More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0242 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0242  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  100 
 
 
443 aa  897    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.235438  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0632  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  66.29 
 
 
440 aa  603  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0617  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  66.29 
 
 
440 aa  603  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3301  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  48.52 
 
 
441 aa  429  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0318  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  48.52 
 
 
441 aa  429  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0356  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  48.75 
 
 
441 aa  430  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.488111  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3318  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  48.52 
 
 
441 aa  429  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0356  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  48.75 
 
 
441 aa  430  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.800994 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00260  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  48.52 
 
 
441 aa  427  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00264  hypothetical protein  48.52 
 
 
441 aa  427  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0336  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  48.52 
 
 
441 aa  428  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0730  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  48.75 
 
 
441 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0725774  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0609  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  48.52 
 
 
441 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0675  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  48.52 
 
 
441 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399771  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0615  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  48.52 
 
 
441 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.554301 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0665  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  48.52 
 
 
441 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1554  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  48.31 
 
 
443 aa  412  1e-114  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0112  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  46.47 
 
 
439 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C35  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  45.82 
 
 
449 aa  407  1.0000000000000001e-112  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0176  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  45.72 
 
 
451 aa  402  1e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0596  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  46.92 
 
 
438 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.180597  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  46.49 
 
 
457 aa  388  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00285558  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0984  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.39 
 
 
457 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.365373  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0205  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.88 
 
 
458 aa  359  5e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00131568  normal  0.41875 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2561  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.78 
 
 
464 aa  354  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177221  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0588  type II secretion system protein E  40.62 
 
 
446 aa  327  3e-88  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0248  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase YkgC  41.37 
 
 
446 aa  318  1e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0163606  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0441  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.23 
 
 
450 aa  305  1.0000000000000001e-81  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0298  hypothetical protein  38.67 
 
 
464 aa  295  1e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0314  hypothetical protein  38.44 
 
 
464 aa  293  3e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  36.66 
 
 
460 aa  291  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6744  mercuric reductase  34.55 
 
 
453 aa  272  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.520469  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6297  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.68 
 
 
466 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3059  mercuric reductase  34.55 
 
 
460 aa  270  5e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0658861 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1509  mercuric reductase  31.98 
 
 
461 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344309  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1472  mercuric reductase  33.55 
 
 
473 aa  266  5.999999999999999e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.505901  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5831  mercuric reductase  34.48 
 
 
455 aa  266  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194109  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1496  mercuric reductase  32.33 
 
 
466 aa  265  8e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.32667 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4011  mercuric reductase  32.26 
 
 
459 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0854657  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3897  mercuric reductase  32.26 
 
 
459 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.423332 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4636  mercuric reductase  32.68 
 
 
458 aa  264  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.295825 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0840  mercuric reductase  31.97 
 
 
459 aa  264  3e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.909893 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3551  mercuric reductase  32.04 
 
 
458 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  normal  0.343975 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2630  mercuric reductase  31.69 
 
 
466 aa  263  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5390  mercuric reductase  32.04 
 
 
458 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3468  mercuric reductase  32.83 
 
 
457 aa  261  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211907  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3154  mercuric reductase  33.98 
 
 
459 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3204  mercuric reductase  33.98 
 
 
459 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3142  mercuric reductase  33.98 
 
 
459 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3872  mercuric reductase  30.9 
 
 
459 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.429317 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4997  mercuric reductase  31.21 
 
 
459 aa  261  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1496  mercuric reductase  31.41 
 
 
467 aa  261  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4961  mercuric reductase  33.19 
 
 
460 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1270  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.61 
 
 
460 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.751643  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5924  mercuric reductase  32.26 
 
 
461 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184883  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0385  mercuric reductase  32.47 
 
 
459 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4715  mercuric reductase  30.69 
 
 
459 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3648  mercuric reductase  30.69 
 
 
459 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.948829 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0283  mercuric reductase  32.1 
 
 
590 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02078  mercuric reductase  31.26 
 
 
459 aa  256  4e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0194  mercuric reductase  32.1 
 
 
459 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1652  mercuric reductase  32.1 
 
 
459 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2463  mercuric reductase  31.55 
 
 
459 aa  256  5e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.736078 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5056  mercuric reductase  30.84 
 
 
459 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135768 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.39 
 
 
459 aa  251  1e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2876  mercuric reductase  30.97 
 
 
458 aa  249  5e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00432777 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5175  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.59 
 
 
454 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.417029  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3669  mercuric reductase  30.41 
 
 
459 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5184  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.35 
 
 
454 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.0255046 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5092  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.35 
 
 
454 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3183  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.63 
 
 
432 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2443  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.97 
 
 
469 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5011  mercuric reductase  31.43 
 
 
459 aa  230  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1035  normal  0.205591 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.63 
 
 
456 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  30.4 
 
 
546 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  30.4 
 
 
546 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0473  mercuric reductase  29.5 
 
 
507 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000001036 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  32.3 
 
 
767 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  30.97 
 
 
546 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  30.55 
 
 
546 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2105  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  28.35 
 
 
448 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0584847  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2776  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.28 
 
 
459 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0539747 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3460  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.44 
 
 
458 aa  215  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0242  putative mercuric reductase  29.8 
 
 
467 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02949  putative mercuric reductase  30.33 
 
 
503 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187984  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2585  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.28 
 
 
459 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295349  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2773  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.28 
 
 
459 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2822  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.85 
 
 
459 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0920611  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0457  mercuric reductase  28.76 
 
 
507 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.15 
 
 
465 aa  213  3.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  30.57 
 
 
475 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.85 
 
 
459 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1148  mercuric reductase  30.68 
 
 
457 aa  212  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.68 
 
 
463 aa  212  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2782  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.02 
 
 
459 aa  212  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4311  putative mercuric reductase  31.39 
 
 
551 aa  211  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.98 
 
 
467 aa  211  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2511  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.02 
 
 
459 aa  211  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.136342 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2536  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.07 
 
 
459 aa  211  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2107  putative mercuric reductase  29.96 
 
 
547 aa  211  3e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>