More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2228 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0483  putative mercuric reductase  77.28 
 
 
562 aa  821    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0090  putative mercuric reductase  75.76 
 
 
560 aa  823    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1209  mercuric reductase  84.25 
 
 
565 aa  911    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.375903  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1340  putative mercuric reductase  74.6 
 
 
562 aa  804    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.657387  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2107  putative mercuric reductase  77.14 
 
 
547 aa  838    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1298  putative mercuric reductase  79.75 
 
 
562 aa  851    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.881891 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2338  putative mercuric reductase  85.74 
 
 
561 aa  938    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243851  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6495  putative mercuric reductase  85.56 
 
 
561 aa  936    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0104  putative mercuric reductase  85.56 
 
 
561 aa  936    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.57639  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0045  putative mercuric reductase  83.54 
 
 
564 aa  910    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00619698  normal  0.422186 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2228  putative mercuric reductase  100 
 
 
561 aa  1132    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1213  putative mercuric reductase  86.81 
 
 
561 aa  951    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6174  putative mercuric reductase  85.56 
 
 
561 aa  936    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00111286  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6183  putative mercuric reductase  85.56 
 
 
561 aa  936    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00236829  unclonable  0.0000000913433 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2481  putative mercuric reductase  77.32 
 
 
547 aa  840    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0761993  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0165  putative mercuric reductase  85.74 
 
 
561 aa  938    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2133  putative mercuric reductase  83.36 
 
 
564 aa  909    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1787  putative mercuric reductase  85.38 
 
 
561 aa  929    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152452  normal  0.329261 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02949  putative mercuric reductase  69.46 
 
 
503 aa  652    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187984  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15460  putative mercuric reductase  85.74 
 
 
561 aa  937    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000698922  unclonable  2.1869799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4345  putative mercuric reductase  85.56 
 
 
561 aa  933    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0242  putative mercuric reductase  70.04 
 
 
467 aa  661    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4311  putative mercuric reductase  55.77 
 
 
551 aa  619  1e-176  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2758  putative mercuric reductase  68.32 
 
 
468 aa  615  1e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0168  putative mercuric reductase  54.8 
 
 
550 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01408  putative mercuric reductase  62.37 
 
 
479 aa  589  1e-167  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4010  putative mercuric reductase  66.38 
 
 
468 aa  591  1e-167  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1341  putative mercuric reductase  58.42 
 
 
541 aa  585  1e-166  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.183471  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3488  putative mercuric reductase  54.56 
 
 
552 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.852286  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02044  putative mercuric reductase  56.56 
 
 
479 aa  527  1e-148  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.985853  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  64.81 
 
 
473 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  40.88 
 
 
546 aa  393  1e-108  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  40.71 
 
 
546 aa  389  1e-107  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  40.28 
 
 
546 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  47.8 
 
 
767 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  47.67 
 
 
745 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  44.42 
 
 
550 aa  385  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  46.57 
 
 
475 aa  379  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  43.46 
 
 
546 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  47.67 
 
 
767 aa  373  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2512  mercuric reductase MerA  46.65 
 
 
479 aa  366  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  42.68 
 
 
548 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1148  mercuric reductase  45.47 
 
 
457 aa  348  2e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0690  mercuric reductase  45.09 
 
 
481 aa  332  1e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192452  normal  0.6373 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4946  mercuric reductase  43.76 
 
 
476 aa  327  3e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104965  decreased coverage  0.00400898 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1388  mercuric reductase  41.48 
 
 
557 aa  327  3e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000433137  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2329  mercuric reductase  43.15 
 
 
476 aa  325  2e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2649  mercuric reductase  44.37 
 
 
478 aa  317  3e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3213  mercuric reductase  43.4 
 
 
467 aa  317  3e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163863  normal  0.231896 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1778  mercuric reductase  40.25 
 
 
480 aa  315  9.999999999999999e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.3364  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4511  mercuric reductase  41.86 
 
 
482 aa  315  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00955631 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4465  mercuric reductase  42 
 
 
476 aa  314  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4296  mercuric reductase  42 
 
 
476 aa  314  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4196  mercuric reductase  42 
 
 
476 aa  314  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25620  mercuric reductase  43.04 
 
 
474 aa  312  7.999999999999999e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06150  mercuric reductase  43.04 
 
 
474 aa  312  7.999999999999999e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0640  mercuric reductase  40.34 
 
 
468 aa  301  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0654  mercuric reductase  39.62 
 
 
468 aa  301  2e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.87809e-24 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0177  mercuric reductase MerA  38.16 
 
 
469 aa  289  9e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0840  mercuric reductase  37.23 
 
 
469 aa  286  5e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3424  mercuric reductase  37.47 
 
 
468 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1504  mercuric reductase  37.12 
 
 
453 aa  283  5.000000000000001e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.25653 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5372  mercuric reductase  40.27 
 
 
477 aa  282  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3663  mercuric reductase  39.59 
 
 
458 aa  281  3e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2009  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  41.63 
 
 
471 aa  280  4e-74  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1213  mercuric reductase  35.33 
 
 
464 aa  274  3e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1241  mercuric reductase  37.96 
 
 
448 aa  273  5.000000000000001e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.446801  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0504  mercuric reductase  35.56 
 
 
449 aa  266  1e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4668  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.43 
 
 
482 aa  253  6e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2847  mercuric reductase  33.98 
 
 
484 aa  249  1e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1158  mercuric reductase  36.5 
 
 
484 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0843858  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.33 
 
 
717 aa  243  6e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2088  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.58 
 
 
484 aa  241  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  35.52 
 
 
722 aa  242  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2994  mercuric reductase  33.41 
 
 
485 aa  238  3e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1504  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.03 
 
 
462 aa  236  6e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.515089  normal  0.0466141 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0162  Heavy metal transport/detoxification protein  57.63 
 
 
228 aa  234  4.0000000000000004e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.988191  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1118  mercuric reductase  33.9 
 
 
516 aa  233  7.000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.583122  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6297  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.52 
 
 
466 aa  233  9e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  34.27 
 
 
704 aa  231  4e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  32.13 
 
 
738 aa  230  5e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0315  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.11 
 
 
471 aa  230  5e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4228  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.64 
 
 
482 aa  229  7e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.55 
 
 
475 aa  229  8e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.76 
 
 
475 aa  229  8e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.14 
 
 
482 aa  226  8e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  32.62 
 
 
716 aa  226  9e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1956  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.08 
 
 
480 aa  225  1e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.99 
 
 
712 aa  226  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.83 
 
 
473 aa  224  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.9 
 
 
470 aa  224  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0256  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  35.43 
 
 
484 aa  224  4.9999999999999996e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.18 
 
 
492 aa  223  8e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  31.4 
 
 
460 aa  222  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0352  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.17 
 
 
475 aa  223  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  31.22 
 
 
717 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1976  mercuric reductase  33.05 
 
 
515 aa  221  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121394  normal  0.267836 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.51 
 
 
456 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0751  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.47 
 
 
473 aa  220  3.9999999999999997e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.76 
 
 
717 aa  220  5e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>