More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2649 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2649  mercuric reductase  100 
 
 		 478 aa  938    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0690  mercuric reductase  62.26 
 
 		 481 aa  536  1e-151  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192452  normal  0.6373 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5372  mercuric reductase  62.77 
 
 		 477 aa  527  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4946  mercuric reductase  58.99 
 
 		 476 aa  511  1e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104965  decreased coverage  0.00400898 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1778  mercuric reductase  57.2 
 
 		 480 aa  505  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.3364  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25620  mercuric reductase  59.37 
 
 		 474 aa  495  1e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06150  mercuric reductase  59.58 
 
 		 474 aa  496  1e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4511  mercuric reductase  56.57 
 
 		 482 aa  497  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00955631 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4465  mercuric reductase  57.02 
 
 		 476 aa  486  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4296  mercuric reductase  57.02 
 
 		 476 aa  486  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4196  mercuric reductase  57.02 
 
 		 476 aa  486  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3213  mercuric reductase  56.17 
 
 		 467 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163863  normal  0.231896 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  45.89 
 
 		 546 aa  420  1e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  45.89 
 
 		 546 aa  420  1e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  47.25 
 
 		 546 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  51.49 
 
 		 548 aa  410  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  51.59 
 
 		 550 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  47.87 
 
 		 546 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1158  mercuric reductase  46.75 
 
 		 484 aa  382  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0843858  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  48.41 
 
 		 767 aa  372  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  47.13 
 
 		 475 aa  373  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  47.68 
 
 		 767 aa  371  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  47.05 
 
 		 745 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0242  putative mercuric reductase  45.53 
 
 		 467 aa  362  9e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02949  putative mercuric reductase  44.89 
 
 		 503 aa  353  5e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187984  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3663  mercuric reductase  46.71 
 
 		 458 aa  347  2e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2512  mercuric reductase MerA  46.14 
 
 		 479 aa  341  1e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2481  putative mercuric reductase  45.11 
 
 		 547 aa  334  3e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0761993  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2338  putative mercuric reductase  47.25 
 
 		 561 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2107  putative mercuric reductase  44.89 
 
 		 547 aa  332  1e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6495  putative mercuric reductase  47.25 
 
 		 561 aa  330  5.0000000000000004e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0104  putative mercuric reductase  47.25 
 
 		 561 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.57639  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6183  putative mercuric reductase  47.25 
 
 		 561 aa  330  5.0000000000000004e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00236829  unclonable  0.0000000913433 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6174  putative mercuric reductase  47.03 
 
 		 561 aa  329  6e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00111286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15460  putative mercuric reductase  47.03 
 
 		 561 aa  329  6e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000698922  unclonable  2.1869799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4010  putative mercuric reductase  46.17 
 
 		 468 aa  327  3e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1213  putative mercuric reductase  45.91 
 
 		 561 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0654  mercuric reductase  41.77 
 
 		 468 aa  325  1e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.87809e-24 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01408  putative mercuric reductase  43.52 
 
 		 479 aa  324  2e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1298  putative mercuric reductase  46.17 
 
 		 562 aa  323  4e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.881891 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0640  mercuric reductase  41.68 
 
 		 468 aa  322  8e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4311  putative mercuric reductase  43.74 
 
 		 551 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4345  putative mercuric reductase  45.38 
 
 		 561 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1148  mercuric reductase  44.8 
 
 		 457 aa  321  1.9999999999999998e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2009  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  44.56 
 
 		 471 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0165  putative mercuric reductase  44.63 
 
 		 561 aa  318  9e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0090  putative mercuric reductase  44.82 
 
 		 560 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2133  putative mercuric reductase  45.34 
 
 		 564 aa  317  2e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0045  putative mercuric reductase  45.34 
 
 		 564 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00619698  normal  0.422186 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2329  mercuric reductase  43.12 
 
 		 476 aa  316  7e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1340  putative mercuric reductase  45.83 
 
 		 562 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.657387  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0168  putative mercuric reductase  41.26 
 
 		 550 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0840  mercuric reductase  41.35 
 
 		 469 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2758  putative mercuric reductase  43.9 
 
 		 468 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2228  putative mercuric reductase  44.37 
 
 		 561 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1341  putative mercuric reductase  45.9 
 
 		 541 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.183471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1787  putative mercuric reductase  45.32 
 
 		 561 aa  312  7.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152452  normal  0.329261 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1209  mercuric reductase  44.28 
 
 		 565 aa  311  2e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.375903  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02044  putative mercuric reductase  40.13 
 
 		 479 aa  309  6.999999999999999e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.985853  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3488  putative mercuric reductase  43.52 
 
 		 552 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.852286  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0483  putative mercuric reductase  44.47 
 
 		 562 aa  305  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1504  mercuric reductase  40.17 
 
 		 453 aa  301  2e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.25653 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2847  mercuric reductase  40.46 
 
 		 484 aa  300  5e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3424  mercuric reductase  40.42 
 
 		 468 aa  300  6e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1388  mercuric reductase  42.98 
 
 		 557 aa  297  3e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000433137  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0504  mercuric reductase  36.27 
 
 		 449 aa  289  7e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1241  mercuric reductase  38.3 
 
 		 448 aa  287  2.9999999999999996e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.446801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0177  mercuric reductase MerA  38.61 
 
 		 469 aa  279  7e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2994  mercuric reductase  37.4 
 
 		 485 aa  276  9e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1213  mercuric reductase  35.25 
 
 		 464 aa  257  3e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  34.14 
 
 		 460 aa  256  6e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.21 
 
 		 456 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0352  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.62 
 
 		 475 aa  251  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1504  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.25 
 
 		 462 aa  249  7e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.515089  normal  0.0466141 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.88 
 
 		 475 aa  248  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3749  mercuric reductase  34.13 
 
 		 510 aa  243  6e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4940  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.11 
 
 		 472 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4269  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.55 
 
 		 462 aa  241  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.170998  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3049  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.24 
 
 		 472 aa  239  6.999999999999999e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0397378  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4668  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.67 
 
 		 482 aa  239  9e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4961  mercuric reductase  31.81 
 
 		 460 aa  237  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.67 
 
 		 457 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00285558  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0984  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.44 
 
 		 457 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.365373  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.87 
 
 		 463 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2206  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.38 
 
 		 459 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.041685  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.82 
 
 		 465 aa  234  4.0000000000000004e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4228  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.56 
 
 		 482 aa  233  5e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.14 
 
 		 470 aa  233  5e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.91 
 
 		 475 aa  233  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1976  mercuric reductase  33.9 
 
 		 515 aa  232  9e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121394  normal  0.267836 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5924  mercuric reductase  35.38 
 
 		 461 aa  232  9e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184883  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.57 
 
 		 468 aa  232  1e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C35  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  33.26 
 
 		 449 aa  232  1e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.69 
 
 		 475 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.19 
 
 		 469 aa  231  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0194  mercuric reductase  35.82 
 
 		 459 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26432  dihydrolipoyl dehydrogenase  34.86 
 
 		 500 aa  231  2e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0283  mercuric reductase  35.71 
 
 		 590 aa  231  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0938  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.84 
 
 		 471 aa  231  3e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0176  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.16 
 
 		 451 aa  231  3e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>