More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0955 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  73.29 
 
 
468 aa  716    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00928669  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.22 
 
 
468 aa  709    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
470 aa  942    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  75.91 
 
 
470 aa  743    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  75.27 
 
 
470 aa  736    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  75.69 
 
 
470 aa  741    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  75.91 
 
 
470 aa  743    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  75.91 
 
 
470 aa  743    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  76.76 
 
 
470 aa  749    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  75.69 
 
 
470 aa  741    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  73.29 
 
 
468 aa  716    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000305556  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  88.72 
 
 
470 aa  859    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  75.91 
 
 
470 aa  743    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  75.91 
 
 
470 aa  743    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  75.91 
 
 
470 aa  743    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  75.69 
 
 
470 aa  741    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2393  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.22 
 
 
459 aa  632  1e-180  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0110453  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.88 
 
 
470 aa  617  1e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0331  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.56 
 
 
473 aa  526  1e-148  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0634  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.53 
 
 
475 aa  520  1e-146  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000338686  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0048  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.97 
 
 
472 aa  511  1e-144  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0740  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.94 
 
 
469 aa  488  1e-136  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.010396  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.29 
 
 
492 aa  459  9.999999999999999e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1665  dihydrolipoamide dehydrogenase  50 
 
 
491 aa  455  1e-127  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.771016  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1805  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.57 
 
 
616 aa  434  1e-120  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1998  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.89 
 
 
481 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0142  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.21 
 
 
475 aa  428  1e-119  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.262371  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.11 
 
 
467 aa  428  1e-119  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0271  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.89 
 
 
593 aa  426  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.146735  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.6 
 
 
484 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.38 
 
 
484 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.6 
 
 
484 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.86 
 
 
475 aa  413  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.28 
 
 
463 aa  415  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3520  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.98 
 
 
602 aa  405  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.501053  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.57 
 
 
476 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0985  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.98 
 
 
472 aa  399  9.999999999999999e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.747719 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1035  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.39 
 
 
593 aa  397  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.356313  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03103  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.34 
 
 
607 aa  395  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1911  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.48 
 
 
603 aa  395  1e-109  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00687521  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1719  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.36 
 
 
476 aa  396  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2076  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.69 
 
 
588 aa  396  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2991  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.64 
 
 
464 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.14 
 
 
476 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6500  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.99 
 
 
465 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.264998  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.14 
 
 
476 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.9 
 
 
463 aa  392  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6299  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.38 
 
 
625 aa  394  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0179219 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35490  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.61 
 
 
464 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730291 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00115  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.07 
 
 
474 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3486  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.07 
 
 
474 aa  389  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1981  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.06 
 
 
603 aa  389  1e-107  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.01171  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0126  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.07 
 
 
495 aa  389  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.92 
 
 
476 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0123  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.07 
 
 
495 aa  389  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00461139  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.92 
 
 
476 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.92 
 
 
476 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.2 
 
 
464 aa  389  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.92 
 
 
476 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3543  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.07 
 
 
474 aa  389  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.399649  normal  0.262226 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1496  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.92 
 
 
476 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0120  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.07 
 
 
474 aa  389  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0447957  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0167  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.07 
 
 
474 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.71 
 
 
476 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2925  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.07 
 
 
474 aa  389  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.324893 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.71 
 
 
476 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0176  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.07 
 
 
475 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0168  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.07 
 
 
474 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.928694  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.92 
 
 
476 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03223  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.51 
 
 
473 aa  389  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.416876  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0109  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.07 
 
 
474 aa  389  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.809196  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.71 
 
 
476 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4147  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.57 
 
 
469 aa  390  1e-107  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.515477  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2965  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.52 
 
 
680 aa  390  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155449  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0118  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.07 
 
 
474 aa  389  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00709642  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1510  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.92 
 
 
476 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.647996  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.92 
 
 
476 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975022  hitchhiker  0.00623097 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1642  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.28 
 
 
476 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370947  normal  0.099089 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4388  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.69 
 
 
465 aa  388  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1135  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.61 
 
 
589 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.373004  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0433  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.75 
 
 
475 aa  386  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000206937 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4651  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.49 
 
 
476 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183592  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6035  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.63 
 
 
466 aa  388  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2153  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.84 
 
 
590 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0291933  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3752  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.64 
 
 
474 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.361486  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0167  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.85 
 
 
474 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3504  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.77 
 
 
465 aa  387  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.305711 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5942  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.84 
 
 
588 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00253524  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0173  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.64 
 
 
474 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1093  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.41 
 
 
474 aa  386  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.136846  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0662  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.29 
 
 
474 aa  387  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.42488  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2135  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.84 
 
 
588 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0527  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.04 
 
 
464 aa  382  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0421  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.75 
 
 
475 aa  383  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000187748  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0551  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.87 
 
 
464 aa  383  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0440  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.71 
 
 
591 aa  384  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.46872  normal  0.0861409 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7193  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.72 
 
 
619 aa  382  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2454  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.73 
 
 
579 aa  382  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1432  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.28 
 
 
476 aa  385  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21637  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2228  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  46.2 
 
 
589 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.467573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>