More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0162 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0162  Heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 228 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.988191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  96.92 
 
 		 473 aa  428  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2107  putative mercuric reductase  61.54 
 
 		 547 aa  259  2e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2481  putative mercuric reductase  61.54 
 
 		 547 aa  259  2e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0761993  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1298  putative mercuric reductase  56.57 
 
 		 562 aa  251  8.000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.881891 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1787  putative mercuric reductase  61.44 
 
 		 561 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152452  normal  0.329261 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1209  mercuric reductase  58.05 
 
 		 565 aa  241  6e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.375903  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0090  putative mercuric reductase  58.3 
 
 		 560 aa  241  7e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1340  putative mercuric reductase  57.02 
 
 		 562 aa  234  8e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.657387  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2228  putative mercuric reductase  57.63 
 
 		 561 aa  233  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0045  putative mercuric reductase  58.9 
 
 		 564 aa  232  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00619698  normal  0.422186 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2133  putative mercuric reductase  58.9 
 
 		 564 aa  232  4.0000000000000004e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0483  putative mercuric reductase  57.5 
 
 		 562 aa  230  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6495  putative mercuric reductase  56.54 
 
 		 561 aa  226  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0104  putative mercuric reductase  56.54 
 
 		 561 aa  226  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.57639  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6174  putative mercuric reductase  56.54 
 
 		 561 aa  226  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00111286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6183  putative mercuric reductase  56.54 
 
 		 561 aa  226  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00236829  unclonable  0.0000000913433 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15460  putative mercuric reductase  56.54 
 
 		 561 aa  226  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000698922  unclonable  2.1869799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2338  putative mercuric reductase  56.54 
 
 		 561 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1213  putative mercuric reductase  53.81 
 
 		 561 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0165  putative mercuric reductase  54.66 
 
 		 561 aa  218  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4345  putative mercuric reductase  52.97 
 
 		 561 aa  216  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0242  putative mercuric reductase  68.35 
 
 		 467 aa  201  6e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02949  putative mercuric reductase  68.35 
 
 		 503 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187984  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1341  putative mercuric reductase  51.98 
 
 		 541 aa  186  3e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.183471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4010  putative mercuric reductase  68.35 
 
 		 468 aa  177  9e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2758  putative mercuric reductase  71.22 
 
 		 468 aa  176  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4311  putative mercuric reductase  44.78 
 
 		 551 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0168  putative mercuric reductase  43.42 
 
 		 550 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1392  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  66.67 
 
 		 417 aa  171  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3488  putative mercuric reductase  44.25 
 
 		 552 aa  164  8e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.852286  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01408  putative mercuric reductase  57.53 
 
 		 479 aa  154  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02044  putative mercuric reductase  55.94 
 
 		 479 aa  148  8e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.985853  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  37.68 
 
 		 546 aa  132  5e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  37.68 
 
 		 546 aa  132  6e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  33.82 
 
 		 546 aa  118  9e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  37.25 
 
 		 546 aa  115  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  40.98 
 
 		 548 aa  108  8.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  37.25 
 
 		 550 aa  98.6  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  46.96 
 
 		 767 aa  93.6  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  40.6 
 
 		 475 aa  91.3  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0840  mercuric reductase  43.36 
 
 		 469 aa  90.1  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0640  mercuric reductase  40.85 
 
 		 468 aa  89.4  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0654  mercuric reductase  40.85 
 
 		 468 aa  89.7  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.87809e-24 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1388  mercuric reductase  41.88 
 
 		 557 aa  87.8  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000433137  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  41.27 
 
 		 767 aa  87.8  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0177  mercuric reductase MerA  38.51 
 
 		 469 aa  85.9  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  41.35 
 
 		 745 aa  85.1  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1148  mercuric reductase  43.85 
 
 		 457 aa  82.4  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2479  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.93 
 
 		 467 aa  81.6  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3424  mercuric reductase  38.41 
 
 		 468 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0616  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.56 
 
 		 466 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4946  mercuric reductase  42.18 
 
 		 476 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104965  decreased coverage  0.00400898 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0740  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.46 
 
 		 469 aa  80.1  0.00000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.010396  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2512  mercuric reductase MerA  43.24 
 
 		 479 aa  79.7  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10469  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.39 
 
 		 464 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05840  dihydrolipoyl dehydrogenase, putative  33.76 
 
 		 511 aa  77.8  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.465888  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0690  mercuric reductase  45.71 
 
 		 481 aa  77  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192452  normal  0.6373 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.35 
 
 		 470 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.85 
 
 		 470 aa  77  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11020  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.76 
 
 		 465 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.874516 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  36.03 
 
 		 457 aa  77  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1241  mercuric reductase  39.67 
 
 		 448 aa  76.6  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.446801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2329  mercuric reductase  44.35 
 
 		 476 aa  76.3  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3520  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.33 
 
 		 602 aa  75.9  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.501053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0256  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  38.3 
 
 		 484 aa  75.9  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1778  mercuric reductase  42.54 
 
 		 480 aa  75.9  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.3364  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1003  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.57 
 
 		 594 aa  75.1  0.0000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.851611  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.85 
 
 		 470 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.85 
 
 		 470 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.85 
 
 		 470 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.85 
 
 		 470 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.85 
 
 		 470 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.85 
 
 		 470 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.85 
 
 		 470 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1981  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.21 
 
 		 603 aa  75.1  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.01171  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1363  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.87 
 
 		 448 aa  74.7  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.91 
 
 		 467 aa  74.7  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0624  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.56 
 
 		 466 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  0.337004 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2534  NADPH-glutathione reductase  38.64 
 
 		 451 aa  74.7  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23107 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0426  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.5 
 
 		 475 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.15 
 
 		 470 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3468  mercuric reductase  39.02 
 
 		 457 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0794  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.69 
 
 		 464 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0822036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0430  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.5 
 
 		 475 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3597  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.5 
 
 		 475 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000546829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0428  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.5 
 
 		 475 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00251394  normal  0.166632 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.86 
 
 		 470 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5475  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.09 
 
 		 466 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67474  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.86 
 
 		 470 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.86 
 
 		 470 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5611  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.29 
 
 		 573 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.236568 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1911  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.53 
 
 		 603 aa  73.2  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00687521  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4961  mercuric reductase  32 
 
 		 460 aa  73.2  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3815  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.97 
 
 		 468 aa  73.2  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1554  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.57 
 
 		 589 aa  73.2  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1504  mercuric reductase  36.29 
 
 		 453 aa  72.8  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.25653 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3543  glutathione reductase  33.05 
 
 		 451 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.03 
 
 		 562 aa  73.2  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06120  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.25 
 
 		 464 aa  72.8  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140424  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>