More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3488 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3488  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  100 
 
 		 478 aa  965    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.531012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5878  mycothione reductase  58.02 
 
 		 460 aa  552  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5390  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  55.86 
 
 		 465 aa  518  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.685666 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10080  mycothione reductase  54.49 
 
 		 466 aa  514  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0975361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2195  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  52.5 
 
 		 469 aa  464  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000774241  hitchhiker  0.00141169 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12870  mycothione reductase  48.43 
 
 		 459 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.135712  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1696  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  48.21 
 
 		 469 aa  408  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142602  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4054  mycothione reductase  49.27 
 
 		 470 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.703366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2050  mycothione reductase  47.6 
 
 		 470 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2067  mycothione reductase  47.6 
 
 		 470 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.159989  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09170  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  48.02 
 
 		 475 aa  401  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283418  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2113  mycothione reductase  47.6 
 
 		 470 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.207955  normal  0.0141084 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2298  mycothione reductase  47.6 
 
 		 469 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270268 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1643  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  47.69 
 
 		 474 aa  389  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000472029 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2130  mycothione reductase  46.19 
 
 		 464 aa  389  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.503615  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05900  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.82 
 
 		 477 aa  382  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.257436 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0265  mycothione reductase  45.25 
 
 		 468 aa  385  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13800  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  44.28 
 
 		 487 aa  362  7.0000000000000005e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.162356  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08580  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  41.91 
 
 		 467 aa  331  2e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.745964 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0256  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  37.74 
 
 		 484 aa  293  5e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0903  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.35 
 
 		 462 aa  292  1e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1256  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.91 
 
 		 487 aa  287  2.9999999999999996e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0842  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.25 
 
 		 457 aa  282  8.000000000000001e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.754028  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3630  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  38.53 
 
 		 536 aa  275  9e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.353308  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2738  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  37.08 
 
 		 488 aa  269  5.9999999999999995e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1804  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  35.69 
 
 		 528 aa  263  4e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2696  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.53 
 
 		 476 aa  261  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.303551  normal  0.202311 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1824  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.81 
 
 		 469 aa  256  6e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.372731  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4715  mercuric reductase  34.19 
 
 		 459 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3648  mercuric reductase  34.19 
 
 		 459 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.948829 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3551  mercuric reductase  35.11 
 
 		 458 aa  253  6e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  normal  0.343975 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3872  mercuric reductase  34.47 
 
 		 459 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.429317 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4636  mercuric reductase  34.67 
 
 		 458 aa  252  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295825 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1783  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.69 
 
 		 475 aa  251  2e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5390  mercuric reductase  35.11 
 
 		 458 aa  251  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2463  mercuric reductase  34.68 
 
 		 459 aa  249  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.736078 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3468  mercuric reductase  34.68 
 
 		 457 aa  249  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.28 
 
 		 458 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0385  mercuric reductase  33.69 
 
 		 459 aa  247  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5831  mercuric reductase  33.33 
 
 		 455 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6744  mercuric reductase  32.63 
 
 		 453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.520469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.66 
 
 		 463 aa  244  3e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3669  mercuric reductase  35.17 
 
 		 459 aa  242  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1496  mercuric reductase  35.52 
 
 		 466 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.32667 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5056  mercuric reductase  34.47 
 
 		 459 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135768 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0194  mercuric reductase  34.04 
 
 		 459 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0283  mercuric reductase  34.04 
 
 		 590 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1652  mercuric reductase  33.83 
 
 		 459 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1496  mercuric reductase  34.45 
 
 		 467 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3059  mercuric reductase  33.62 
 
 		 460 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0658861 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2630  mercuric reductase  35.02 
 
 		 466 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3897  mercuric reductase  33.4 
 
 		 459 aa  234  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.423332 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4011  mercuric reductase  33.4 
 
 		 459 aa  234  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0854657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.76 
 
 		 459 aa  233  8.000000000000001e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4997  mercuric reductase  32.14 
 
 		 459 aa  232  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2206  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.48 
 
 		 459 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.041685  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5011  mercuric reductase  34.61 
 
 		 459 aa  230  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1035  normal  0.205591 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.8 
 
 		 458 aa  230  5e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11020  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.99 
 
 		 465 aa  228  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.874516 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1805  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.53 
 
 		 616 aa  228  1e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3154  mercuric reductase  32.98 
 
 		 459 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0840  mercuric reductase  33.4 
 
 		 459 aa  229  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.909893 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3142  mercuric reductase  32.98 
 
 		 459 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3204  mercuric reductase  32.98 
 
 		 459 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.13 
 
 		 463 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.55 
 
 		 492 aa  226  6e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0496  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31.01 
 
 		 455 aa  226  7e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.19 
 
 		 465 aa  226  8e-58  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3964  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.92 
 
 		 468 aa  226  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  31.58 
 
 		 460 aa  226  9e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5367  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.88 
 
 		 467 aa  225  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5924  mercuric reductase  33.54 
 
 		 461 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184883  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1509  mercuric reductase  32.29 
 
 		 461 aa  225  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2479  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.61 
 
 		 467 aa  224  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.43 
 
 		 467 aa  224  3e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.43 
 
 		 468 aa  224  4e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3815  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.04 
 
 		 468 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02078  mercuric reductase  31.7 
 
 		 459 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.13 
 
 		 475 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1498  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.41 
 
 		 488 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000511741  hitchhiker  0.0000458564 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4940  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.39 
 
 		 472 aa  221  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4961  mercuric reductase  30 
 
 		 460 aa  221  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.13 
 
 		 475 aa  221  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.03 
 
 		 467 aa  221  3e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.03 
 
 		 467 aa  220  3.9999999999999997e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.54 
 
 		 456 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.78 
 
 		 468 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2549  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.54 
 
 		 471 aa  219  7e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.99 
 
 		 463 aa  219  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6148  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.7 
 
 		 461 aa  218  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268459  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.84 
 
 		 713 aa  218  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1665  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.27 
 
 		 491 aa  218  2e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.771016  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5475  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.04 
 
 		 466 aa  218  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67474  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.45 
 
 		 467 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2542  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.87 
 
 		 474 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.167426  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3352  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.96 
 
 		 474 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000157637  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.74 
 
 		 481 aa  216  7e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  33 
 
 		 476 aa  216  9e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  33 
 
 		 476 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0794  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.38 
 
 		 464 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0822036  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>