More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0264 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011773  BCAH820_4183  dihydrolipoamide dehydrogenase  76.91 
 
 
473 aa  740    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000040405 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4235  dihydrolipoamide dehydrogenase  76.69 
 
 
473 aa  739    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4068  dihydrolipoamide dehydrogenase  76.91 
 
 
473 aa  740    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3906  dihydrolipoamide dehydrogenase  76.91 
 
 
473 aa  740    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3915  dihydrolipoamide dehydrogenase  76.91 
 
 
473 aa  740    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.616169  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  76.27 
 
 
473 aa  740    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0961  dihydrolipoamide dehydrogenase  76.27 
 
 
473 aa  737    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4385  dihydrolipoamide dehydrogenase  76.91 
 
 
473 aa  740    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2306  dihydrolipoamide dehydrogenase  87.1 
 
 
473 aa  839    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4273  dihydrolipoamide dehydrogenase  76.48 
 
 
473 aa  738    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4293  dihydrolipoamide dehydrogenase  76.91 
 
 
473 aa  740    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00988319  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4004  dihydrolipoamide dehydrogenase  76.27 
 
 
473 aa  738    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
473 aa  955    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2549  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.06 
 
 
471 aa  462  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1079  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  47.26 
 
 
473 aa  454  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1577  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.95 
 
 
473 aa  451  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1610  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.95 
 
 
473 aa  451  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.184243  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.63 
 
 
465 aa  438  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.95 
 
 
470 aa  412  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_002978  WD0325  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  44.66 
 
 
457 aa  400  9.999999999999999e-111  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.01 
 
 
474 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.34 
 
 
468 aa  399  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.57 
 
 
465 aa  401  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.65 
 
 
462 aa  400  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.37 
 
 
465 aa  398  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  44.84 
 
 
464 aa  397  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.44 
 
 
462 aa  394  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1614  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.61 
 
 
464 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0956162 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1878  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.19 
 
 
466 aa  392  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.932595  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.03 
 
 
464 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0478321  normal  0.511647 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.92 
 
 
471 aa  392  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2968  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.4 
 
 
468 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462781  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.74 
 
 
465 aa  391  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.12 
 
 
468 aa  388  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.12 
 
 
465 aa  386  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2063  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.06 
 
 
487 aa  385  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0611  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.67 
 
 
463 aa  388  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512717  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06120  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.42 
 
 
464 aa  384  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140424  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1126  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.97 
 
 
487 aa  384  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.21 
 
 
466 aa  385  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  44 
 
 
465 aa  382  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.4 
 
 
470 aa  382  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.605056  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.8 
 
 
469 aa  382  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.850345  decreased coverage  0.00227015 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.97 
 
 
539 aa  384  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2766  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.55 
 
 
473 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3815  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.03 
 
 
468 aa  381  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3205  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.32 
 
 
473 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169727  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1801  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.85 
 
 
482 aa  382  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  decreased coverage  0.000698264 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1608  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.38 
 
 
481 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392675  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.78 
 
 
458 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4676  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.4 
 
 
462 aa  378  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2807  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.95 
 
 
473 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1270  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.87 
 
 
459 aa  376  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211526  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1811  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.95 
 
 
465 aa  375  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.352769 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5367  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.05 
 
 
467 aa  373  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.36 
 
 
476 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1508  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.97 
 
 
480 aa  375  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.468663 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2823  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.3 
 
 
465 aa  375  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.13 
 
 
481 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.33 
 
 
468 aa  375  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.86 
 
 
471 aa  369  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0794  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.92 
 
 
464 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0822036  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2913  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.83 
 
 
479 aa  371  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00695223  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1813  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.68 
 
 
477 aa  369  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0853723  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0522  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.04 
 
 
480 aa  369  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4651  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.36 
 
 
476 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183592  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.57 
 
 
476 aa  371  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.41 
 
 
479 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0279881  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.19 
 
 
472 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1096  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.49 
 
 
464 aa  369  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.74 
 
 
476 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.15 
 
 
476 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1510  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.74 
 
 
476 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.647996  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5901  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.16 
 
 
478 aa  366  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.01 
 
 
473 aa  368  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1081  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.15 
 
 
481 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378558  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.27 
 
 
476 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.95 
 
 
476 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975022  hitchhiker  0.00623097 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.36 
 
 
476 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3018  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.79 
 
 
479 aa  366  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.340958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1830  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.64 
 
 
466 aa  365  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.89 
 
 
465 aa  368  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.27 
 
 
476 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.77 
 
 
486 aa  366  1e-100  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.206341  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2790  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.79 
 
 
479 aa  367  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1432  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.74 
 
 
476 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21637  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6148  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.23 
 
 
461 aa  364  1e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268459  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.65 
 
 
476 aa  365  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.06 
 
 
476 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.06 
 
 
476 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.97 
 
 
459 aa  363  3e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.341599  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.06 
 
 
476 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1496  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.06 
 
 
476 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  42.83 
 
 
468 aa  363  3e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1720  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.81 
 
 
465 aa  363  4e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.160596  normal  0.364813 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.26 
 
 
467 aa  363  5.0000000000000005e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.51 
 
 
459 aa  363  5.0000000000000005e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1626  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.72 
 
 
487 aa  362  6e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.139185  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1719  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.65 
 
 
476 aa  362  6e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6519  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.21 
 
 
478 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>