More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4311 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01408  putative mercuric reductase  79.66 
 
 
479 aa  768    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02044  putative mercuric reductase  71.43 
 
 
479 aa  677    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.985853  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0168  putative mercuric reductase  78.4 
 
 
550 aa  905    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3488  putative mercuric reductase  78.55 
 
 
552 aa  863    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.852286  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4311  putative mercuric reductase  100 
 
 
551 aa  1126    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2481  putative mercuric reductase  56.83 
 
 
547 aa  619  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0761993  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2107  putative mercuric reductase  56.65 
 
 
547 aa  617  1e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1298  putative mercuric reductase  57.07 
 
 
562 aa  600  1e-170  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.881891 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1341  putative mercuric reductase  59.74 
 
 
541 aa  600  1e-170  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.183471  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1213  putative mercuric reductase  55.75 
 
 
561 aa  598  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2338  putative mercuric reductase  57.27 
 
 
561 aa  596  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243851  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0045  putative mercuric reductase  57.67 
 
 
564 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00619698  normal  0.422186 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15460  putative mercuric reductase  57.09 
 
 
561 aa  595  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000698922  unclonable  2.1869799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0165  putative mercuric reductase  55.58 
 
 
561 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6495  putative mercuric reductase  57.09 
 
 
561 aa  594  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2133  putative mercuric reductase  57.5 
 
 
564 aa  593  1e-168  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0104  putative mercuric reductase  57.09 
 
 
561 aa  594  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.57639  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6174  putative mercuric reductase  57.09 
 
 
561 aa  594  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00111286  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6183  putative mercuric reductase  57.09 
 
 
561 aa  594  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00236829  unclonable  0.0000000913433 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0483  putative mercuric reductase  55.89 
 
 
562 aa  590  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2228  putative mercuric reductase  55.77 
 
 
561 aa  589  1e-167  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1209  mercuric reductase  56.49 
 
 
565 aa  590  1e-167  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.375903  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4345  putative mercuric reductase  55.93 
 
 
561 aa  589  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0090  putative mercuric reductase  55.87 
 
 
560 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1787  putative mercuric reductase  55.16 
 
 
561 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152452  normal  0.329261 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0242  putative mercuric reductase  59.83 
 
 
467 aa  570  1e-161  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1340  putative mercuric reductase  54.48 
 
 
562 aa  566  1e-160  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.657387  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02949  putative mercuric reductase  59.4 
 
 
503 aa  563  1.0000000000000001e-159  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187984  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4010  putative mercuric reductase  58.75 
 
 
468 aa  521  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2758  putative mercuric reductase  57.02 
 
 
468 aa  513  1e-144  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  41.47 
 
 
546 aa  388  1e-106  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  41.47 
 
 
546 aa  386  1e-106  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  38.99 
 
 
546 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  45.07 
 
 
767 aa  365  1e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  40.54 
 
 
546 aa  364  2e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  45.07 
 
 
745 aa  363  3e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  44.65 
 
 
767 aa  363  5.0000000000000005e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  40.07 
 
 
548 aa  350  4e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  43.47 
 
 
475 aa  350  5e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2512  mercuric reductase MerA  42.83 
 
 
479 aa  345  2e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1148  mercuric reductase  44.25 
 
 
457 aa  342  1e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  38.24 
 
 
550 aa  341  2e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.18 
 
 
473 aa  331  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0690  mercuric reductase  43.35 
 
 
481 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192452  normal  0.6373 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0654  mercuric reductase  39.87 
 
 
468 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.87809e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0640  mercuric reductase  39.41 
 
 
468 aa  306  9.000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2649  mercuric reductase  43.74 
 
 
478 aa  305  2.0000000000000002e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4465  mercuric reductase  41.24 
 
 
476 aa  303  5.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4296  mercuric reductase  41.24 
 
 
476 aa  303  5.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4196  mercuric reductase  41.24 
 
 
476 aa  303  5.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4946  mercuric reductase  40.84 
 
 
476 aa  302  9e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104965  decreased coverage  0.00400898 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06150  mercuric reductase  42.71 
 
 
474 aa  301  1e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25620  mercuric reductase  42.49 
 
 
474 aa  301  3e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1388  mercuric reductase  37.52 
 
 
557 aa  300  7e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000433137  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1778  mercuric reductase  38.98 
 
 
480 aa  296  5e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.3364  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3424  mercuric reductase  37.63 
 
 
468 aa  296  6e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4511  mercuric reductase  40.08 
 
 
482 aa  293  7e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00955631 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0177  mercuric reductase MerA  37.29 
 
 
469 aa  292  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0840  mercuric reductase  37.24 
 
 
469 aa  290  7e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5372  mercuric reductase  40.83 
 
 
477 aa  282  9e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3213  mercuric reductase  39.53 
 
 
467 aa  280  4e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163863  normal  0.231896 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2329  mercuric reductase  40.54 
 
 
476 aa  278  2e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1213  mercuric reductase  37.89 
 
 
464 aa  277  4e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1504  mercuric reductase  36.34 
 
 
453 aa  270  7e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.25653 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0504  mercuric reductase  36.3 
 
 
449 aa  262  1e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1241  mercuric reductase  37.58 
 
 
448 aa  258  1e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.446801  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2009  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  36.76 
 
 
471 aa  254  4.0000000000000004e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  34.44 
 
 
460 aa  253  5.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3663  mercuric reductase  36.65 
 
 
458 aa  249  1e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1158  mercuric reductase  35.09 
 
 
484 aa  248  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0843858  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.51 
 
 
717 aa  242  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2994  mercuric reductase  32.3 
 
 
485 aa  241  2e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  32.67 
 
 
738 aa  239  1e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2847  mercuric reductase  32.25 
 
 
484 aa  237  5.0000000000000005e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.88 
 
 
458 aa  236  6e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.18 
 
 
468 aa  236  1.0000000000000001e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  31.17 
 
 
468 aa  234  4.0000000000000004e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.29 
 
 
712 aa  231  3e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0314  hypothetical protein  33.48 
 
 
464 aa  230  5e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0298  hypothetical protein  33.03 
 
 
464 aa  229  1e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.66 
 
 
456 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.87 
 
 
458 aa  226  6e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.52 
 
 
484 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1463  mercuric reductase, putative  35.22 
 
 
486 aa  226  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0144411  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.08 
 
 
484 aa  224  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.3 
 
 
484 aa  223  6e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4442  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.81 
 
 
469 aa  223  6e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.684899 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0315  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.16 
 
 
471 aa  223  7e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.58 
 
 
459 aa  222  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1334  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  33.63 
 
 
452 aa  221  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.106224 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.65 
 
 
464 aa  221  3e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1598  mercuric reductase  33.54 
 
 
510 aa  221  3e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4961  mercuric reductase  31.32 
 
 
460 aa  221  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1496  mercuric reductase  33.33 
 
 
466 aa  219  7e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.32667 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1132  dihydrolipoamide dehydrogenase  35 
 
 
464 aa  219  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1459  mercuric reductase  34.21 
 
 
464 aa  219  1e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1765  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.87 
 
 
448 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.187504  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2516  glutathione-disulfide reductase  35.83 
 
 
446 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  30.95 
 
 
717 aa  217  5.9999999999999996e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5831  mercuric reductase  35.48 
 
 
455 aa  216  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194109  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>