More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1496 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1496  mercuric reductase  100 
 
 
467 aa  946    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1496  mercuric reductase  79.01 
 
 
466 aa  748    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.32667 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2630  mercuric reductase  76.23 
 
 
466 aa  734    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3897  mercuric reductase  55.01 
 
 
459 aa  532  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.423332 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4011  mercuric reductase  55.01 
 
 
459 aa  532  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0854657  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2463  mercuric reductase  55.65 
 
 
459 aa  528  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.736078 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5056  mercuric reductase  55.22 
 
 
459 aa  528  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135768 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4715  mercuric reductase  55.65 
 
 
459 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3872  mercuric reductase  55.65 
 
 
459 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.429317 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3648  mercuric reductase  55.65 
 
 
459 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.948829 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1652  mercuric reductase  55.46 
 
 
459 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0283  mercuric reductase  55.67 
 
 
590 aa  524  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0194  mercuric reductase  55.67 
 
 
459 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3551  mercuric reductase  55.74 
 
 
458 aa  521  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  normal  0.343975 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5390  mercuric reductase  55.44 
 
 
458 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02078  mercuric reductase  54.49 
 
 
459 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0385  mercuric reductase  53.98 
 
 
459 aa  514  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5011  mercuric reductase  56.56 
 
 
459 aa  505  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1035  normal  0.205591 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0840  mercuric reductase  52.88 
 
 
459 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.909893 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1509  mercuric reductase  53.53 
 
 
461 aa  503  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344309  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3154  mercuric reductase  54.62 
 
 
459 aa  501  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3142  mercuric reductase  54.62 
 
 
459 aa  501  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3204  mercuric reductase  54.62 
 
 
459 aa  501  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3669  mercuric reductase  53.85 
 
 
459 aa  497  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3059  mercuric reductase  53.23 
 
 
460 aa  496  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0658861 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4997  mercuric reductase  52.88 
 
 
459 aa  494  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3468  mercuric reductase  53.88 
 
 
457 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211907  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2876  mercuric reductase  53.85 
 
 
458 aa  491  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00432777 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4636  mercuric reductase  52.47 
 
 
458 aa  483  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.295825 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5831  mercuric reductase  51.18 
 
 
455 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194109  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6744  mercuric reductase  50.43 
 
 
453 aa  472  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.520469  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5924  mercuric reductase  50.43 
 
 
461 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184883  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2443  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.84 
 
 
469 aa  384  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  40.82 
 
 
460 aa  363  4e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4961  mercuric reductase  40.39 
 
 
460 aa  356  5e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1472  mercuric reductase  44.64 
 
 
473 aa  329  6e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.505901  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  39.27 
 
 
457 aa  327  3e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00285558  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.35 
 
 
456 aa  327  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0984  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.06 
 
 
457 aa  326  7e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.365373  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1270  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.25 
 
 
460 aa  323  3e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.751643  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2206  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.54 
 
 
459 aa  312  7.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.041685  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6297  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.48 
 
 
466 aa  309  5e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0298  hypothetical protein  37.73 
 
 
464 aa  307  3e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3460  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37 
 
 
458 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0314  hypothetical protein  37.5 
 
 
464 aa  303  6.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1668  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  42.32 
 
 
459 aa  299  6e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0297676  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1741  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.89 
 
 
459 aa  292  9e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.91 
 
 
459 aa  291  1e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0176  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.97 
 
 
451 aa  289  1e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0336  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  37.96 
 
 
441 aa  288  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0318  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  38.18 
 
 
441 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0356  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  37.74 
 
 
441 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.800994 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0356  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  37.74 
 
 
441 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.488111  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5092  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.61 
 
 
454 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5184  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.61 
 
 
454 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.0255046 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3301  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  37.53 
 
 
441 aa  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3318  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  37.53 
 
 
441 aa  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00260  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  37.31 
 
 
441 aa  280  3e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00264  hypothetical protein  37.31 
 
 
441 aa  280  3e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5175  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.75 
 
 
454 aa  279  6e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.417029  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3183  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.72 
 
 
432 aa  279  7e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1554  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  35.18 
 
 
443 aa  275  1.0000000000000001e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0609  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  38.96 
 
 
441 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0730  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  38.96 
 
 
441 aa  269  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0725774  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0665  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  38.74 
 
 
441 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0615  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  38.74 
 
 
441 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.554301 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0675  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  38.74 
 
 
441 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399771  normal 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C35  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  34.56 
 
 
449 aa  267  4e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2561  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.08 
 
 
464 aa  262  8e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177221  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0242  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  31.41 
 
 
443 aa  261  2e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.235438  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0205  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.93 
 
 
458 aa  258  2e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00131568  normal  0.41875 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0588  type II secretion system protein E  33.55 
 
 
446 aa  251  1e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.57 
 
 
467 aa  249  6e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0248  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase YkgC  33.84 
 
 
446 aa  248  2e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0163606  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.13 
 
 
467 aa  247  3e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0938  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.27 
 
 
471 aa  246  6e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0632  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.6 
 
 
440 aa  246  6.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0617  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.6 
 
 
440 aa  246  6.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.05 
 
 
465 aa  245  9.999999999999999e-64  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0112  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  33.77 
 
 
439 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1982  mercuric reductase  33.4 
 
 
507 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4996  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.9 
 
 
462 aa  243  3.9999999999999997e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3400  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.85 
 
 
470 aa  241  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.131603  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.05 
 
 
476 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2936  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.13 
 
 
468 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2048  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.19 
 
 
474 aa  240  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.47477  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.05 
 
 
476 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.05 
 
 
476 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.26 
 
 
476 aa  239  5e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.69 
 
 
476 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.69 
 
 
476 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.69 
 
 
476 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1496  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.69 
 
 
476 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.7 
 
 
465 aa  239  6.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.84 
 
 
476 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.84 
 
 
476 aa  239  8e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1510  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.84 
 
 
476 aa  239  8e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.647996  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.84 
 
 
476 aa  239  9e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975022  hitchhiker  0.00623097 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2195  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.61 
 
 
469 aa  238  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000774241  hitchhiker  0.00141169 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  35.06 
 
 
704 aa  238  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>