More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0740 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0048  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.13 
 
 
472 aa  652    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0331  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.44 
 
 
473 aa  703    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0740  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
469 aa  949    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.010396  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.58 
 
 
468 aa  505  9.999999999999999e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.8 
 
 
468 aa  504  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00928669  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.8 
 
 
468 aa  504  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000305556  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.94 
 
 
470 aa  496  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.09 
 
 
470 aa  491  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.91 
 
 
470 aa  484  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.06 
 
 
470 aa  478  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.06 
 
 
470 aa  478  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.06 
 
 
470 aa  478  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.85 
 
 
470 aa  477  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.64 
 
 
470 aa  475  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.85 
 
 
470 aa  477  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.85 
 
 
470 aa  477  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.64 
 
 
470 aa  475  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.64 
 
 
470 aa  475  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.43 
 
 
470 aa  473  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0634  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.05 
 
 
475 aa  469  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000338686  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.94 
 
 
470 aa  466  9.999999999999999e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2393  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.89 
 
 
459 aa  463  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0110453  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0271  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.01 
 
 
593 aa  361  2e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.146735  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1998  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.41 
 
 
481 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.31 
 
 
475 aa  348  2e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6500  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.91 
 
 
465 aa  346  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.264998  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4388  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.04 
 
 
465 aa  346  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2076  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.36 
 
 
588 aa  344  2e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0962  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.2 
 
 
462 aa  342  7e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.44 
 
 
480 aa  342  7e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.354559  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.98 
 
 
462 aa  341  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.77 
 
 
463 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3002  pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  42.76 
 
 
473 aa  339  7e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.32 
 
 
462 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.77 
 
 
484 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1035  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.4 
 
 
593 aa  336  3.9999999999999995e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.356313  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03103  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.52 
 
 
607 aa  336  3.9999999999999995e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3520  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.28 
 
 
602 aa  336  5e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.501053  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1805  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.6 
 
 
616 aa  336  5.999999999999999e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1468  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.12 
 
 
685 aa  335  7e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0186247  normal  0.515746 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.34 
 
 
484 aa  335  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3687  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.72 
 
 
478 aa  335  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43970  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.72 
 
 
478 aa  335  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0508378  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.13 
 
 
484 aa  334  2e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.8 
 
 
467 aa  334  2e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6299  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.83 
 
 
625 aa  334  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0179219 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1911  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.81 
 
 
603 aa  334  3e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00687521  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5441  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.33 
 
 
588 aa  333  4e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1981  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.59 
 
 
603 aa  333  4e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.01171  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1500  pyruvate dehydrogenase complex E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  40.87 
 
 
589 aa  332  6e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.628337  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1719  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  40.87 
 
 
589 aa  332  6e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0148218  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2743  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  40.87 
 
 
589 aa  333  6e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2228  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  40.87 
 
 
589 aa  332  6e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.467573  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2045  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.33 
 
 
592 aa  333  6e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2610  pyruvate dehydrogenase complex E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  40.87 
 
 
589 aa  333  6e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3092  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  40.87 
 
 
589 aa  332  6e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0122251  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5942  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.11 
 
 
588 aa  333  6e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00253524  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2135  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.11 
 
 
588 aa  333  6e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.33 
 
 
492 aa  332  7.000000000000001e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2153  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.11 
 
 
590 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0291933  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2665  pyruvate dehydrogenase complex E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  40.87 
 
 
589 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6503  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.33 
 
 
592 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.120205  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0142  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.04 
 
 
475 aa  332  8e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.262371  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2829  dihydrolipoamide dehydrogenase  41 
 
 
464 aa  332  9e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2172  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.56 
 
 
588 aa  332  9e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1543  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.82 
 
 
603 aa  331  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.110052  normal  0.0211512 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1612  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.48 
 
 
474 aa  332  1e-89  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1135  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.42 
 
 
589 aa  331  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.373004  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4916  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.34 
 
 
595 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3247  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.34 
 
 
595 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.639352 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0527  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.69 
 
 
464 aa  331  2e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0571  dihydrolipoyl dehydrogenase, E3 component of pyruvate dehydrogenases complex  40.48 
 
 
474 aa  331  2e-89  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1866  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  41.11 
 
 
589 aa  330  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0837  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.97 
 
 
462 aa  331  2e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0629808 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.03 
 
 
464 aa  329  5.0000000000000004e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1719  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.19 
 
 
476 aa  329  6e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2589  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.6 
 
 
600 aa  329  7e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.835737  decreased coverage  0.000383256 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1093  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.08 
 
 
474 aa  329  7e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.136846  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2011  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.45 
 
 
478 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2623  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.08 
 
 
475 aa  328  1.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.798797  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2454  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.19 
 
 
579 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2201  2-oxoglutarate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  39.66 
 
 
478 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00788973  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1241  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.61 
 
 
599 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0459  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.47 
 
 
464 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1524  lipoamide dehydrogenase  41.43 
 
 
474 aa  327  4.0000000000000003e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.25 
 
 
594 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.308322 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1132  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.46 
 
 
464 aa  326  4.0000000000000003e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2965  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.39 
 
 
680 aa  326  6e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155449  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3510  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 
478 aa  325  7e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0716172  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1554  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.39 
 
 
589 aa  325  7e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7193  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.83 
 
 
619 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1667  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 
478 aa  325  9e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164593  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1126  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.05 
 
 
463 aa  325  9e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333956  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4187  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 
478 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1003  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.09 
 
 
594 aa  325  1e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.851611  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3360  dihydrolipoyl dehydrogenanse  41.76 
 
 
466 aa  325  1e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0306833 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1459  lipoamide dehydrogenase  41.21 
 
 
474 aa  324  2e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4651  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.19 
 
 
476 aa  324  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183592  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3504  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.83 
 
 
465 aa  324  2e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.305711 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.98 
 
 
476 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>