More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6744 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6744  mercuric reductase  100 
 
 
453 aa  915    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.520469  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5831  mercuric reductase  89.62 
 
 
455 aa  830    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194109  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3154  mercuric reductase  63.58 
 
 
459 aa  598  1e-170  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3204  mercuric reductase  63.58 
 
 
459 aa  598  1e-170  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3142  mercuric reductase  63.58 
 
 
459 aa  598  1e-170  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4997  mercuric reductase  62.28 
 
 
459 aa  589  1e-167  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3468  mercuric reductase  61.45 
 
 
457 aa  580  1e-164  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211907  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3059  mercuric reductase  61.45 
 
 
460 aa  579  1e-164  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0658861 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3669  mercuric reductase  61.18 
 
 
459 aa  579  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0385  mercuric reductase  59.91 
 
 
459 aa  566  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3872  mercuric reductase  57.46 
 
 
459 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.429317 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4715  mercuric reductase  57.02 
 
 
459 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3648  mercuric reductase  57.02 
 
 
459 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.948829 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2463  mercuric reductase  57.89 
 
 
459 aa  556  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.736078 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4636  mercuric reductase  60 
 
 
458 aa  556  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.295825 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5056  mercuric reductase  57.02 
 
 
459 aa  551  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135768 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5924  mercuric reductase  58.72 
 
 
461 aa  554  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184883  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5390  mercuric reductase  57.24 
 
 
458 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3551  mercuric reductase  56.8 
 
 
458 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  normal  0.343975 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0840  mercuric reductase  57.89 
 
 
459 aa  551  1e-155  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.909893 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0283  mercuric reductase  56.26 
 
 
590 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02078  mercuric reductase  56.14 
 
 
459 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1652  mercuric reductase  56.04 
 
 
459 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1509  mercuric reductase  56.24 
 
 
461 aa  540  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344309  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2876  mercuric reductase  58.37 
 
 
458 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00432777 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0194  mercuric reductase  56.26 
 
 
459 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5011  mercuric reductase  57.27 
 
 
459 aa  527  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1035  normal  0.205591 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4011  mercuric reductase  54.07 
 
 
459 aa  527  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0854657  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3897  mercuric reductase  54.07 
 
 
459 aa  527  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.423332 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1496  mercuric reductase  50.76 
 
 
466 aa  478  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.32667 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2630  mercuric reductase  49.46 
 
 
466 aa  478  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1496  mercuric reductase  50.43 
 
 
467 aa  472  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  42.61 
 
 
460 aa  376  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2443  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.3 
 
 
469 aa  376  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4961  mercuric reductase  39.78 
 
 
460 aa  368  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  42.73 
 
 
456 aa  349  6e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2206  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.86 
 
 
459 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.041685  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1270  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.41 
 
 
460 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.751643  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1741  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  43.86 
 
 
459 aa  333  5e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1668  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  43.41 
 
 
459 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0297676  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.5 
 
 
459 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0298  hypothetical protein  40.18 
 
 
464 aa  317  4e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0314  hypothetical protein  40.18 
 
 
464 aa  315  7e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1472  mercuric reductase  40.73 
 
 
473 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.505901  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6297  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.07 
 
 
466 aa  310  5e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3460  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.34 
 
 
458 aa  309  5.9999999999999995e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  37.72 
 
 
457 aa  300  5e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00285558  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0984  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.29 
 
 
457 aa  296  4e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.365373  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5092  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.45 
 
 
454 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5184  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.45 
 
 
454 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.0255046 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3183  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.86 
 
 
432 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5175  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.94 
 
 
454 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.417029  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0242  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  34.55 
 
 
443 aa  272  1e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.235438  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  34.39 
 
 
546 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2561  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.42 
 
 
464 aa  267  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177221  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0318  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  36.07 
 
 
441 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0356  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  36.07 
 
 
441 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.488111  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1554  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  34.78 
 
 
443 aa  267  2.9999999999999995e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0336  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  35.64 
 
 
441 aa  266  5e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0356  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  35.85 
 
 
441 aa  266  5e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.800994 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3301  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  35.85 
 
 
441 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3318  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  35.85 
 
 
441 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00260  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  35.64 
 
 
441 aa  264  3e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00264  hypothetical protein  35.64 
 
 
441 aa  264  3e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0615  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  36.6 
 
 
441 aa  260  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.554301 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0665  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  36.6 
 
 
441 aa  260  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0675  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  36.6 
 
 
441 aa  260  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399771  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.85 
 
 
465 aa  259  5.0000000000000005e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0609  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  36.6 
 
 
441 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0176  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.14 
 
 
451 aa  258  1e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0730  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  36.6 
 
 
441 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0725774  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  35.2 
 
 
546 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  34.38 
 
 
475 aa  253  3e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  37.26 
 
 
767 aa  252  9.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  36.92 
 
 
767 aa  252  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1982  mercuric reductase  34.67 
 
 
507 aa  251  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  32.66 
 
 
546 aa  249  6e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  32.66 
 
 
546 aa  249  6e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  36.45 
 
 
745 aa  249  7e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.23 
 
 
473 aa  246  4.9999999999999997e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C35  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  34.85 
 
 
449 aa  246  6e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2549  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.77 
 
 
472 aa  246  8e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0494976  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3488  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.63 
 
 
478 aa  245  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.531012  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1388  mercuric reductase  35.7 
 
 
557 aa  243  7e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000433137  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3049  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.11 
 
 
472 aa  242  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0397378  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.68 
 
 
482 aa  240  4e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0112  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.44 
 
 
439 aa  239  9e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0632  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.69 
 
 
440 aa  238  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0617  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.69 
 
 
440 aa  238  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0205  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.46 
 
 
458 aa  238  2e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00131568  normal  0.41875 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3749  mercuric reductase  34.36 
 
 
510 aa  238  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  32.63 
 
 
548 aa  238  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2351  glutathione reductase  33.18 
 
 
452 aa  237  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150308  normal  0.0125633 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4192  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.33 
 
 
481 aa  236  5.0000000000000005e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0588  type II secretion system protein E  33.33 
 
 
446 aa  236  6e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0473  mercuric reductase  36 
 
 
507 aa  236  7e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000001036 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.17 
 
 
473 aa  236  9e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.06 
 
 
465 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0654  mercuric reductase  32.28 
 
 
468 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.87809e-24 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2512  mercuric reductase MerA  35.88 
 
 
479 aa  234  3e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.442864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>