More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_25620 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008539  Arth_4196  mercuric reductase  74 
 
 
476 aa  657    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4511  mercuric reductase  70.76 
 
 
482 aa  658    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00955631 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25620  mercuric reductase  100 
 
 
474 aa  940    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06150  mercuric reductase  98.95 
 
 
474 aa  931    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4946  mercuric reductase  77.73 
 
 
476 aa  708    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104965  decreased coverage  0.00400898 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4465  mercuric reductase  74 
 
 
476 aa  657    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4296  mercuric reductase  74 
 
 
476 aa  657    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1778  mercuric reductase  67.37 
 
 
480 aa  630  1e-179  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.3364  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3213  mercuric reductase  71.01 
 
 
467 aa  610  1e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163863  normal  0.231896 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2649  mercuric reductase  59.79 
 
 
478 aa  501  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0690  mercuric reductase  58.14 
 
 
481 aa  489  1e-137  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192452  normal  0.6373 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5372  mercuric reductase  55.06 
 
 
477 aa  460  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  44.3 
 
 
546 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  44.3 
 
 
546 aa  405  1e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  49.89 
 
 
548 aa  397  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  44.4 
 
 
546 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  47.36 
 
 
550 aa  377  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1158  mercuric reductase  45.74 
 
 
484 aa  362  9e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0843858  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  44.51 
 
 
546 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0242  putative mercuric reductase  43.7 
 
 
467 aa  355  7.999999999999999e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02949  putative mercuric reductase  42.95 
 
 
503 aa  347  2e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187984  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2758  putative mercuric reductase  46.14 
 
 
468 aa  346  6e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3663  mercuric reductase  46.11 
 
 
458 aa  342  5.999999999999999e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4010  putative mercuric reductase  43.63 
 
 
468 aa  334  3e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  43.54 
 
 
475 aa  333  3e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  44.63 
 
 
767 aa  332  1e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  43.51 
 
 
745 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0168  putative mercuric reductase  40.59 
 
 
550 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  42.95 
 
 
767 aa  325  8.000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4311  putative mercuric reductase  42.49 
 
 
551 aa  325  1e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1298  putative mercuric reductase  45.28 
 
 
562 aa  322  7e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.881891 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1213  putative mercuric reductase  43.76 
 
 
561 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01408  putative mercuric reductase  41.42 
 
 
479 aa  318  1e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0165  putative mercuric reductase  43.13 
 
 
561 aa  316  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2512  mercuric reductase MerA  41.26 
 
 
479 aa  316  6e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2228  putative mercuric reductase  43.04 
 
 
561 aa  315  8e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2338  putative mercuric reductase  43.34 
 
 
561 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243851  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2481  putative mercuric reductase  42.32 
 
 
547 aa  313  5.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0761993  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6495  putative mercuric reductase  43.13 
 
 
561 aa  311  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6174  putative mercuric reductase  43.13 
 
 
561 aa  311  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00111286  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6183  putative mercuric reductase  43.13 
 
 
561 aa  311  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00236829  unclonable  0.0000000913433 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2107  putative mercuric reductase  42.11 
 
 
547 aa  311  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0104  putative mercuric reductase  43.13 
 
 
561 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.57639  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15460  putative mercuric reductase  43.13 
 
 
561 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000698922  unclonable  2.1869799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4345  putative mercuric reductase  42.71 
 
 
561 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3488  putative mercuric reductase  41.53 
 
 
552 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.852286  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0483  putative mercuric reductase  42.95 
 
 
562 aa  308  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2133  putative mercuric reductase  43.22 
 
 
564 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1787  putative mercuric reductase  43.64 
 
 
561 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152452  normal  0.329261 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0045  putative mercuric reductase  43.22 
 
 
564 aa  306  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00619698  normal  0.422186 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1340  putative mercuric reductase  43.11 
 
 
562 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.657387  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1341  putative mercuric reductase  43.16 
 
 
541 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.183471  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1209  mercuric reductase  42.74 
 
 
565 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.375903  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02044  putative mercuric reductase  38.66 
 
 
479 aa  303  6.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.985853  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1148  mercuric reductase  42.65 
 
 
457 aa  302  7.000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1388  mercuric reductase  44.09 
 
 
557 aa  298  1e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000433137  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0090  putative mercuric reductase  41.05 
 
 
560 aa  295  9e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0654  mercuric reductase  40.62 
 
 
468 aa  294  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.87809e-24 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2329  mercuric reductase  41.01 
 
 
476 aa  293  5e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0640  mercuric reductase  39.58 
 
 
468 aa  290  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0840  mercuric reductase  38.91 
 
 
469 aa  287  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2847  mercuric reductase  38.02 
 
 
484 aa  282  1e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3424  mercuric reductase  37.5 
 
 
468 aa  278  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2009  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  40.3 
 
 
471 aa  277  4e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0177  mercuric reductase MerA  38.32 
 
 
469 aa  271  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2994  mercuric reductase  36.51 
 
 
485 aa  268  1e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0504  mercuric reductase  34.89 
 
 
449 aa  266  5e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1504  mercuric reductase  36.55 
 
 
453 aa  258  2e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.25653 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1241  mercuric reductase  35.44 
 
 
448 aa  252  1e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.446801  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  34.27 
 
 
460 aa  243  5e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4961  mercuric reductase  32.79 
 
 
460 aa  240  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.91 
 
 
469 aa  238  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4636  mercuric reductase  33.99 
 
 
458 aa  237  4e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.295825 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  33.4 
 
 
468 aa  236  5.0000000000000005e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.24 
 
 
468 aa  236  7e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7124  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.01 
 
 
467 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650146  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2133  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.95 
 
 
467 aa  234  3e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.191316  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4997  mercuric reductase  34.25 
 
 
459 aa  232  8.000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2630  mercuric reductase  33.54 
 
 
466 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1496  mercuric reductase  33.61 
 
 
467 aa  231  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.27 
 
 
467 aa  231  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.99 
 
 
467 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_003296  RS02078  mercuric reductase  34.56 
 
 
459 aa  229  7e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5011  mercuric reductase  36.06 
 
 
459 aa  229  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1035  normal  0.205591 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.55 
 
 
456 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4668  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.6 
 
 
482 aa  228  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1213  mercuric reductase  33.4 
 
 
464 aa  227  4e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.76 
 
 
484 aa  226  7e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0352  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.26 
 
 
475 aa  226  7e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.55 
 
 
484 aa  226  8e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5390  mercuric reductase  35.29 
 
 
458 aa  226  8e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3551  mercuric reductase  35.08 
 
 
458 aa  226  9e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  normal  0.343975 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3749  mercuric reductase  34.32 
 
 
510 aa  225  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3872  mercuric reductase  35.5 
 
 
459 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.429317 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  32.98 
 
 
704 aa  225  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3648  mercuric reductase  35.08 
 
 
459 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.948829 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1598  mercuric reductase  34.97 
 
 
510 aa  224  3e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.92 
 
 
475 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1496  mercuric reductase  33.61 
 
 
466 aa  224  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.32667 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4715  mercuric reductase  35.08 
 
 
459 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>