More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4997 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RS02078  mercuric reductase  67.25 
 
 
459 aa  646    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4636  mercuric reductase  68.41 
 
 
458 aa  659    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.295825 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3204  mercuric reductase  67.69 
 
 
459 aa  638    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0385  mercuric reductase  68.2 
 
 
459 aa  661    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3468  mercuric reductase  67.18 
 
 
457 aa  635    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211907  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0194  mercuric reductase  66.96 
 
 
459 aa  645    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1652  mercuric reductase  66.96 
 
 
459 aa  644    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3669  mercuric reductase  68.78 
 
 
459 aa  651    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0283  mercuric reductase  67.18 
 
 
590 aa  645    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2463  mercuric reductase  67.54 
 
 
459 aa  650    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.736078 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3872  mercuric reductase  67.76 
 
 
459 aa  655    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.429317 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3897  mercuric reductase  66.3 
 
 
459 aa  648    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.423332 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3154  mercuric reductase  67.69 
 
 
459 aa  638    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2876  mercuric reductase  65.5 
 
 
458 aa  636    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00432777 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4011  mercuric reductase  66.3 
 
 
459 aa  648    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0854657  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4997  mercuric reductase  100 
 
 
459 aa  936    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0840  mercuric reductase  65.8 
 
 
459 aa  649    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.909893 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5056  mercuric reductase  66.67 
 
 
459 aa  649    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135768 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4715  mercuric reductase  67.32 
 
 
459 aa  652    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3142  mercuric reductase  67.69 
 
 
459 aa  638    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5390  mercuric reductase  65.8 
 
 
458 aa  637    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3648  mercuric reductase  67.32 
 
 
459 aa  652    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.948829 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3551  mercuric reductase  65.14 
 
 
458 aa  631  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  normal  0.343975 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5011  mercuric reductase  67.69 
 
 
459 aa  624  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1035  normal  0.205591 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3059  mercuric reductase  66.67 
 
 
460 aa  620  1e-176  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0658861 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5924  mercuric reductase  66.08 
 
 
461 aa  614  1e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184883  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1509  mercuric reductase  61.84 
 
 
461 aa  595  1e-169  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344309  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6744  mercuric reductase  62.28 
 
 
453 aa  589  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.520469  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5831  mercuric reductase  62.36 
 
 
455 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194109  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1496  mercuric reductase  52.88 
 
 
467 aa  494  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2630  mercuric reductase  51.81 
 
 
466 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1496  mercuric reductase  52.24 
 
 
466 aa  491  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.32667 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2443  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.83 
 
 
469 aa  395  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1270  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  43.6 
 
 
460 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.751643  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4961  mercuric reductase  38.56 
 
 
460 aa  353  5e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  38.13 
 
 
460 aa  338  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  42.11 
 
 
456 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6297  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.18 
 
 
466 aa  331  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1472  mercuric reductase  42.4 
 
 
473 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.505901  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2206  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.07 
 
 
459 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.041685  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0298  hypothetical protein  37.95 
 
 
464 aa  315  8e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1741  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  44.52 
 
 
459 aa  312  6.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0314  hypothetical protein  37.74 
 
 
464 aa  310  2e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1668  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  44.07 
 
 
459 aa  309  5e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0297676  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.86 
 
 
459 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  37.42 
 
 
457 aa  301  2e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00285558  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0984  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.76 
 
 
457 aa  294  2e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.365373  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3460  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.33 
 
 
458 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5092  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.43 
 
 
454 aa  273  7e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5184  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.43 
 
 
454 aa  273  7e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.0255046 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3183  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.24 
 
 
432 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5175  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.89 
 
 
454 aa  266  5e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.417029  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0205  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.79 
 
 
458 aa  263  3e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00131568  normal  0.41875 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1982  mercuric reductase  33.92 
 
 
507 aa  263  3e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0242  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  31.21 
 
 
443 aa  261  2e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.235438  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0609  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  36.66 
 
 
441 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0665  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  36.44 
 
 
441 aa  256  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0675  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  36.44 
 
 
441 aa  256  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399771  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0615  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  36.44 
 
 
441 aa  256  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.554301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2561  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.9 
 
 
464 aa  256  7e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177221  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0903  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.26 
 
 
462 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0730  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  36.01 
 
 
441 aa  252  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0725774  normal 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C35  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  33.63 
 
 
449 aa  251  1e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0336  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.13 
 
 
441 aa  252  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0356  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.35 
 
 
441 aa  251  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.488111  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0176  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.85 
 
 
451 aa  250  4e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0318  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.13 
 
 
441 aa  249  6e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3301  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  33.84 
 
 
441 aa  248  1e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3318  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  33.84 
 
 
441 aa  248  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0356  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  33.84 
 
 
441 aa  248  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.800994 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00260  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  33.91 
 
 
441 aa  247  3e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00264  hypothetical protein  33.91 
 
 
441 aa  247  3e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.11 
 
 
482 aa  246  8e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1554  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  32.23 
 
 
443 aa  246  8e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0617  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.13 
 
 
440 aa  245  9e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0632  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.13 
 
 
440 aa  245  9e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0751  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.1 
 
 
473 aa  241  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0309  mercuric reductase  35.06 
 
 
525 aa  238  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0315  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.16 
 
 
471 aa  239  1e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  34.44 
 
 
475 aa  239  1e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0304  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.31 
 
 
474 aa  236  7e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3749  mercuric reductase  32.75 
 
 
510 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1752  acetoin/pyruvate dehydrogenase E3 component  31.27 
 
 
538 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  31.54 
 
 
546 aa  234  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2048  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.32 
 
 
474 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.47477  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1315  mercuric reductase  34.82 
 
 
505 aa  231  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3049  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.66 
 
 
472 aa  231  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0397378  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1439  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.26 
 
 
469 aa  231  3e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.75 
 
 
476 aa  231  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3488  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.92 
 
 
478 aa  230  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.531012  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0654  mercuric reductase  32.14 
 
 
468 aa  229  5e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.87809e-24 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1432  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.75 
 
 
476 aa  229  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21637  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.32 
 
 
476 aa  229  7e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2549  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.85 
 
 
472 aa  229  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0494976  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0112  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  32.3 
 
 
439 aa  229  1e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.75 
 
 
476 aa  229  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.75 
 
 
476 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.75 
 
 
476 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.67 
 
 
475 aa  228  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.68 
 
 
713 aa  228  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>