/detoxification protein  43.86 
 
 
70 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939957  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0783  Heavy metal transport/detoxification protein  43.86 
 
 
69 aa  51.2  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.591809  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1149  copper ion binding protein  46.77 
 
 
74 aa  51.2  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  40.62 
 
 
954 aa  50.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1741  Heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 
73 aa  50.8  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.246039  decreased coverage  0.0020488 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  39.06 
 
 
68 aa  50.4  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04940  copper chaperone  45.9 
 
 
109 aa  50.4  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1538  Heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 
74 aa  50.4  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0133712 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1862  heavy metal-binding protein, putative  41.94 
 
 
74 aa  50.4  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0143  Heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 
65 aa  49.7  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.816482  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  52.54 
 
 
67 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1468  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
70 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  52.54 
 
 
67 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  52.54 
 
 
67 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  40.32 
 
 
68 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  40.32 
 
 
68 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4022  Heavy metal transport/detoxification protein  40.3 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0674  Heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 
68 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3258  Heavy metal transport/detoxification protein  37.31 
 
 
160 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19780  copper chaperone  45.61 
 
 
71 aa  48.9  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208404  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  44.07 
 
 
67 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  37.5 
 
 
67 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1450  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
113 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  37.88 
 
 
976 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36750  copper chaperone  38.33 
 
 
68 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  39.06 
 
 
835 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1291  Heavy metal transport/detoxification protein  43.55 
 
 
69 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0460  heavy metal translocating P-type ATPase  42.37 
 
 
748 aa  48.5  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.792118  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18380  copper chaperone  44.26 
 
 
109 aa  48.1  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  50.82 
 
 
826 aa  48.5  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1697  copper ion-binding  39.68 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000580158  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13340  Heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000868167  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4448  heavy metal transport/detoxification protein  36.67 
 
 
67 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866926  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2271  mercuric transport protein periplasmic component  42.62 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.618304  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  41.67 
 
 
839 aa  48.1  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  41.67 
 
 
70 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  34.92 
 
 
68 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  38.98 
 
 
69 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1795  Heavy metal transport/detoxification protein  37.29 
 
 
75 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 
76 aa  47.4  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0014  copper ion binding protein  43.55 
 
 
75 aa  47.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  36.21 
 
 
548 aa  47  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  49.18 
 
 
827 aa  47  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3218  Heavy metal transport/detoxification protein  48.28 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  38.71 
 
 
942 aa  46.6  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  37.29 
 
 
69 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2500  Heavy metal transport/detoxification protein  38.57 
 
 
117 aa  46.2  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.711261 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3544  Heavy metal transport/detoxification protein  46.55 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.480212 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0141  Heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  36.07 
 
 
817 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  39.06 
 
 
65 aa  45.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  36.67 
 
 
77 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2097  heavy metal transport/detoxification protein  37.31 
 
 
72 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.712519 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2449  Heavy metal transport/detoxification protein  37.1 
 
 
64 aa  45.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228051  normal  0.0680079 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0162  Heavy metal transport/detoxification protein  36.84 
 
 
228 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.988191  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3377  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
66 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1492  heavy metal transport/detoxification protein  42.62 
 
 
102 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>