More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3301 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00260  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  99.77 
 
 		 441 aa  905    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3301  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  100 
 
 		 441 aa  908    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0318  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  99.09 
 
 		 441 aa  902    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0356  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  99.32 
 
 		 441 aa  903    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.488111  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3318  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  100 
 
 		 441 aa  908    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0615  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  74.6 
 
 		 441 aa  667    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.554301 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0336  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  98.41 
 
 		 441 aa  895    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0609  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  74.38 
 
 		 441 aa  664    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0675  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  74.6 
 
 		 441 aa  667    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00264  hypothetical protein  99.77 
 
 		 441 aa  905    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0730  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  75.06 
 
 		 441 aa  671    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0725774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0665  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  74.6 
 
 		 441 aa  667    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0356  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  99.32 
 
 		 441 aa  903    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.800994 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0984  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  51.2 
 
 		 457 aa  479  1e-134  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.365373  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  51.2 
 
 		 457 aa  475  1e-133  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00285558  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0242  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  48.52 
 
 		 443 aa  447  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.235438  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C35  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  47.94 
 
 		 449 aa  442  1e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1554  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  49.66 
 
 		 443 aa  444  1e-123  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0632  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  49.21 
 
 		 440 aa  436  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0617  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  49.21 
 
 		 440 aa  436  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0176  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  46.62 
 
 		 451 aa  422  1e-117  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0205  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.13 
 
 		 458 aa  399  9.999999999999999e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00131568  normal  0.41875 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0112  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  45.33 
 
 		 439 aa  389  1e-107  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2561  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  44.05 
 
 		 464 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0596  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  46.47 
 
 		 438 aa  381  1e-104  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.180597  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0248  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase YkgC  43.72 
 
 		 446 aa  365  1e-100  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0163606  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0588  type II secretion system protein E  43.15 
 
 		 446 aa  357  1.9999999999999998e-97  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0298  hypothetical protein  39.73 
 
 		 464 aa  333  4e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0314  hypothetical protein  39.51 
 
 		 464 aa  331  1e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  39.22 
 
 		 460 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2630  mercuric reductase  38.66 
 
 		 466 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4961  mercuric reductase  35.29 
 
 		 460 aa  300  4e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1496  mercuric reductase  37.53 
 
 		 467 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1496  mercuric reductase  37.15 
 
 		 466 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.32667 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0441  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.02 
 
 		 450 aa  292  7e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1509  mercuric reductase  36.07 
 
 		 461 aa  290  3e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3204  mercuric reductase  37.2 
 
 		 459 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3154  mercuric reductase  37.2 
 
 		 459 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3142  mercuric reductase  37.2 
 
 		 459 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4636  mercuric reductase  38.13 
 
 		 458 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295825 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6744  mercuric reductase  35.85 
 
 		 453 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.520469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6297  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.13 
 
 		 466 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0385  mercuric reductase  36.3 
 
 		 459 aa  282  8.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1472  mercuric reductase  37.15 
 
 		 473 aa  282  8.000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.505901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1270  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.36 
 
 		 460 aa  281  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.751643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3468  mercuric reductase  35.89 
 
 		 457 aa  280  4e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3059  mercuric reductase  37.36 
 
 		 460 aa  280  5e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0658861 
 
 
-
 
NC_003296  RS02078  mercuric reductase  35.21 
 
 		 459 aa  276  6e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.38 
 
 		 456 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0840  mercuric reductase  35.4 
 
 		 459 aa  273  4.0000000000000004e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.909893 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2463  mercuric reductase  35.31 
 
 		 459 aa  273  6e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.736078 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5390  mercuric reductase  34.79 
 
 		 458 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3551  mercuric reductase  34.79 
 
 		 458 aa  272  9e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  normal  0.343975 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5831  mercuric reductase  35.85 
 
 		 455 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3872  mercuric reductase  34.87 
 
 		 459 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.429317 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3897  mercuric reductase  34.72 
 
 		 459 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.423332 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4011  mercuric reductase  34.72 
 
 		 459 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0854657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5092  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.92 
 
 		 454 aa  269  8e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5184  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.92 
 
 		 454 aa  269  8e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.0255046 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4715  mercuric reductase  34.87 
 
 		 459 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3648  mercuric reductase  34.87 
 
 		 459 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.948829 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5056  mercuric reductase  34.79 
 
 		 459 aa  267  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135768 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1652  mercuric reductase  34.64 
 
 		 459 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0283  mercuric reductase  34.64 
 
 		 590 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4997  mercuric reductase  33.84 
 
 		 459 aa  264  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0194  mercuric reductase  34.64 
 
 		 459 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3183  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.33 
 
 		 432 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2443  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.7 
 
 		 469 aa  263  4e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3669  mercuric reductase  35.68 
 
 		 459 aa  263  4e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  33.63 
 
 		 546 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5175  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.25 
 
 		 454 aa  257  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.417029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2876  mercuric reductase  32.83 
 
 		 458 aa  252  1e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00432777 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0840  mercuric reductase  33.77 
 
 		 469 aa  249  8e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5011  mercuric reductase  35.32 
 
 		 459 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1035  normal  0.205591 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3424  mercuric reductase  33.19 
 
 		 468 aa  241  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  30.91 
 
 		 546 aa  241  2e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  32.38 
 
 		 546 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5924  mercuric reductase  34.52 
 
 		 461 aa  241  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184883  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  30.91 
 
 		 546 aa  240  4e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0177  mercuric reductase MerA  32.97 
 
 		 469 aa  240  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1668  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.62 
 
 		 459 aa  239  8e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0297676  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  32.48 
 
 		 548 aa  238  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2206  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34 
 
 		 459 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.041685  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3460  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.54 
 
 		 458 aa  236  7e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1741  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.73 
 
 		 459 aa  236  9e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0654  mercuric reductase  33.33 
 
 		 468 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.87809e-24 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.09 
 
 		 459 aa  233  7.000000000000001e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1752  acetoin/pyruvate dehydrogenase E3 component  50 
 
 		 538 aa  232  1e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  33.7 
 
 		 745 aa  232  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.81 
 
 		 585 aa  231  1e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0640  mercuric reductase  33.26 
 
 		 468 aa  231  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0483  putative mercuric reductase  32.66 
 
 		 562 aa  229  8e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.93 
 
 		 459 aa  226  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.94 
 
 		 468 aa  227  4e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000305556  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.94 
 
 		 468 aa  227  4e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00928669  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  32.46 
 
 		 475 aa  225  1e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2585  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.71 
 
 		 459 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295349  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2773  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.71 
 
 		 459 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  34.07 
 
 		 767 aa  224  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29750  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.6 
 
 		 477 aa  223  4e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.913625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>