More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0104 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0483  putative mercuric reductase  77.96 
 
 
562 aa  839    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2107  putative mercuric reductase  78.93 
 
 
547 aa  854    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1787  putative mercuric reductase  83.96 
 
 
561 aa  918    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152452  normal  0.329261 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0242  putative mercuric reductase  71.49 
 
 
467 aa  674    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1340  putative mercuric reductase  75.63 
 
 
562 aa  806    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.657387  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6495  putative mercuric reductase  100 
 
 
561 aa  1138    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2481  putative mercuric reductase  79.11 
 
 
547 aa  856    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0761993  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0090  putative mercuric reductase  75.58 
 
 
560 aa  822    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1209  mercuric reductase  85.13 
 
 
565 aa  923    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.375903  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0165  putative mercuric reductase  90.91 
 
 
561 aa  1000    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2228  putative mercuric reductase  85.56 
 
 
561 aa  936    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1213  putative mercuric reductase  91.62 
 
 
561 aa  1010    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6174  putative mercuric reductase  99.64 
 
 
561 aa  1135    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00111286  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6183  putative mercuric reductase  100 
 
 
561 aa  1138    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00236829  unclonable  0.0000000913433 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2338  putative mercuric reductase  99.82 
 
 
561 aa  1136    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243851  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0104  putative mercuric reductase  100 
 
 
561 aa  1138    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.57639  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02949  putative mercuric reductase  70.84 
 
 
503 aa  664    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187984  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0045  putative mercuric reductase  85.49 
 
 
564 aa  931    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00619698  normal  0.422186 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15460  putative mercuric reductase  99.47 
 
 
561 aa  1134    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000698922  unclonable  2.1869799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1298  putative mercuric reductase  78.85 
 
 
562 aa  843    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.881891 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4345  putative mercuric reductase  92.87 
 
 
561 aa  1014    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2133  putative mercuric reductase  85.31 
 
 
564 aa  930    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4311  putative mercuric reductase  57.09 
 
 
551 aa  623  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2758  putative mercuric reductase  67.67 
 
 
468 aa  613  9.999999999999999e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0168  putative mercuric reductase  55.14 
 
 
550 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4010  putative mercuric reductase  67.45 
 
 
468 aa  597  1e-169  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3488  putative mercuric reductase  55.79 
 
 
552 aa  586  1e-166  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.852286  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1341  putative mercuric reductase  58.42 
 
 
541 aa  578  1e-164  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.183471  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01408  putative mercuric reductase  60.78 
 
 
479 aa  569  1e-161  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02044  putative mercuric reductase  56.68 
 
 
479 aa  524  1e-147  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.985853  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  62.63 
 
 
473 aa  455  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  45.04 
 
 
550 aa  404  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  41.17 
 
 
546 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  40.99 
 
 
546 aa  395  1e-108  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  41.34 
 
 
546 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  48.18 
 
 
767 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  47.46 
 
 
745 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  46.72 
 
 
475 aa  382  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  43.46 
 
 
546 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  42.4 
 
 
548 aa  380  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  47.3 
 
 
767 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2512  mercuric reductase MerA  47.32 
 
 
479 aa  367  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1148  mercuric reductase  45.16 
 
 
457 aa  345  2e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0690  mercuric reductase  47 
 
 
481 aa  344  2e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192452  normal  0.6373 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2649  mercuric reductase  47.25 
 
 
478 aa  333  6e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1388  mercuric reductase  41.36 
 
 
557 aa  333  6e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000433137  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2329  mercuric reductase  44.17 
 
 
476 aa  327  3e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4946  mercuric reductase  44.04 
 
 
476 aa  325  2e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104965  decreased coverage  0.00400898 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3213  mercuric reductase  43.68 
 
 
467 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163863  normal  0.231896 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4511  mercuric reductase  42.83 
 
 
482 aa  318  2e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00955631 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4465  mercuric reductase  41.78 
 
 
476 aa  317  3e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4296  mercuric reductase  41.78 
 
 
476 aa  317  3e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4196  mercuric reductase  41.78 
 
 
476 aa  317  3e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1778  mercuric reductase  40.25 
 
 
480 aa  317  3e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.3364  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0640  mercuric reductase  41.51 
 
 
468 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0654  mercuric reductase  41.1 
 
 
468 aa  311  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.87809e-24 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06150  mercuric reductase  43.22 
 
 
474 aa  308  1.0000000000000001e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25620  mercuric reductase  43.01 
 
 
474 aa  308  2.0000000000000002e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0840  mercuric reductase  38.22 
 
 
469 aa  301  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3424  mercuric reductase  38.09 
 
 
468 aa  293  6e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0177  mercuric reductase MerA  37.95 
 
 
469 aa  290  3e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1504  mercuric reductase  37.93 
 
 
453 aa  290  6e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.25653 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3663  mercuric reductase  40.27 
 
 
458 aa  290  7e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2009  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  42.37 
 
 
471 aa  288  2e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5372  mercuric reductase  40.26 
 
 
477 aa  284  3.0000000000000004e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1213  mercuric reductase  36.44 
 
 
464 aa  283  6.000000000000001e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0504  mercuric reductase  35.43 
 
 
449 aa  278  2e-73  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1241  mercuric reductase  37.31 
 
 
448 aa  277  3e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.446801  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1158  mercuric reductase  38.9 
 
 
484 aa  263  6.999999999999999e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0843858  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2847  mercuric reductase  34.42 
 
 
484 aa  262  2e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4668  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.79 
 
 
482 aa  255  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0315  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37 
 
 
471 aa  246  6e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.1 
 
 
482 aa  243  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.47 
 
 
470 aa  240  5e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2994  mercuric reductase  33.41 
 
 
485 aa  240  5e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2088  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.39 
 
 
484 aa  239  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1504  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.94 
 
 
462 aa  238  2e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.515089  normal  0.0466141 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.34 
 
 
717 aa  238  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4228  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.66 
 
 
482 aa  238  3e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  35.15 
 
 
704 aa  236  6e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1598  mercuric reductase  32.99 
 
 
510 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0335  putative mercuric reductase MerA  35.5 
 
 
470 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0257756  normal  0.865003 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1118  mercuric reductase  33.12 
 
 
516 aa  235  2.0000000000000002e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.583122  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1956  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.5 
 
 
480 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0352  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.53 
 
 
475 aa  234  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6297  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.96 
 
 
466 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.51 
 
 
470 aa  232  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3749  mercuric reductase  33.73 
 
 
510 aa  231  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.48 
 
 
475 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  35.05 
 
 
722 aa  232  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3132  mercuric reductase  31.83 
 
 
504 aa  231  3e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.26 
 
 
475 aa  231  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3775  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.12 
 
 
476 aa  229  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000442431  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  31.7 
 
 
460 aa  228  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3932  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.12 
 
 
475 aa  228  3e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000133391  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0426  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.92 
 
 
475 aa  226  6e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4052  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.92 
 
 
475 aa  226  7e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00676379  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0430  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.92 
 
 
475 aa  226  7e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3597  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.92 
 
 
475 aa  226  7e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000546829  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3854  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.92 
 
 
475 aa  226  8e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.075768  hitchhiker  0.000000345632 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>