More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0984 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  96.72 
 
 
457 aa  853    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00285558  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0984  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
457 aa  906    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.365373  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3301  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  51.2 
 
 
441 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0318  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  51.2 
 
 
441 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0336  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  51.42 
 
 
441 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0356  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  51.2 
 
 
441 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.488111  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0356  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  51.42 
 
 
441 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.800994 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3318  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  51.2 
 
 
441 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00260  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  50.98 
 
 
441 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00264  hypothetical protein  50.98 
 
 
441 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0730  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  50.77 
 
 
441 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0725774  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0609  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  50.55 
 
 
441 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0615  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  50.55 
 
 
441 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.554301 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0675  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  50.55 
 
 
441 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399771  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0665  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  50.55 
 
 
441 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1554  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  49.67 
 
 
443 aa  431  1e-120  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0176  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  45.49 
 
 
451 aa  427  1e-118  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C35  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  48.56 
 
 
449 aa  427  1e-118  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2561  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  42.3 
 
 
464 aa  414  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177221  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0632  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.72 
 
 
440 aa  414  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0617  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.72 
 
 
440 aa  414  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0242  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  45.39 
 
 
443 aa  397  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.235438  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0112  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  47.15 
 
 
439 aa  396  1e-109  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0588  type II secretion system protein E  46.72 
 
 
446 aa  393  1e-108  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0248  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase YkgC  46.7 
 
 
446 aa  380  1e-104  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0163606  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0205  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.31 
 
 
458 aa  380  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00131568  normal  0.41875 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0596  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  44.08 
 
 
438 aa  344  2e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.180597  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0298  hypothetical protein  40.49 
 
 
464 aa  339  7e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0441  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.05 
 
 
450 aa  338  9.999999999999999e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0314  hypothetical protein  40.49 
 
 
464 aa  337  1.9999999999999998e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1496  mercuric reductase  39.06 
 
 
467 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  39.83 
 
 
460 aa  335  1e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1270  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.8 
 
 
460 aa  331  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.751643  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6297  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.67 
 
 
466 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1496  mercuric reductase  37.5 
 
 
466 aa  319  7e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.32667 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4636  mercuric reductase  39.91 
 
 
458 aa  318  9e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.295825 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5092  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.93 
 
 
454 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5184  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.93 
 
 
454 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.0255046 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3183  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.02 
 
 
432 aa  310  5e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4961  mercuric reductase  36.36 
 
 
460 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0840  mercuric reductase  37.36 
 
 
459 aa  306  5.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.909893 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2630  mercuric reductase  35.34 
 
 
466 aa  305  7e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3468  mercuric reductase  37.39 
 
 
457 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211907  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0194  mercuric reductase  36.19 
 
 
459 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02078  mercuric reductase  35.61 
 
 
459 aa  302  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5924  mercuric reductase  37.47 
 
 
461 aa  301  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184883  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5175  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.6 
 
 
454 aa  301  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.417029  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0283  mercuric reductase  36.19 
 
 
590 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1652  mercuric reductase  36.19 
 
 
459 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6744  mercuric reductase  37.29 
 
 
453 aa  300  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.520469  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1509  mercuric reductase  35.36 
 
 
461 aa  299  7e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344309  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2463  mercuric reductase  36.27 
 
 
459 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.736078 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5390  mercuric reductase  35.48 
 
 
458 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3551  mercuric reductase  35.48 
 
 
458 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  normal  0.343975 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3897  mercuric reductase  34.98 
 
 
459 aa  297  3e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.423332 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4011  mercuric reductase  34.98 
 
 
459 aa  297  3e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0854657  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3872  mercuric reductase  35.62 
 
 
459 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.429317 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4997  mercuric reductase  37.15 
 
 
459 aa  296  5e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0385  mercuric reductase  35.56 
 
 
459 aa  294  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3154  mercuric reductase  35.91 
 
 
459 aa  293  5e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3142  mercuric reductase  35.91 
 
 
459 aa  293  5e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3204  mercuric reductase  35.91 
 
 
459 aa  293  5e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4715  mercuric reductase  35.41 
 
 
459 aa  293  6e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3648  mercuric reductase  35.41 
 
 
459 aa  293  6e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.948829 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2876  mercuric reductase  35.89 
 
 
458 aa  292  8e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00432777 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3059  mercuric reductase  36.02 
 
 
460 aa  291  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0658861 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5056  mercuric reductase  35.33 
 
 
459 aa  291  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135768 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1472  mercuric reductase  34.19 
 
 
473 aa  288  2e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.505901  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5831  mercuric reductase  37.92 
 
 
455 aa  286  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194109  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.29 
 
 
456 aa  286  7e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3669  mercuric reductase  35.08 
 
 
459 aa  286  7e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5011  mercuric reductase  35.87 
 
 
459 aa  280  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1035  normal  0.205591 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2443  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.04 
 
 
469 aa  271  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.6 
 
 
459 aa  258  1e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  34.95 
 
 
546 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  33.48 
 
 
546 aa  256  5e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  33.7 
 
 
546 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  33.7 
 
 
546 aa  254  3e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2206  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.29 
 
 
459 aa  253  7e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.041685  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.09 
 
 
465 aa  251  2e-65  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1459  lipoamide dehydrogenase  33.55 
 
 
474 aa  250  4e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1524  lipoamide dehydrogenase  33.33 
 
 
474 aa  249  6e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  31.09 
 
 
548 aa  249  7e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.85 
 
 
470 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.27 
 
 
468 aa  248  1e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.85 
 
 
470 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.85 
 
 
470 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.85 
 
 
470 aa  248  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.85 
 
 
470 aa  248  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.85 
 
 
470 aa  248  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.85 
 
 
470 aa  248  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.85 
 
 
470 aa  248  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.85 
 
 
470 aa  248  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.41 
 
 
470 aa  246  8e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.8 
 
 
460 aa  246  9e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.151121  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.85 
 
 
470 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.2 
 
 
468 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1668  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.45 
 
 
459 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0297676  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.61 
 
 
465 aa  243  7e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3964  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.42 
 
 
468 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321391  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>