More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2107 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1298  putative mercuric reductase  75.9 
 
 		 562 aa  795    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.881891 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1340  putative mercuric reductase  73.12 
 
 		 562 aa  761    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.657387  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2338  putative mercuric reductase  79.11 
 
 		 561 aa  841    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1209  mercuric reductase  78.19 
 
 		 565 aa  827    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.375903  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2481  putative mercuric reductase  99.82 
 
 		 547 aa  1102    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0761993  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6495  putative mercuric reductase  78.93 
 
 		 561 aa  839    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0045  putative mercuric reductase  78.15 
 
 		 564 aa  830    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00619698  normal  0.422186 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2107  putative mercuric reductase  100 
 
 		 547 aa  1103    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0483  putative mercuric reductase  74.33 
 
 		 562 aa  781    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02949  putative mercuric reductase  69.81 
 
 		 503 aa  660    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187984  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2133  putative mercuric reductase  77.98 
 
 		 564 aa  829    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0165  putative mercuric reductase  78.04 
 
 		 561 aa  829    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2228  putative mercuric reductase  77.14 
 
 		 561 aa  822    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1213  putative mercuric reductase  78.21 
 
 		 561 aa  838    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1787  putative mercuric reductase  76.61 
 
 		 561 aa  812    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152452  normal  0.329261 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6174  putative mercuric reductase  78.93 
 
 		 561 aa  839    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00111286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6183  putative mercuric reductase  78.93 
 
 		 561 aa  839    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00236829  unclonable  0.0000000913433 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0090  putative mercuric reductase  72.09 
 
 		 560 aa  769    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0104  putative mercuric reductase  78.93 
 
 		 561 aa  839    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.57639  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15460  putative mercuric reductase  78.93 
 
 		 561 aa  839    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000698922  unclonable  2.1869799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0242  putative mercuric reductase  71.71 
 
 		 467 aa  667    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4345  putative mercuric reductase  79.29 
 
 		 561 aa  840    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4311  putative mercuric reductase  56.65 
 
 		 551 aa  632  1e-180  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2758  putative mercuric reductase  68.25 
 
 		 468 aa  610  1e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0168  putative mercuric reductase  54.74 
 
 		 550 aa  609  1e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1341  putative mercuric reductase  61.04 
 
 		 541 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.183471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3488  putative mercuric reductase  56.23 
 
 		 552 aa  595  1e-169  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.852286  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4010  putative mercuric reductase  67.31 
 
 		 468 aa  591  1e-167  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01408  putative mercuric reductase  60.88 
 
 		 479 aa  590  1e-167  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02044  putative mercuric reductase  56.22 
 
 		 479 aa  529  1e-149  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.985853  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  66.32 
 
 		 473 aa  479  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  41.97 
 
 		 546 aa  404  1e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  43.25 
 
 		 546 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  41.79 
 
 		 546 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  45.17 
 
 		 550 aa  396  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  44 
 
 		 548 aa  387  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  44.93 
 
 		 546 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  47.3 
 
 		 767 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  46.14 
 
 		 475 aa  369  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  46.9 
 
 		 767 aa  371  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  45.76 
 
 		 745 aa  365  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2512  mercuric reductase MerA  45.04 
 
 		 479 aa  353  4e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0690  mercuric reductase  46.14 
 
 		 481 aa  340  5e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192452  normal  0.6373 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1388  mercuric reductase  42.29 
 
 		 557 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000433137  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1148  mercuric reductase  43.29 
 
 		 457 aa  333  6e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2649  mercuric reductase  44.89 
 
 		 478 aa  325  1e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1778  mercuric reductase  41.39 
 
 		 480 aa  324  3e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.3364  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0640  mercuric reductase  42.32 
 
 		 468 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4946  mercuric reductase  43.07 
 
 		 476 aa  318  2e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104965  decreased coverage  0.00400898 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0654  mercuric reductase  41.26 
 
 		 468 aa  317  3e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.87809e-24 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2329  mercuric reductase  41.98 
 
 		 476 aa  313  6.999999999999999e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3213  mercuric reductase  42.86 
 
 		 467 aa  312  9e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163863  normal  0.231896 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4511  mercuric reductase  41.81 
 
 		 482 aa  309  6.999999999999999e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00955631 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0840  mercuric reductase  39.57 
 
 		 469 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4465  mercuric reductase  41.11 
 
 		 476 aa  308  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4296  mercuric reductase  41.11 
 
 		 476 aa  308  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4196  mercuric reductase  41.11 
 
 		 476 aa  308  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3424  mercuric reductase  39.75 
 
 		 468 aa  301  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25620  mercuric reductase  41.98 
 
 		 474 aa  297  4e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06150  mercuric reductase  41.98 
 
 		 474 aa  297  4e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0177  mercuric reductase MerA  38.64 
 
 		 469 aa  292  9e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3663  mercuric reductase  40.05 
 
 		 458 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1504  mercuric reductase  36.64 
 
 		 453 aa  281  3e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.25653 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5372  mercuric reductase  39.61 
 
 		 477 aa  276  6e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1213  mercuric reductase  35.43 
 
 		 464 aa  274  4.0000000000000004e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0504  mercuric reductase  35.79 
 
 		 449 aa  270  5.9999999999999995e-71  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2009  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  40.81 
 
 		 471 aa  268  2e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1241  mercuric reductase  37.28 
 
 		 448 aa  262  8.999999999999999e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.446801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2847  mercuric reductase  35.81 
 
 		 484 aa  259  1e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1158  mercuric reductase  38.23 
 
 		 484 aa  256  6e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0843858  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4668  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.33 
 
 		 482 aa  250  5e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2088  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.97 
 
 		 484 aa  247  4e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0162  Heavy metal transport/detoxification protein  61.54 
 
 		 228 aa  243  6e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.988191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4228  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.98 
 
 		 482 aa  243  9e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0315  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.94 
 
 		 471 aa  238  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2994  mercuric reductase  33.93 
 
 		 485 aa  236  6e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1118  mercuric reductase  34.63 
 
 		 516 aa  235  2.0000000000000002e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.583122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0335  putative mercuric reductase MerA  35.73 
 
 		 470 aa  233  9e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0257756  normal  0.865003 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0352  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.59 
 
 		 475 aa  232  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1598  mercuric reductase  33.75 
 
 		 510 aa  230  4e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1504  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.03 
 
 		 462 aa  228  2e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.515089  normal  0.0466141 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.5 
 
 		 482 aa  228  3e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.26 
 
 		 717 aa  228  3e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.04 
 
 		 746 aa  227  4e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0256  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  34.35 
 
 		 484 aa  226  6e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  33.41 
 
 		 704 aa  226  6e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.97 
 
 		 492 aa  226  8e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6297  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.23 
 
 		 466 aa  225  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.47 
 
 		 475 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.68 
 
 		 456 aa  225  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3132  mercuric reductase  32.03 
 
 		 504 aa  224  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.47 
 
 		 475 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.85 
 
 		 470 aa  224  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.63 
 
 		 470 aa  224  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1956  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.23 
 
 		 480 aa  223  9e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.55 
 
 		 470 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.55 
 
 		 470 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0645  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  34.27 
 
 		 472 aa  222  9.999999999999999e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.55 
 
 		 470 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0457  mercuric reductase  35.82 
 
 		 507 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>