More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0176 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0176  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  100 
 
 		 451 aa  926    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1554  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  63.74 
 
 		 443 aa  577  1.0000000000000001e-163  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C35  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  53.97 
 
 		 449 aa  488  1e-136  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0632  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.43 
 
 		 440 aa  413  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0617  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.43 
 
 		 440 aa  413  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0984  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.49 
 
 		 457 aa  410  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.365373  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  46.15 
 
 		 457 aa  408  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00285558  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0242  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  45.72 
 
 		 443 aa  402  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.235438  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00260  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  46.4 
 
 		 441 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3301  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  46.62 
 
 		 441 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0356  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  46.85 
 
 		 441 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.488111  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3318  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  46.62 
 
 		 441 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00264  hypothetical protein  46.4 
 
 		 441 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0356  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  46.4 
 
 		 441 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.800994 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0318  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  46.62 
 
 		 441 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0336  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  46.4 
 
 		 441 aa  398  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0615  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  45.72 
 
 		 441 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.554301 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0675  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  45.72 
 
 		 441 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0730  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  45.5 
 
 		 441 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0725774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0609  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  45.72 
 
 		 441 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0665  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  45.72 
 
 		 441 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1752  acetoin/pyruvate dehydrogenase E3 component  40.96 
 
 		 538 aa  381  1e-104  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2561  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.89 
 
 		 464 aa  366  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177221  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0112  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  43.71 
 
 		 439 aa  363  3e-99  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0596  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  45.54 
 
 		 438 aa  354  1e-96  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.180597  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0205  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.65 
 
 		 458 aa  342  1e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00131568  normal  0.41875 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0248  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase YkgC  39.96 
 
 		 446 aa  330  3e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0163606  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0588  type II secretion system protein E  39.51 
 
 		 446 aa  316  4e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0441  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.21 
 
 		 450 aa  304  2.0000000000000002e-81  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0314  hypothetical protein  37.05 
 
 		 464 aa  300  4e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0298  hypothetical protein  36.91 
 
 		 464 aa  298  1e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6297  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.78 
 
 		 466 aa  294  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1496  mercuric reductase  37.97 
 
 		 467 aa  289  9e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1270  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.14 
 
 		 460 aa  288  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.751643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5175  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.84 
 
 		 454 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.417029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5184  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.68 
 
 		 454 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.0255046 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5092  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.68 
 
 		 454 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3183  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.4 
 
 		 432 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  33.63 
 
 		 460 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1496  mercuric reductase  36.42 
 
 		 466 aa  270  5e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.32667 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3059  mercuric reductase  36.62 
 
 		 460 aa  269  8e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0658861 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2630  mercuric reductase  35.54 
 
 		 466 aa  266  5e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0840  mercuric reductase  33.56 
 
 		 459 aa  263  4e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.909893 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1509  mercuric reductase  33.48 
 
 		 461 aa  261  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1472  mercuric reductase  33.41 
 
 		 473 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.505901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4961  mercuric reductase  32.83 
 
 		 460 aa  260  5.0000000000000005e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6744  mercuric reductase  35.14 
 
 		 453 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.520469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3468  mercuric reductase  33.99 
 
 		 457 aa  257  4e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4636  mercuric reductase  34.58 
 
 		 458 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295825 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4997  mercuric reductase  33.85 
 
 		 459 aa  250  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3897  mercuric reductase  32.18 
 
 		 459 aa  248  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.423332 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4011  mercuric reductase  32.18 
 
 		 459 aa  248  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0854657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5831  mercuric reductase  34.56 
 
 		 455 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.04 
 
 		 456 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3669  mercuric reductase  33.41 
 
 		 459 aa  246  9e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0283  mercuric reductase  33.48 
 
 		 590 aa  243  6e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0194  mercuric reductase  33.48 
 
 		 459 aa  243  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3154  mercuric reductase  32.9 
 
 		 459 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3551  mercuric reductase  32.24 
 
 		 458 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  normal  0.343975 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3142  mercuric reductase  32.9 
 
 		 459 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5390  mercuric reductase  32.89 
 
 		 458 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3204  mercuric reductase  32.9 
 
 		 459 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_003296  RS02078  mercuric reductase  31.58 
 
 		 459 aa  241  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1652  mercuric reductase  33.26 
 
 		 459 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5924  mercuric reductase  33.7 
 
 		 461 aa  240  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184883  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0385  mercuric reductase  32.6 
 
 		 459 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  33.05 
 
 		 546 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5056  mercuric reductase  33.04 
 
 		 459 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135768 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2876  mercuric reductase  32.83 
 
 		 458 aa  238  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00432777 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2463  mercuric reductase  33.12 
 
 		 459 aa  237  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.736078 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3872  mercuric reductase  31.14 
 
 		 459 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.429317 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3460  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.54 
 
 		 458 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3648  mercuric reductase  31.29 
 
 		 459 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.948829 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4715  mercuric reductase  31.29 
 
 		 459 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.19 
 
 		 484 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  31.56 
 
 		 546 aa  227  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2649  mercuric reductase  32.01 
 
 		 478 aa  226  5.0000000000000005e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5011  mercuric reductase  33.56 
 
 		 459 aa  226  8e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1035  normal  0.205591 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2443  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.76 
 
 		 469 aa  225  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  32.89 
 
 		 767 aa  223  4.9999999999999996e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  30.67 
 
 		 546 aa  223  8e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  30.67 
 
 		 546 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.55 
 
 		 484 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1998  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.17 
 
 		 481 aa  221  3e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.12 
 
 		 484 aa  219  6e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1388  mercuric reductase  33.65 
 
 		 557 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000433137  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1148  mercuric reductase  32.1 
 
 		 457 aa  219  8.999999999999998e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  33.11 
 
 		 745 aa  218  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.75 
 
 		 459 aa  218  1e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.24 
 
 		 459 aa  218  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.21 
 
 		 467 aa  217  2.9999999999999998e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3424  mercuric reductase  30.65 
 
 		 468 aa  217  4e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0643  NADPH-glutathione reductase  29.87 
 
 		 459 aa  216  5e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.99 
 
 		 467 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2801  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.59 
 
 		 459 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2585  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.81 
 
 		 459 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295349  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2773  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.81 
 
 		 459 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2776  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.37 
 
 		 459 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0539747 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  31.22 
 
 		 550 aa  213  7e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2351  glutathione reductase  30.31 
 
 		 452 aa  213  7e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150308  normal  0.0125633 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>