More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0640 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0654  mercuric reductase  95.73 
 
 		 468 aa  909    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.87809e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0640  mercuric reductase  100 
 
 		 468 aa  938    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0840  mercuric reductase  65.1 
 
 		 469 aa  622  1e-177  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0177  mercuric reductase MerA  63.07 
 
 		 469 aa  588  1e-167  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3424  mercuric reductase  60.26 
 
 		 468 aa  566  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  43.2 
 
 		 548 aa  343  4e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  39.83 
 
 		 546 aa  336  5e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  38.74 
 
 		 546 aa  335  1e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  38.74 
 
 		 546 aa  335  1e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  41.99 
 
 		 550 aa  327  3e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2481  putative mercuric reductase  42.53 
 
 		 547 aa  317  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0761993  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1504  mercuric reductase  37.77 
 
 		 453 aa  317  3e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.25653 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2107  putative mercuric reductase  42.32 
 
 		 547 aa  316  7e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0242  putative mercuric reductase  40.34 
 
 		 467 aa  315  9.999999999999999e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  39.96 
 
 		 767 aa  314  1.9999999999999998e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  40.52 
 
 		 475 aa  312  9e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01408  putative mercuric reductase  40.17 
 
 		 479 aa  311  1e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0168  putative mercuric reductase  40.43 
 
 		 550 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02949  putative mercuric reductase  40.13 
 
 		 503 aa  310  2.9999999999999997e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187984  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0690  mercuric reductase  41.76 
 
 		 481 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192452  normal  0.6373 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4311  putative mercuric reductase  39.41 
 
 		 551 aa  306  7e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1341  putative mercuric reductase  42.79 
 
 		 541 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.183471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  38.74 
 
 		 546 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0090  putative mercuric reductase  43.43 
 
 		 560 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3488  putative mercuric reductase  40.04 
 
 		 552 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.852286  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  40.04 
 
 		 767 aa  301  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2649  mercuric reductase  41.68 
 
 		 478 aa  299  7e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6174  putative mercuric reductase  41.93 
 
 		 561 aa  299  9e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00111286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15460  putative mercuric reductase  41.93 
 
 		 561 aa  299  9e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000698922  unclonable  2.1869799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  39.87 
 
 		 745 aa  298  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2338  putative mercuric reductase  41.72 
 
 		 561 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6495  putative mercuric reductase  41.51 
 
 		 561 aa  296  7e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6183  putative mercuric reductase  41.51 
 
 		 561 aa  296  7e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00236829  unclonable  0.0000000913433 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0104  putative mercuric reductase  41.51 
 
 		 561 aa  296  7e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.57639  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2512  mercuric reductase MerA  38.68 
 
 		 479 aa  294  2e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02044  putative mercuric reductase  37.63 
 
 		 479 aa  295  2e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.985853  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0483  putative mercuric reductase  41.31 
 
 		 562 aa  293  4e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1213  putative mercuric reductase  40.46 
 
 		 561 aa  293  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4345  putative mercuric reductase  41.09 
 
 		 561 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0504  mercuric reductase  35.57 
 
 		 449 aa  288  1e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1340  putative mercuric reductase  41.4 
 
 		 562 aa  288  1e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.657387  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1241  mercuric reductase  36.72 
 
 		 448 aa  287  2.9999999999999996e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.446801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1298  putative mercuric reductase  40.97 
 
 		 562 aa  286  7e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.881891 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2758  putative mercuric reductase  39.91 
 
 		 468 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1787  putative mercuric reductase  41.19 
 
 		 561 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152452  normal  0.329261 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1209  mercuric reductase  40.72 
 
 		 565 aa  284  3.0000000000000004e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.375903  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4010  putative mercuric reductase  40.08 
 
 		 468 aa  283  4.0000000000000003e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2228  putative mercuric reductase  40.34 
 
 		 561 aa  283  5.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1778  mercuric reductase  38.11 
 
 		 480 aa  281  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.3364  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2133  putative mercuric reductase  40.63 
 
 		 564 aa  279  8e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0045  putative mercuric reductase  40.63 
 
 		 564 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00619698  normal  0.422186 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5372  mercuric reductase  38.41 
 
 		 477 aa  277  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1504  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.2 
 
 		 462 aa  276  5e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.515089  normal  0.0466141 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0165  putative mercuric reductase  39.19 
 
 		 561 aa  275  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4465  mercuric reductase  38.17 
 
 		 476 aa  274  3e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4296  mercuric reductase  38.17 
 
 		 476 aa  274  3e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4196  mercuric reductase  38.17 
 
 		 476 aa  274  3e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1213  mercuric reductase  36.43 
 
 		 464 aa  270  5.9999999999999995e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4946  mercuric reductase  37.37 
 
 		 476 aa  269  7e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104965  decreased coverage  0.00400898 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4511  mercuric reductase  37.39 
 
 		 482 aa  268  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00955631 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4269  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.37 
 
 		 462 aa  262  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.170998  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25620  mercuric reductase  39.38 
 
 		 474 aa  262  1e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06150  mercuric reductase  39.38 
 
 		 474 aa  261  2e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3213  mercuric reductase  37.42 
 
 		 467 aa  261  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163863  normal  0.231896 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0962  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.7 
 
 		 462 aa  259  8e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.48 
 
 		 462 aa  259  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2009  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  40.87 
 
 		 471 aa  259  1e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1158  mercuric reductase  37.26 
 
 		 484 aa  257  3e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0843858  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1132  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.9 
 
 		 464 aa  256  7e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2994  mercuric reductase  33.68 
 
 		 485 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.38 
 
 		 462 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1148  mercuric reductase  37.58 
 
 		 457 aa  252  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.41 
 
 		 467 aa  251  3e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3049  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.19 
 
 		 472 aa  250  5e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0397378  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1388  mercuric reductase  36.6 
 
 		 557 aa  249  7e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000433137  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1296  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.34 
 
 		 463 aa  249  8e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2847  mercuric reductase  33.88 
 
 		 484 aa  247  3e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1998  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.06 
 
 		 481 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2329  mercuric reductase  34.87 
 
 		 476 aa  246  4.9999999999999997e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.05 
 
 		 464 aa  246  6.999999999999999e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1509  mercuric reductase  32.36 
 
 		 461 aa  246  6.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1665  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.24 
 
 		 491 aa  246  9e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.771016  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.09 
 
 		 459 aa  245  9.999999999999999e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.39 
 
 		 467 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.26 
 
 		 463 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.24 
 
 		 473 aa  244  3e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.13 
 
 		 473 aa  244  3e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3663  mercuric reductase  37.23 
 
 		 458 aa  243  7e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3059  mercuric reductase  33.93 
 
 		 460 aa  241  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0658861 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7124  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.65 
 
 		 467 aa  242  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.26 
 
 		 484 aa  242  1e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.26 
 
 		 484 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.71 
 
 		 470 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.47 
 
 		 562 aa  241  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.31 
 
 		 456 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.84 
 
 		 468 aa  240  4e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1215  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.34 
 
 		 466 aa  240  4e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00663567  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0837  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.65 
 
 		 462 aa  240  4e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0629808 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0180  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.76 
 
 		 467 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3551  mercuric reductase  32.96 
 
 		 458 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  normal  0.343975 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>