More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1496 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1496  mercuric reductase  79.01 
 
 
467 aa  748    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1496  mercuric reductase  100 
 
 
466 aa  945    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.32667 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2630  mercuric reductase  89.48 
 
 
466 aa  865    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0385  mercuric reductase  54.41 
 
 
459 aa  524  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2463  mercuric reductase  55.77 
 
 
459 aa  523  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.736078 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5056  mercuric reductase  54.91 
 
 
459 aa  524  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135768 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4715  mercuric reductase  55.34 
 
 
459 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3648  mercuric reductase  55.34 
 
 
459 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.948829 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3872  mercuric reductase  55.13 
 
 
459 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.429317 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3897  mercuric reductase  52.99 
 
 
459 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.423332 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3669  mercuric reductase  55.27 
 
 
459 aa  511  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4011  mercuric reductase  52.99 
 
 
459 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0854657  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02078  mercuric reductase  53.1 
 
 
459 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3551  mercuric reductase  54.06 
 
 
458 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  normal  0.343975 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5390  mercuric reductase  54.06 
 
 
458 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0194  mercuric reductase  53.43 
 
 
459 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0283  mercuric reductase  53.43 
 
 
590 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1652  mercuric reductase  53.43 
 
 
459 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5011  mercuric reductase  54.82 
 
 
459 aa  503  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1035  normal  0.205591 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0840  mercuric reductase  52.15 
 
 
459 aa  495  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.909893 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4997  mercuric reductase  52.24 
 
 
459 aa  491  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3142  mercuric reductase  53.45 
 
 
459 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3154  mercuric reductase  53.45 
 
 
459 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3204  mercuric reductase  53.45 
 
 
459 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1509  mercuric reductase  53.22 
 
 
461 aa  486  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344309  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3059  mercuric reductase  52.48 
 
 
460 aa  485  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0658861 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4636  mercuric reductase  52.58 
 
 
458 aa  484  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.295825 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3468  mercuric reductase  52.27 
 
 
457 aa  484  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211907  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6744  mercuric reductase  50.76 
 
 
453 aa  478  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.520469  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5831  mercuric reductase  51.16 
 
 
455 aa  478  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194109  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2876  mercuric reductase  51.82 
 
 
458 aa  473  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00432777 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5924  mercuric reductase  50.66 
 
 
461 aa  456  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184883  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2443  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.23 
 
 
469 aa  377  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  39.96 
 
 
460 aa  358  9.999999999999999e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4961  mercuric reductase  40.74 
 
 
460 aa  347  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1472  mercuric reductase  43.56 
 
 
473 aa  323  3e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.505901  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.44 
 
 
456 aa  322  9.000000000000001e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2206  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.17 
 
 
459 aa  316  6e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.041685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0984  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.5 
 
 
457 aa  311  1e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.365373  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  37.5 
 
 
457 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00285558  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1270  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.48 
 
 
460 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.751643  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3460  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.31 
 
 
458 aa  302  8.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6297  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.64 
 
 
466 aa  300  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0298  hypothetical protein  37.41 
 
 
464 aa  299  8e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1668  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.19 
 
 
459 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0297676  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1741  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.41 
 
 
459 aa  297  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0314  hypothetical protein  37.41 
 
 
464 aa  295  1e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0336  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  37.8 
 
 
441 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0356  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  37.37 
 
 
441 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.488111  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0356  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  37.15 
 
 
441 aa  282  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.800994 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0318  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  37.15 
 
 
441 aa  281  2e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3301  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  36.93 
 
 
441 aa  280  3e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3318  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  36.93 
 
 
441 aa  280  3e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.84 
 
 
459 aa  280  3e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00260  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  36.72 
 
 
441 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00264  hypothetical protein  36.72 
 
 
441 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0176  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.42 
 
 
451 aa  270  5e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0242  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  32.33 
 
 
443 aa  265  8.999999999999999e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.235438  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1554  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  33.77 
 
 
443 aa  260  5.0000000000000005e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5092  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.16 
 
 
454 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5184  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.16 
 
 
454 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.0255046 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5175  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.78 
 
 
454 aa  257  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.417029  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.93 
 
 
475 aa  255  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2561  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.29 
 
 
464 aa  254  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177221  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3183  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.17 
 
 
432 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0205  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.84 
 
 
458 aa  252  8.000000000000001e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00131568  normal  0.41875 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C35  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  32.24 
 
 
449 aa  252  1e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0730  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  35.34 
 
 
441 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0725774  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0665  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  35.13 
 
 
441 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0609  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  35.13 
 
 
441 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0615  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  35.13 
 
 
441 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.554301 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0675  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  35.13 
 
 
441 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399771  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0617  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.52 
 
 
440 aa  246  9e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0632  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.52 
 
 
440 aa  246  9e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.33 
 
 
468 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0248  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase YkgC  34.76 
 
 
446 aa  243  7.999999999999999e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0163606  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0256  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  32.84 
 
 
484 aa  242  9e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1982  mercuric reductase  34.06 
 
 
507 aa  242  9e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0588  type II secretion system protein E  32.75 
 
 
446 aa  242  1e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3964  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.33 
 
 
468 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321391  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.75 
 
 
465 aa  241  2e-62  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4996  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.78 
 
 
462 aa  240  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.77 
 
 
467 aa  240  4e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0938  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.7 
 
 
471 aa  239  9e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.9 
 
 
492 aa  238  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.33 
 
 
467 aa  238  2e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  34.28 
 
 
704 aa  237  3e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.41 
 
 
463 aa  237  4e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1532  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.55 
 
 
460 aa  235  1.0000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.631051 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3488  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.16 
 
 
478 aa  233  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.531012  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3360  dihydrolipoyl dehydrogenanse  32.53 
 
 
466 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0306833 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  29.3 
 
 
546 aa  233  5e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3400  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.28 
 
 
470 aa  233  6e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.131603  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  29.3 
 
 
546 aa  233  7.000000000000001e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0242  putative mercuric reductase  34.41 
 
 
467 aa  233  8.000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2133  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.31 
 
 
467 aa  231  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.191316  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2936  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.75 
 
 
468 aa  231  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.48 
 
 
467 aa  231  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1271  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.2 
 
 
478 aa  231  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.547338 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.87 
 
 
465 aa  230  4e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>