More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2195 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2195  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  100 
 
 
469 aa  944    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000774241  hitchhiker  0.00141169 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10080  mycothione reductase  58.03 
 
 
466 aa  516  1.0000000000000001e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0975361  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5878  mycothione reductase  56.03 
 
 
460 aa  504  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5390  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  51.17 
 
 
465 aa  467  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.685666 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3488  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  52.5 
 
 
478 aa  460  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.531012  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12870  mycothione reductase  50.74 
 
 
459 aa  433  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.135712  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2298  mycothione reductase  49.68 
 
 
469 aa  430  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.270268 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4054  mycothione reductase  49.48 
 
 
470 aa  426  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.703366  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2130  mycothione reductase  48.71 
 
 
464 aa  422  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.503615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2113  mycothione reductase  49.57 
 
 
470 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.207955  normal  0.0141084 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2050  mycothione reductase  49.57 
 
 
470 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2067  mycothione reductase  49.57 
 
 
470 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.159989  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1696  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  50.21 
 
 
469 aa  417  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142602  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09170  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  47.68 
 
 
475 aa  410  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283418  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1643  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  49.36 
 
 
474 aa  404  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000472029 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05900  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.64 
 
 
477 aa  392  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.257436 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13800  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  47.02 
 
 
487 aa  385  1e-106  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.162356  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0265  mycothione reductase  46.12 
 
 
468 aa  379  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08580  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  45.57 
 
 
467 aa  375  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.745964 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0903  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.98 
 
 
462 aa  281  2e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0256  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  37.08 
 
 
484 aa  275  2.0000000000000002e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3630  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  39.29 
 
 
536 aa  273  6e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.353308  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1256  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.81 
 
 
487 aa  266  4e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2738  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  37.83 
 
 
488 aa  256  4e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1783  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.7 
 
 
475 aa  247  3e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.41 
 
 
463 aa  246  8e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0842  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.73 
 
 
457 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.754028  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.88 
 
 
459 aa  242  1e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1496  mercuric reductase  36.61 
 
 
467 aa  238  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2696  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.91 
 
 
476 aa  236  7e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.303551  normal  0.202311 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  32.13 
 
 
460 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1804  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  33.2 
 
 
528 aa  233  4.0000000000000004e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5056  mercuric reductase  34.11 
 
 
459 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135768 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1095  glutathione-disulfide reductase  32.05 
 
 
460 aa  219  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.223789  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4011  mercuric reductase  32.91 
 
 
459 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0854657  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3897  mercuric reductase  32.91 
 
 
459 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.423332 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1824  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.14 
 
 
469 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.372731  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4332  glutathione reductase  31.81 
 
 
451 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3669  mercuric reductase  34.32 
 
 
459 aa  217  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3648  mercuric reductase  32.98 
 
 
459 aa  217  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.948829 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4715  mercuric reductase  32.98 
 
 
459 aa  217  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5390  mercuric reductase  33.19 
 
 
458 aa  217  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1652  mercuric reductase  32.98 
 
 
459 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2463  mercuric reductase  33.19 
 
 
459 aa  216  8e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.736078 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3872  mercuric reductase  32.98 
 
 
459 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.429317 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0385  mercuric reductase  32.84 
 
 
459 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0194  mercuric reductase  32.98 
 
 
459 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3551  mercuric reductase  32.98 
 
 
458 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  normal  0.343975 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0283  mercuric reductase  32.98 
 
 
590 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.31 
 
 
456 aa  216  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0298  hypothetical protein  30.93 
 
 
464 aa  214  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0682  NADPH-glutathione reductase  34.68 
 
 
459 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0286379  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3819  glutathione reductase  34.5 
 
 
451 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218299  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  32.22 
 
 
716 aa  214  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.32 
 
 
463 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5831  mercuric reductase  33.62 
 
 
455 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194109  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4961  mercuric reductase  30.85 
 
 
460 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0643  NADPH-glutathione reductase  34.57 
 
 
459 aa  213  7e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0314  hypothetical protein  30.93 
 
 
464 aa  213  7.999999999999999e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1509  mercuric reductase  33.89 
 
 
461 aa  212  9e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344309  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2124  NADPH-glutathione reductase  34.88 
 
 
459 aa  212  9e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.575049  normal  0.929555 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4254  glutathione reductase  33.12 
 
 
466 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4636  mercuric reductase  30.39 
 
 
458 aa  212  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.295825 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1496  mercuric reductase  31.92 
 
 
466 aa  212  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.32667 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1950  glutathione reductase  34.28 
 
 
451 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.447652  normal  0.37845 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1216  glutathione reductase  32.97 
 
 
448 aa  211  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.286586  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1270  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.2 
 
 
460 aa  210  5e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.751643  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3535  glutathione reductase  33.84 
 
 
451 aa  210  5e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0669246 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3039  glutathione-disulfide reductase  31.6 
 
 
450 aa  209  6e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.37 
 
 
458 aa  210  6e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3188  glutathione reductase  33.62 
 
 
451 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4955  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.93 
 
 
452 aa  209  8e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201124  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.1 
 
 
713 aa  209  9e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25010  glutathione reductase  33.12 
 
 
452 aa  209  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3112  glutathione reductase  31.81 
 
 
452 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.091737  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0127  glutathione-disulfide reductase  34.23 
 
 
448 aa  209  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2630  mercuric reductase  32.7 
 
 
466 aa  209  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2549  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.51 
 
 
471 aa  208  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02078  mercuric reductase  32.98 
 
 
459 aa  208  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  31.79 
 
 
546 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0840  mercuric reductase  30.21 
 
 
459 aa  208  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.909893 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0496  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  30.77 
 
 
455 aa  208  2e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6744  mercuric reductase  32.26 
 
 
453 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.520469  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.93 
 
 
465 aa  207  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38330  glutathione reductase  33.12 
 
 
451 aa  207  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0328915 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5011  mercuric reductase  33.19 
 
 
459 aa  206  9e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1035  normal  0.205591 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  29.05 
 
 
546 aa  205  1e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2979  glutathione reductase  32.1 
 
 
452 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0361278  normal  0.327486 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1608  glutathione reductase  31.88 
 
 
452 aa  205  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128494  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.79 
 
 
467 aa  206  1e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0271  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.89 
 
 
593 aa  205  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.146735  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2351  glutathione reductase  32.68 
 
 
452 aa  205  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150308  normal  0.0125633 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0884  glutathione-disulfide reductase  32.63 
 
 
452 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.508454 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0507  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.69 
 
 
464 aa  204  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  32.9 
 
 
546 aa  204  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.76 
 
 
465 aa  203  5e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.03 
 
 
467 aa  202  7e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  32.13 
 
 
720 aa  203  7e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0176  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.5 
 
 
451 aa  202  8e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2002  glutathione-disulfide reductase  31.59 
 
 
452 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>