More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0441 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0441  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
450 aa  890    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  46.37 
 
 
457 aa  369  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00285558  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0984  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.05 
 
 
457 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.365373  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C35  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  43.71 
 
 
449 aa  351  2e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1554  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  41.06 
 
 
443 aa  340  4e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0632  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.87 
 
 
440 aa  338  8e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0617  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.87 
 
 
440 aa  338  8e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0176  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.21 
 
 
451 aa  338  9.999999999999999e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0242  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  41.23 
 
 
443 aa  338  1.9999999999999998e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.235438  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0112  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  40.75 
 
 
439 aa  318  1e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2561  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.72 
 
 
464 aa  315  9e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177221  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0730  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  39.12 
 
 
441 aa  312  7.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0725774  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0665  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  39.12 
 
 
441 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0675  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  39.12 
 
 
441 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399771  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0615  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  39.12 
 
 
441 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.554301 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0609  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  39.12 
 
 
441 aa  310  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0336  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  38.82 
 
 
441 aa  306  6e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0318  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  38.82 
 
 
441 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0356  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  38.24 
 
 
441 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.488111  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0356  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  38.24 
 
 
441 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.800994 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3301  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  38.02 
 
 
441 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3318  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  38.02 
 
 
441 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00260  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  38.02 
 
 
441 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00264  hypothetical protein  38.02 
 
 
441 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0588  type II secretion system protein E  38.82 
 
 
446 aa  296  4e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0596  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  39.87 
 
 
438 aa  296  5e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.180597  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0248  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase YkgC  40.04 
 
 
446 aa  294  3e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0163606  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0205  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.23 
 
 
458 aa  273  6e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00131568  normal  0.41875 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0298  hypothetical protein  35.36 
 
 
464 aa  267  2e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0314  hypothetical protein  35.6 
 
 
464 aa  265  1e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.51 
 
 
459 aa  260  4e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  33.48 
 
 
460 aa  258  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4961  mercuric reductase  31.88 
 
 
460 aa  253  7e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1270  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.44 
 
 
460 aa  251  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.751643  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.89 
 
 
585 aa  249  9e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2876  mercuric reductase  31.13 
 
 
458 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00432777 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3669  mercuric reductase  30.92 
 
 
459 aa  245  9e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.61 
 
 
463 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1496  mercuric reductase  32.53 
 
 
467 aa  243  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6744  mercuric reductase  33.7 
 
 
453 aa  243  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.520469  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5924  mercuric reductase  32.89 
 
 
461 aa  242  9e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184883  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4997  mercuric reductase  31.78 
 
 
459 aa  242  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.99 
 
 
467 aa  241  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1496  mercuric reductase  31.87 
 
 
466 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.32667 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4636  mercuric reductase  30.96 
 
 
458 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.295825 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1472  mercuric reductase  32.54 
 
 
473 aa  240  4e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.505901  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0840  mercuric reductase  31.43 
 
 
459 aa  240  4e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.909893 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.48 
 
 
467 aa  240  5e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1543  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.55 
 
 
470 aa  236  7e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.593732  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2443  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.53 
 
 
469 aa  236  7e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.46 
 
 
465 aa  236  8e-61  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2542  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.22 
 
 
474 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.167426  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0938  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.97 
 
 
471 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6297  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.09 
 
 
466 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1982  mercuric reductase  34 
 
 
507 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1118  mercuric reductase  32.16 
 
 
516 aa  233  4.0000000000000004e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.583122  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2936  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.47 
 
 
468 aa  233  5e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1509  mercuric reductase  30.84 
 
 
461 aa  233  6e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344309  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5390  mercuric reductase  29.58 
 
 
458 aa  233  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.92 
 
 
468 aa  233  7.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3551  mercuric reductase  29.58 
 
 
458 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  normal  0.343975 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2630  mercuric reductase  30.33 
 
 
466 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.59 
 
 
712 aa  232  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  31.71 
 
 
767 aa  231  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0271  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.74 
 
 
593 aa  230  3e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.146735  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.09 
 
 
467 aa  230  4e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3964  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.97 
 
 
468 aa  230  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321391  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02078  mercuric reductase  29.76 
 
 
459 aa  229  6e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.02 
 
 
581 aa  229  6e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.04 
 
 
473 aa  229  7e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.97 
 
 
468 aa  229  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3897  mercuric reductase  29.76 
 
 
459 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.423332 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3059  mercuric reductase  30.84 
 
 
460 aa  229  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0658861 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5831  mercuric reductase  33.41 
 
 
455 aa  229  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194109  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3872  mercuric reductase  29.14 
 
 
459 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.429317 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4011  mercuric reductase  29.76 
 
 
459 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0854657  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3648  mercuric reductase  29.14 
 
 
459 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.948829 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3204  mercuric reductase  30.97 
 
 
459 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3154  mercuric reductase  30.97 
 
 
459 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4715  mercuric reductase  29.14 
 
 
459 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3142  mercuric reductase  30.97 
 
 
459 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.5 
 
 
465 aa  227  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4116  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.62 
 
 
468 aa  226  5.0000000000000005e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.608117  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0385  mercuric reductase  29.14 
 
 
459 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3749  mercuric reductase  31.58 
 
 
510 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4192  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.48 
 
 
481 aa  226  6e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0027  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.74 
 
 
468 aa  226  7e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03103  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.26 
 
 
607 aa  226  9e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5056  mercuric reductase  29.14 
 
 
459 aa  225  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135768 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0194  mercuric reductase  29.58 
 
 
459 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.01 
 
 
463 aa  224  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  33.26 
 
 
546 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2463  mercuric reductase  29.14 
 
 
459 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.736078 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0283  mercuric reductase  29.58 
 
 
590 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1978  hypothetical protein  32.6 
 
 
462 aa  224  3e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5175  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.61 
 
 
454 aa  223  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.417029  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  31.77 
 
 
704 aa  223  4e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.17 
 
 
467 aa  223  4e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5092  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.19 
 
 
454 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.17 
 
 
467 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>