More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1778 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008697  Noca_4946  mercuric reductase  71.34 
 
 
476 aa  651    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104965  decreased coverage  0.00400898 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4511  mercuric reductase  79.12 
 
 
482 aa  757    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00955631 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4465  mercuric reductase  72.88 
 
 
476 aa  666    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4296  mercuric reductase  72.88 
 
 
476 aa  666    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4196  mercuric reductase  72.88 
 
 
476 aa  666    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1778  mercuric reductase  100 
 
 
480 aa  965    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.3364  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06150  mercuric reductase  67.8 
 
 
474 aa  608  1e-173  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25620  mercuric reductase  67.37 
 
 
474 aa  606  9.999999999999999e-173  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3213  mercuric reductase  66.1 
 
 
467 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163863  normal  0.231896 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0690  mercuric reductase  57.38 
 
 
481 aa  495  1e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192452  normal  0.6373 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2649  mercuric reductase  57.2 
 
 
478 aa  485  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5372  mercuric reductase  55.49 
 
 
477 aa  473  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  43.16 
 
 
546 aa  410  1e-113  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  43.16 
 
 
546 aa  409  1e-113  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  45.26 
 
 
546 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  48.96 
 
 
548 aa  411  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  46.41 
 
 
546 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  47.58 
 
 
550 aa  391  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1158  mercuric reductase  47.55 
 
 
484 aa  379  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0843858  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3663  mercuric reductase  45.34 
 
 
458 aa  355  8.999999999999999e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0242  putative mercuric reductase  43.04 
 
 
467 aa  353  5e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  42.28 
 
 
475 aa  351  2e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  42.16 
 
 
767 aa  345  1e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02949  putative mercuric reductase  42.41 
 
 
503 aa  344  2.9999999999999997e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187984  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2758  putative mercuric reductase  44.42 
 
 
468 aa  341  2e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4010  putative mercuric reductase  43.95 
 
 
468 aa  340  4e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  41.1 
 
 
767 aa  339  7e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  40.89 
 
 
745 aa  338  9e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2512  mercuric reductase MerA  41.23 
 
 
479 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2481  putative mercuric reductase  41.6 
 
 
547 aa  330  5.0000000000000004e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0761993  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2107  putative mercuric reductase  41.39 
 
 
547 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1298  putative mercuric reductase  43.31 
 
 
562 aa  324  2e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.881891 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1148  mercuric reductase  41.21 
 
 
457 aa  320  3.9999999999999996e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02044  putative mercuric reductase  39.19 
 
 
479 aa  319  6e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.985853  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1341  putative mercuric reductase  42.59 
 
 
541 aa  318  1e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.183471  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1213  putative mercuric reductase  40.68 
 
 
561 aa  315  9e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01408  putative mercuric reductase  39.41 
 
 
479 aa  315  9.999999999999999e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0165  putative mercuric reductase  41.01 
 
 
561 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0483  putative mercuric reductase  40.98 
 
 
562 aa  314  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1340  putative mercuric reductase  41.7 
 
 
562 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.657387  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4311  putative mercuric reductase  38.98 
 
 
551 aa  311  1e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2338  putative mercuric reductase  40.25 
 
 
561 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243851  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0104  putative mercuric reductase  40.25 
 
 
561 aa  310  4e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.57639  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6495  putative mercuric reductase  40.25 
 
 
561 aa  310  4e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6183  putative mercuric reductase  40.25 
 
 
561 aa  310  4e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00236829  unclonable  0.0000000913433 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0168  putative mercuric reductase  37.63 
 
 
550 aa  310  5e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6174  putative mercuric reductase  40.04 
 
 
561 aa  309  8e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00111286  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15460  putative mercuric reductase  40.04 
 
 
561 aa  309  8e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000698922  unclonable  2.1869799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2228  putative mercuric reductase  40.25 
 
 
561 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3424  mercuric reductase  38.05 
 
 
468 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0090  putative mercuric reductase  40.47 
 
 
560 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4345  putative mercuric reductase  40.17 
 
 
561 aa  307  3e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1787  putative mercuric reductase  41.31 
 
 
561 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152452  normal  0.329261 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0840  mercuric reductase  39.2 
 
 
469 aa  306  8.000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1209  mercuric reductase  40.89 
 
 
565 aa  305  9.000000000000001e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.375903  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2329  mercuric reductase  41.01 
 
 
476 aa  305  1.0000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2133  putative mercuric reductase  40.04 
 
 
564 aa  303  5.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0045  putative mercuric reductase  40.04 
 
 
564 aa  303  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00619698  normal  0.422186 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0654  mercuric reductase  38.95 
 
 
468 aa  301  1e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.87809e-24 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2847  mercuric reductase  37.34 
 
 
484 aa  300  4e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2009  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  40.25 
 
 
471 aa  300  5e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3488  putative mercuric reductase  39.62 
 
 
552 aa  300  6e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.852286  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2994  mercuric reductase  37.55 
 
 
485 aa  295  9e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0640  mercuric reductase  38.11 
 
 
468 aa  295  9e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1388  mercuric reductase  41.18 
 
 
557 aa  291  1e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000433137  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0177  mercuric reductase MerA  38.11 
 
 
469 aa  289  9e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1241  mercuric reductase  35.65 
 
 
448 aa  267  2.9999999999999995e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.446801  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0504  mercuric reductase  34.18 
 
 
449 aa  260  4e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1504  mercuric reductase  34.81 
 
 
453 aa  257  3e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.25653 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1504  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.71 
 
 
462 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.515089  normal  0.0466141 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.64 
 
 
456 aa  242  1e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1213  mercuric reductase  33.82 
 
 
464 aa  240  4e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4636  mercuric reductase  32.82 
 
 
458 aa  236  9e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.295825 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4961  mercuric reductase  30.92 
 
 
460 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.83 
 
 
712 aa  234  3e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  30.67 
 
 
460 aa  234  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4668  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.34 
 
 
482 aa  233  5e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5924  mercuric reductase  34.99 
 
 
461 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184883  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0315  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.83 
 
 
471 aa  229  7e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4228  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.11 
 
 
482 aa  228  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1270  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.45 
 
 
460 aa  227  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.751643  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.23 
 
 
492 aa  226  6e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.42 
 
 
468 aa  226  1e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3551  mercuric reductase  34.06 
 
 
458 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  normal  0.343975 
 
 
-
 
NC_006686  CND05840  dihydrolipoyl dehydrogenase, putative  32.42 
 
 
511 aa  224  2e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.465888  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0352  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.43 
 
 
475 aa  224  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6744  mercuric reductase  32.65 
 
 
453 aa  224  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.520469  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5390  mercuric reductase  34.06 
 
 
458 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.82 
 
 
470 aa  223  4e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1956  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.75 
 
 
480 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.79 
 
 
713 aa  223  8e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0314  hypothetical protein  30.32 
 
 
464 aa  222  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.98 
 
 
464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5831  mercuric reductase  33.11 
 
 
455 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194109  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.14 
 
 
475 aa  221  3e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3872  mercuric reductase  33.77 
 
 
459 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.429317 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1459  mercuric reductase  36.57 
 
 
464 aa  219  7e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2463  mercuric reductase  33.55 
 
 
459 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.736078 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2201  2-oxoglutarate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  32.14 
 
 
478 aa  219  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00788973  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0298  hypothetical protein  30.09 
 
 
464 aa  218  1e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>