More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1341 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1341  putative mercuric reductase  100 
 
 		 541 aa  1083    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.183471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4311  putative mercuric reductase  59.74 
 
 		 551 aa  639    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2107  putative mercuric reductase  61.04 
 
 		 547 aa  618  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2481  putative mercuric reductase  61.22 
 
 		 547 aa  619  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0761993  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0168  putative mercuric reductase  56.93 
 
 		 550 aa  617  1e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3488  putative mercuric reductase  58.72 
 
 		 552 aa  609  1e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.852286  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01408  putative mercuric reductase  63.36 
 
 		 479 aa  603  1.0000000000000001e-171  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1213  putative mercuric reductase  58.78 
 
 		 561 aa  598  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1209  mercuric reductase  59.5 
 
 		 565 aa  592  1e-168  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.375903  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2133  putative mercuric reductase  59.25 
 
 		 564 aa  592  1e-168  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0045  putative mercuric reductase  59.43 
 
 		 564 aa  594  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00619698  normal  0.422186 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2228  putative mercuric reductase  58.42 
 
 		 561 aa  590  1e-167  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6174  putative mercuric reductase  58.6 
 
 		 561 aa  585  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00111286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2338  putative mercuric reductase  58.6 
 
 		 561 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15460  putative mercuric reductase  58.6 
 
 		 561 aa  586  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000698922  unclonable  2.1869799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0104  putative mercuric reductase  58.42 
 
 		 561 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.57639  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6495  putative mercuric reductase  58.42 
 
 		 561 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6183  putative mercuric reductase  58.42 
 
 		 561 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00236829  unclonable  0.0000000913433 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0165  putative mercuric reductase  58.24 
 
 		 561 aa  580  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4345  putative mercuric reductase  58.24 
 
 		 561 aa  578  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1298  putative mercuric reductase  58.36 
 
 		 562 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.881891 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1787  putative mercuric reductase  57.53 
 
 		 561 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152452  normal  0.329261 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0483  putative mercuric reductase  57.73 
 
 		 562 aa  568  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0090  putative mercuric reductase  58.14 
 
 		 560 aa  568  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0242  putative mercuric reductase  60.17 
 
 		 467 aa  564  1.0000000000000001e-159  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02949  putative mercuric reductase  59.36 
 
 		 503 aa  554  1e-156  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187984  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1340  putative mercuric reductase  56.05 
 
 		 562 aa  545  1e-154  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.657387  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02044  putative mercuric reductase  55.23 
 
 		 479 aa  533  1e-150  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.985853  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2758  putative mercuric reductase  58.8 
 
 		 468 aa  520  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4010  putative mercuric reductase  59.4 
 
 		 468 aa  507  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2512  mercuric reductase MerA  49.26 
 
 		 479 aa  385  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  41.23 
 
 		 546 aa  382  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  47.02 
 
 		 475 aa  379  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  47.75 
 
 		 767 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  47.97 
 
 		 745 aa  376  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  39.96 
 
 		 546 aa  373  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  43.72 
 
 		 548 aa  375  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  39.78 
 
 		 546 aa  370  1e-101  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  47.33 
 
 		 767 aa  370  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  43.43 
 
 		 550 aa  366  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  42.68 
 
 		 546 aa  365  1e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1148  mercuric reductase  46.1 
 
 		 457 aa  345  1e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  51.55 
 
 		 473 aa  345  2e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0690  mercuric reductase  46.38 
 
 		 481 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192452  normal  0.6373 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0654  mercuric reductase  44.05 
 
 		 468 aa  336  7.999999999999999e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.87809e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0640  mercuric reductase  43.4 
 
 		 468 aa  332  1e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1778  mercuric reductase  42.59 
 
 		 480 aa  330  4e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.3364  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3424  mercuric reductase  42.41 
 
 		 468 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4465  mercuric reductase  44.25 
 
 		 476 aa  328  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4296  mercuric reductase  44.25 
 
 		 476 aa  328  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4196  mercuric reductase  44.25 
 
 		 476 aa  328  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1388  mercuric reductase  42.27 
 
 		 557 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000433137  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4946  mercuric reductase  43.76 
 
 		 476 aa  325  1e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104965  decreased coverage  0.00400898 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2649  mercuric reductase  45.99 
 
 		 478 aa  318  1e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4511  mercuric reductase  41.67 
 
 		 482 aa  315  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00955631 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25620  mercuric reductase  43.16 
 
 		 474 aa  310  5e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06150  mercuric reductase  43.16 
 
 		 474 aa  310  5.9999999999999995e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0177  mercuric reductase MerA  39.15 
 
 		 469 aa  303  8.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0840  mercuric reductase  38.12 
 
 		 469 aa  301  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2329  mercuric reductase  42.05 
 
 		 476 aa  300  6e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3213  mercuric reductase  42.77 
 
 		 467 aa  295  1e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163863  normal  0.231896 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3663  mercuric reductase  41.36 
 
 		 458 aa  293  8e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5372  mercuric reductase  42.13 
 
 		 477 aa  292  9e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1213  mercuric reductase  39.6 
 
 		 464 aa  285  1.0000000000000001e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1504  mercuric reductase  37.83 
 
 		 453 aa  278  2e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.25653 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0504  mercuric reductase  37.83 
 
 		 449 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2009  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  40.84 
 
 		 471 aa  268  1e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1158  mercuric reductase  37.61 
 
 		 484 aa  261  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0843858  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1241  mercuric reductase  37.31 
 
 		 448 aa  255  2.0000000000000002e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.446801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.82 
 
 		 456 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0315  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.01 
 
 		 471 aa  250  5e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  34.82 
 
 		 460 aa  249  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2994  mercuric reductase  33.33 
 
 		 485 aa  246  4.9999999999999997e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1504  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.25 
 
 		 462 aa  246  6e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.515089  normal  0.0466141 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1463  mercuric reductase, putative  37.71 
 
 		 486 aa  242  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0144411  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.54 
 
 		 713 aa  236  7e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4961  mercuric reductase  32.36 
 
 		 460 aa  236  9e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1608  glutathione reductase  36.77 
 
 		 452 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128494  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.06 
 
 		 717 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.72 
 
 		 717 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0352  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.75 
 
 		 475 aa  234  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  33.84 
 
 		 738 aa  233  5e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  32.51 
 
 		 716 aa  233  9e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0298  hypothetical protein  33.48 
 
 		 464 aa  232  1e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3669  mercuric reductase  37.26 
 
 		 459 aa  232  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0331  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.92 
 
 		 473 aa  232  1e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  33.69 
 
 		 717 aa  232  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.54 
 
 		 470 aa  232  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5831  mercuric reductase  36.02 
 
 		 455 aa  231  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194109  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02078  mercuric reductase  34.98 
 
 		 459 aa  230  4e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0314  hypothetical protein  33.48 
 
 		 464 aa  231  4e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1956  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.95 
 
 		 480 aa  230  4e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.44 
 
 		 470 aa  231  4e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1652  mercuric reductase  35.61 
 
 		 459 aa  229  7e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0283  mercuric reductase  35.61 
 
 		 590 aa  229  7e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0194  mercuric reductase  35.61 
 
 		 459 aa  229  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3154  mercuric reductase  35.78 
 
 		 459 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3204  mercuric reductase  35.78 
 
 		 459 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.36 
 
 		 470 aa  229  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.36 
 
 		 470 aa  229  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>