More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1472 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1472  mercuric reductase  100 
 
 		 473 aa  931    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.505901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4961  mercuric reductase  45.08 
 
 		 460 aa  436  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  44.23 
 
 		 460 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_003296  RS02078  mercuric reductase  45.14 
 
 		 459 aa  384  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1652  mercuric reductase  45.67 
 
 		 459 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3551  mercuric reductase  43.78 
 
 		 458 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  normal  0.343975 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0283  mercuric reductase  45.67 
 
 		 590 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5390  mercuric reductase  44.28 
 
 		 458 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0194  mercuric reductase  45.67 
 
 		 459 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0385  mercuric reductase  44.42 
 
 		 459 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3872  mercuric reductase  43.75 
 
 		 459 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.429317 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5011  mercuric reductase  47.45 
 
 		 459 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1035  normal  0.205591 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4715  mercuric reductase  43.75 
 
 		 459 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3648  mercuric reductase  43.75 
 
 		 459 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.948829 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3468  mercuric reductase  44.61 
 
 		 457 aa  374  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3059  mercuric reductase  43.5 
 
 		 460 aa  372  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0658861 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1509  mercuric reductase  43.32 
 
 		 461 aa  375  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0840  mercuric reductase  41.38 
 
 		 459 aa  374  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.909893 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1496  mercuric reductase  44.64 
 
 		 467 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4997  mercuric reductase  42.4 
 
 		 459 aa  371  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4636  mercuric reductase  42.46 
 
 		 458 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295825 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3897  mercuric reductase  43.29 
 
 		 459 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.423332 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5056  mercuric reductase  43.32 
 
 		 459 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135768 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2463  mercuric reductase  43.32 
 
 		 459 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.736078 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4011  mercuric reductase  43.29 
 
 		 459 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0854657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3154  mercuric reductase  41.88 
 
 		 459 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3204  mercuric reductase  41.88 
 
 		 459 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3142  mercuric reductase  41.88 
 
 		 459 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1496  mercuric reductase  43.47 
 
 		 466 aa  363  4e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.32667 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6297  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  44.13 
 
 		 466 aa  359  6e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3669  mercuric reductase  44.71 
 
 		 459 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2630  mercuric reductase  42.49 
 
 		 466 aa  356  5e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1270  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  45.26 
 
 		 460 aa  355  1e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.751643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5831  mercuric reductase  41.38 
 
 		 455 aa  355  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6744  mercuric reductase  40.73 
 
 		 453 aa  355  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.520469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5924  mercuric reductase  43.33 
 
 		 461 aa  354  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184883  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2876  mercuric reductase  42.86 
 
 		 458 aa  353  5e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00432777 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  43.35 
 
 		 456 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0298  hypothetical protein  41.38 
 
 		 464 aa  334  2e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0314  hypothetical protein  41.16 
 
 		 464 aa  332  1e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2206  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.87 
 
 		 459 aa  327  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.041685  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2443  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.66 
 
 		 469 aa  324  2e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5175  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  43.3 
 
 		 454 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.417029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1741  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  46.19 
 
 		 459 aa  318  9e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1668  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  46.19 
 
 		 459 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0297676  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  34.48 
 
 		 457 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00285558  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0984  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.7 
 
 		 457 aa  312  9e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.365373  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5092  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.66 
 
 		 454 aa  308  9e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5184  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.66 
 
 		 454 aa  308  9e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.0255046 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3183  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.96 
 
 		 432 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3460  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.77 
 
 		 458 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.84 
 
 		 459 aa  300  4e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0609  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  40.69 
 
 		 441 aa  295  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0730  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  40.26 
 
 		 441 aa  293  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0725774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0615  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  40.48 
 
 		 441 aa  292  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.554301 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0665  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  40.48 
 
 		 441 aa  292  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0675  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  40.48 
 
 		 441 aa  292  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399771  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0242  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  33.55 
 
 		 443 aa  290  3e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.235438  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0356  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  37.37 
 
 		 441 aa  290  4e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.800994 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3301  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  37.37 
 
 		 441 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3318  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  37.37 
 
 		 441 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0336  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  37.15 
 
 		 441 aa  290  6e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0356  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  37.37 
 
 		 441 aa  289  9e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.488111  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00260  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  37.15 
 
 		 441 aa  288  2e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00264  hypothetical protein  37.15 
 
 		 441 aa  288  2e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0318  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  37.15 
 
 		 441 aa  286  5e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0205  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.81 
 
 		 458 aa  283  7.000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00131568  normal  0.41875 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0176  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.55 
 
 		 451 aa  272  9e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0588  type II secretion system protein E  33.48 
 
 		 446 aa  270  5.9999999999999995e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.66 
 
 		 482 aa  268  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  33.48 
 
 		 546 aa  266  7e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  33.48 
 
 		 546 aa  265  1e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1118  mercuric reductase  36.77 
 
 		 516 aa  264  3e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.583122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C35  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  32.91 
 
 		 449 aa  258  1e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1481  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.89 
 
 		 494 aa  256  6e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0632  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.26 
 
 		 440 aa  256  7e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0617  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.26 
 
 		 440 aa  256  7e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.91 
 
 		 475 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.91 
 
 		 475 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0256  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  36.67 
 
 		 484 aa  253  6e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1239  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.75 
 
 		 495 aa  250  4e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.375161 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.15 
 
 		 473 aa  249  5e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  32.75 
 
 		 546 aa  249  6e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1982  mercuric reductase  34.42 
 
 		 507 aa  249  6e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1554  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  31.51 
 
 		 443 aa  248  1e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4940  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.48 
 
 		 472 aa  247  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0441  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.33 
 
 		 450 aa  246  4e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2561  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.1 
 
 		 464 aa  245  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1388  mercuric reductase  35.39 
 
 		 557 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000433137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0473  mercuric reductase  36.24 
 
 		 507 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000001036 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1598  mercuric reductase  34.07 
 
 		 510 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1256  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.96 
 
 		 487 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0242  putative mercuric reductase  35 
 
 		 467 aa  244  3e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02949  putative mercuric reductase  35 
 
 		 503 aa  244  3e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187984  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4010  putative mercuric reductase  34.57 
 
 		 468 aa  243  3.9999999999999997e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2758  putative mercuric reductase  37.1 
 
 		 468 aa  241  2e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0352  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.74 
 
 		 475 aa  241  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0168  putative mercuric reductase  34.07 
 
 		 550 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3488  putative mercuric reductase  34.22 
 
 		 552 aa  240  4e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.852286  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4311  putative mercuric reductase  34.8 
 
 		 551 aa  240  5e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>