More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0014 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0014  copper ion binding protein  100 
 
 		 75 aa  149  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  66.15 
 
 		 68 aa  91.7  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  67.19 
 
 		 70 aa  88.2  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  65.62 
 
 		 69 aa  87  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  61.54 
 
 		 68 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2601  Heavy metal transport/detoxification protein  59.38 
 
 		 68 aa  81.3  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854669  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  55.22 
 
 		 69 aa  81.6  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4238  Heavy metal transport/detoxification protein  57.81 
 
 		 68 aa  80.5  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  56.25 
 
 		 71 aa  80.5  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4548  Heavy metal transport/detoxification protein  68.42 
 
 		 70 aa  80.1  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  54.55 
 
 		 78 aa  77  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3354  heavy metal transport/detoxification protein  64.52 
 
 		 66 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.702383 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1695  Heavy metal transport/detoxification protein  70.31 
 
 		 69 aa  76.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.583772  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2471  Heavy metal transport/detoxification protein  61.54 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4497  heavy metal transport/detoxification protein  58.46 
 
 		 69 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.499051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9003  hypothetical protein  69.84 
 
 		 67 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.961553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  53.12 
 
 		 69 aa  74.3  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4448  heavy metal transport/detoxification protein  52.31 
 
 		 67 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866926  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  58.21 
 
 		 76 aa  72.4  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0674  Heavy metal transport/detoxification protein  56.45 
 
 		 68 aa  72.4  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10610  copper chaperone  53.85 
 
 		 69 aa  72.4  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6797  Heavy metal transport/detoxification protein  57.81 
 
 		 70 aa  70.5  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1468  heavy metal transport/detoxification protein  53.85 
 
 		 70 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19780  copper chaperone  52.31 
 
 		 71 aa  69.7  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208404  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4552  heavy metal transport/detoxification protein  52.31 
 
 		 70 aa  68.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4020  Heavy metal transport/detoxification protein  54.84 
 
 		 76 aa  68.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.343869 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1450  heavy metal transport/detoxification protein  53.85 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  49.23 
 
 		 69 aa  68.2  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  52.38 
 
 		 77 aa  67.8  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1741  Heavy metal transport/detoxification protein  49.28 
 
 		 73 aa  67  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.246039  decreased coverage  0.0020488 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5745  heavy metal transport/detoxification protein  60.71 
 
 		 68 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36750  copper chaperone  56.67 
 
 		 68 aa  65.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3668  Heavy metal transport/detoxification protein  52.78 
 
 		 74 aa  64.7  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4588  heavy metal transport/detoxification protein  44.12 
 
 		 73 aa  64.7  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2847  heavy metal transport/detoxification protein  50.77 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.179669 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0783  Heavy metal transport/detoxification protein  49.23 
 
 		 69 aa  64.3  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.591809  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 69 aa  64.3  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6893  heavy metal translocating P-type ATPase  43.06 
 
 		 872 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.172746  normal  0.265411 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0910  heavy metal transport/detoxification protein  50.77 
 
 		 70 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1163  Heavy metal transport/detoxification protein  61.02 
 
 		 70 aa  62.8  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3258  Heavy metal transport/detoxification protein  48.48 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  48.28 
 
 		 827 aa  62  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4098  heavy metal transport/detoxification protein  47.95 
 
 		 76 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  46.03 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21360  copper chaperone  58.82 
 
 		 72 aa  61.6  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.883325  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  43.75 
 
 		 70 aa  62  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1795  Heavy metal transport/detoxification protein  48.39 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0131  Heavy metal transport/detoxification protein  42.03 
 
 		 67 aa  61.6  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0015  hypothetical protein  55.74 
 
 		 93 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3872  Heavy metal transport/detoxification protein  47.22 
 
 		 79 aa  60.8  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330902 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0467  Heavy metal transport/detoxification protein  49.21 
 
 		 70 aa  60.5  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2500  Heavy metal transport/detoxification protein  46.27 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.711261 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5304  heavy metal transport/detoxification protein  48.39 
 
 		 80 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562582  normal  0.337627 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5705  heavy metal transport/detoxification protein  48.39 
 
 		 80 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36140  copper chaperone  47.76 
 
 		 100 aa  59.7  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.237573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  47.62 
 
 		 67 aa  59.7  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3669  heavy metal transport/detoxification protein  43.66 
 
 		 80 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.792064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 		 1182 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0141  Heavy metal transport/detoxification protein  44.78 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  45.59 
 
 		 835 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3701  copper-translocating P-type ATPase  74.24 
 
 		 70 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.754516  normal  0.0828081 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3704  hypothetical protein  54.1 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660005  normal  0.139636 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  46.77 
 
 		 855 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0489  heavy metal transport/detoxification protein  48.33 
 
 		 74 aa  57.8  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0021  copper ion binding protein  41.79 
 
 		 70 aa  57.8  0.00000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00208737  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1715  copper ion binding protein  42.42 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0879446  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3412  copper ion binding protein  41.79 
 
 		 74 aa  57  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0277616 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  42.19 
 
 		 852 aa  57  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  37.5 
 
 		 76 aa  57  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3169  Heavy metal transport/detoxification protein  43.55 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145614 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  42.42 
 
 		 67 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0030  Heavy metal transport/detoxification protein  46.15 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  43.33 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1659  copper ion binding protein  50 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.842806 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  42.42 
 
 		 68 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2279  copper ion binding protein  43.08 
 
 		 69 aa  55.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6127  heavy metal transport/detoxification protein  53.23 
 
 		 74 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0154405  normal  0.535186 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2449  Heavy metal transport/detoxification protein  46.88 
 
 		 64 aa  55.1  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228051  normal  0.0680079 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  43.08 
 
 		 67 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  43.08 
 
 		 67 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  43.08 
 
 		 67 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  47.62 
 
 		 827 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  40.32 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2344  heavy metal transport/detoxification protein  42.67 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177246  normal  0.640868 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0033  heavy metal transport/detoxification protein  44.62 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  50 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  40.32 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2465  heavy metal transport/detoxification protein  44.62 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.677036  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0115  Heavy metal transport/detoxification protein  43.48 
 
 		 73 aa  54.3  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2168  copper-translocating P-type ATPase  43.1 
 
 		 971 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4022  Heavy metal transport/detoxification protein  46.15 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  42.42 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  38.81 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4777  heavy metal translocating P-type ATPase  45.61 
 
 		 1013 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.701128 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  38.57 
 
 		 827 aa  54.3  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  43.1 
 
 		 826 aa  53.9  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  39.06 
 
 		 839 aa  53.9  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  40.62 
 
 		 833 aa  53.9  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0420  Heavy metal transport/detoxification protein  45.31 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1572  heavy metal translocating P-type ATPase  40.62 
 
 		 856 aa  53.5  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>