More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0483 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1340  putative mercuric reductase  80.79 
 
 
562 aa  860    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.657387  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0483  putative mercuric reductase  100 
 
 
562 aa  1132    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6495  putative mercuric reductase  77.96 
 
 
561 aa  840    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0165  putative mercuric reductase  78.14 
 
 
561 aa  852    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0090  putative mercuric reductase  75.22 
 
 
560 aa  800    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2107  putative mercuric reductase  74.33 
 
 
547 aa  797    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1787  putative mercuric reductase  79.75 
 
 
561 aa  853    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152452  normal  0.329261 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2133  putative mercuric reductase  76.51 
 
 
564 aa  815    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1298  putative mercuric reductase  83.81 
 
 
562 aa  917    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.881891 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2228  putative mercuric reductase  77.28 
 
 
561 aa  822    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1213  putative mercuric reductase  77.06 
 
 
561 aa  838    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0045  putative mercuric reductase  76.69 
 
 
564 aa  816    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00619698  normal  0.422186 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0104  putative mercuric reductase  77.96 
 
 
561 aa  840    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.57639  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02949  putative mercuric reductase  70.39 
 
 
503 aa  656    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187984  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6174  putative mercuric reductase  77.78 
 
 
561 aa  839    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00111286  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6183  putative mercuric reductase  77.96 
 
 
561 aa  840    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00236829  unclonable  0.0000000913433 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2338  putative mercuric reductase  77.96 
 
 
561 aa  841    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243851  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1209  mercuric reductase  77.4 
 
 
565 aa  830    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.375903  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2481  putative mercuric reductase  74.51 
 
 
547 aa  798    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0761993  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15460  putative mercuric reductase  77.78 
 
 
561 aa  839    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000698922  unclonable  2.1869799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0242  putative mercuric reductase  70.82 
 
 
467 aa  664    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4345  putative mercuric reductase  79.21 
 
 
561 aa  858    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4311  putative mercuric reductase  55.89 
 
 
551 aa  619  1e-176  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2758  putative mercuric reductase  68.45 
 
 
468 aa  613  9.999999999999999e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0168  putative mercuric reductase  54.38 
 
 
550 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4010  putative mercuric reductase  66.74 
 
 
468 aa  592  1e-168  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3488  putative mercuric reductase  56.15 
 
 
552 aa  593  1e-168  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.852286  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01408  putative mercuric reductase  62.93 
 
 
479 aa  582  1.0000000000000001e-165  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1341  putative mercuric reductase  57.73 
 
 
541 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.183471  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02044  putative mercuric reductase  56.93 
 
 
479 aa  537  1e-151  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.985853  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  63.16 
 
 
473 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  41.87 
 
 
546 aa  409  1e-113  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  41.7 
 
 
546 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  41.34 
 
 
546 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  44.21 
 
 
550 aa  382  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  46.99 
 
 
767 aa  381  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  46.93 
 
 
475 aa  381  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  46.64 
 
 
767 aa  375  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  47.12 
 
 
745 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  42.58 
 
 
546 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  47.11 
 
 
548 aa  370  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2512  mercuric reductase MerA  46.54 
 
 
479 aa  359  8e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0690  mercuric reductase  46.3 
 
 
481 aa  339  9e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192452  normal  0.6373 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1148  mercuric reductase  44.13 
 
 
457 aa  334  2e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1388  mercuric reductase  41.29 
 
 
557 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000433137  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3213  mercuric reductase  44.14 
 
 
467 aa  323  4e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163863  normal  0.231896 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1778  mercuric reductase  40.98 
 
 
480 aa  322  9.999999999999999e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.3364  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4946  mercuric reductase  42.62 
 
 
476 aa  319  7.999999999999999e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104965  decreased coverage  0.00400898 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2329  mercuric reductase  43.75 
 
 
476 aa  318  2e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0654  mercuric reductase  41.26 
 
 
468 aa  316  6e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.87809e-24 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4511  mercuric reductase  42.28 
 
 
482 aa  313  4.999999999999999e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00955631 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0840  mercuric reductase  40.47 
 
 
469 aa  313  6.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0177  mercuric reductase MerA  40.09 
 
 
469 aa  311  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0640  mercuric reductase  41.31 
 
 
468 aa  311  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2649  mercuric reductase  44.47 
 
 
478 aa  309  1.0000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3424  mercuric reductase  40.26 
 
 
468 aa  306  9.000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06150  mercuric reductase  42.89 
 
 
474 aa  304  2.0000000000000002e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4465  mercuric reductase  40.67 
 
 
476 aa  304  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4296  mercuric reductase  40.67 
 
 
476 aa  304  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4196  mercuric reductase  40.67 
 
 
476 aa  304  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25620  mercuric reductase  42.68 
 
 
474 aa  303  5.000000000000001e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1504  mercuric reductase  36.85 
 
 
453 aa  290  4e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.25653 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1241  mercuric reductase  38.53 
 
 
448 aa  287  4e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.446801  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3663  mercuric reductase  40.27 
 
 
458 aa  286  5.999999999999999e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0504  mercuric reductase  37.39 
 
 
449 aa  281  2e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5372  mercuric reductase  40.04 
 
 
477 aa  278  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2009  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  41.24 
 
 
471 aa  279  1e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1213  mercuric reductase  34.98 
 
 
464 aa  268  2e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1504  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.57 
 
 
462 aa  253  6e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.515089  normal  0.0466141 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1118  mercuric reductase  34.09 
 
 
516 aa  252  1e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.583122  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2847  mercuric reductase  34.16 
 
 
484 aa  252  1e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2994  mercuric reductase  32.51 
 
 
485 aa  242  1e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6297  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.86 
 
 
466 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4668  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.98 
 
 
482 aa  240  4e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  32.82 
 
 
460 aa  239  8e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1158  mercuric reductase  36.98 
 
 
484 aa  238  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0843858  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.33 
 
 
475 aa  238  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.55 
 
 
475 aa  238  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2088  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.12 
 
 
484 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1598  mercuric reductase  32.85 
 
 
510 aa  233  5e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0315  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.5 
 
 
471 aa  233  6e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  36.44 
 
 
722 aa  231  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4228  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.98 
 
 
482 aa  230  4e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0162  Heavy metal transport/detoxification protein  57.5 
 
 
228 aa  230  5e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.988191  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  33.62 
 
 
704 aa  229  8e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4961  mercuric reductase  30.24 
 
 
460 aa  229  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  33.12 
 
 
716 aa  229  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3749  mercuric reductase  35.05 
 
 
510 aa  228  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0336  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  32.89 
 
 
441 aa  227  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.77 
 
 
473 aa  227  4e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.11 
 
 
470 aa  226  7e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3301  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  32.89 
 
 
441 aa  226  9e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3318  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  32.89 
 
 
441 aa  226  9e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0335  putative mercuric reductase MerA  35.53 
 
 
470 aa  226  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0257756  normal  0.865003 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0356  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  32.89 
 
 
441 aa  225  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.488111  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0298  hypothetical protein  31.9 
 
 
464 aa  225  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.94 
 
 
482 aa  224  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0314  hypothetical protein  31.67 
 
 
464 aa  224  3e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.28 
 
 
456 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1459  mercuric reductase  39 
 
 
464 aa  224  3e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>