More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2992 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
459 aa  923    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4961  mercuric reductase  37.17 
 
 
460 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3468  mercuric reductase  40.44 
 
 
457 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211907  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6744  mercuric reductase  37.5 
 
 
453 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.520469  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1509  mercuric reductase  39.43 
 
 
461 aa  327  4.0000000000000003e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344309  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3059  mercuric reductase  39.96 
 
 
460 aa  326  6e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0658861 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5831  mercuric reductase  37.64 
 
 
455 aa  324  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194109  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3154  mercuric reductase  38.2 
 
 
459 aa  323  4e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3142  mercuric reductase  38.2 
 
 
459 aa  323  4e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3204  mercuric reductase  38.2 
 
 
459 aa  323  4e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3551  mercuric reductase  38.27 
 
 
458 aa  322  7e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  normal  0.343975 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5056  mercuric reductase  38.46 
 
 
459 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135768 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2463  mercuric reductase  37.44 
 
 
459 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.736078 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5390  mercuric reductase  38.27 
 
 
458 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3872  mercuric reductase  37.39 
 
 
459 aa  319  5e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.429317 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.15 
 
 
456 aa  319  7e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3648  mercuric reductase  37.39 
 
 
459 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.948829 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4715  mercuric reductase  37.39 
 
 
459 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02078  mercuric reductase  37.78 
 
 
459 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1652  mercuric reductase  37.36 
 
 
459 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0283  mercuric reductase  37.36 
 
 
590 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0194  mercuric reductase  37.36 
 
 
459 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  35.7 
 
 
460 aa  311  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2206  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.09 
 
 
459 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.041685  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4636  mercuric reductase  36.06 
 
 
458 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.295825 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4011  mercuric reductase  37.44 
 
 
459 aa  306  3e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0854657  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3897  mercuric reductase  37.44 
 
 
459 aa  306  3e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.423332 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0385  mercuric reductase  36.32 
 
 
459 aa  307  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4997  mercuric reductase  35.86 
 
 
459 aa  305  1.0000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1668  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.2 
 
 
459 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0297676  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0840  mercuric reductase  35.86 
 
 
459 aa  305  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.909893 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3669  mercuric reductase  37.17 
 
 
459 aa  299  9e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5924  mercuric reductase  35.19 
 
 
461 aa  298  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184883  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5011  mercuric reductase  36.78 
 
 
459 aa  298  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1035  normal  0.205591 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1741  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.31 
 
 
459 aa  296  4e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1496  mercuric reductase  33.91 
 
 
467 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0314  hypothetical protein  36.96 
 
 
464 aa  291  2e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0298  hypothetical protein  36.96 
 
 
464 aa  291  2e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1978  hypothetical protein  35.78 
 
 
462 aa  285  2.0000000000000002e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  36.81 
 
 
546 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1439  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.61 
 
 
469 aa  281  1e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.69 
 
 
465 aa  281  2e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1451  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.7 
 
 
466 aa  280  3e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1496  mercuric reductase  33.84 
 
 
466 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.32667 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.11 
 
 
492 aa  280  4e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.52 
 
 
467 aa  280  5e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4269  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.42 
 
 
462 aa  279  8e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.170998  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1132  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.28 
 
 
464 aa  277  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2630  mercuric reductase  32.97 
 
 
466 aa  276  5e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  37.64 
 
 
767 aa  276  5e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  35.48 
 
 
546 aa  276  6e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0325  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  34.66 
 
 
457 aa  275  1.0000000000000001e-72  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.85 
 
 
458 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.54 
 
 
562 aa  275  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0142  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.87 
 
 
475 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.262371  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  36.54 
 
 
475 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.69 
 
 
474 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  35.22 
 
 
704 aa  274  3e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.56 
 
 
463 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0992  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.49 
 
 
468 aa  273  5.000000000000001e-72  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2549  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.93 
 
 
471 aa  272  9e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  38.27 
 
 
745 aa  271  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2347  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.43 
 
 
475 aa  272  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1665  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.5 
 
 
491 aa  271  1e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.771016  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.42 
 
 
468 aa  271  1e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.99 
 
 
470 aa  271  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  37.64 
 
 
767 aa  271  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4996  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.99 
 
 
462 aa  271  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.93 
 
 
585 aa  271  2.9999999999999997e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1270  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.71 
 
 
460 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.751643  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.07 
 
 
473 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4074  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.2 
 
 
461 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000295431  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  33.55 
 
 
546 aa  270  4e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1045  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.84 
 
 
469 aa  270  4e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  33.85 
 
 
546 aa  270  5e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2738  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  37.14 
 
 
488 aa  270  5.9999999999999995e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.91 
 
 
464 aa  269  7e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0745  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.92 
 
 
461 aa  269  7e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2607  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.54 
 
 
474 aa  269  8e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00261038 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.93 
 
 
581 aa  268  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4183  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.04 
 
 
473 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000040405 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4068  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.04 
 
 
473 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3906  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.04 
 
 
473 aa  268  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3915  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.04 
 
 
473 aa  268  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.616169  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4293  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.04 
 
 
473 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00988319  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2876  mercuric reductase  33.41 
 
 
458 aa  268  1e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00432777 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4385  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.04 
 
 
473 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.36 
 
 
473 aa  268  1e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.737232  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4273  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.04 
 
 
473 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0551  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.32 
 
 
464 aa  267  2.9999999999999995e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4235  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.04 
 
 
473 aa  267  4e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0522  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.12 
 
 
480 aa  266  4e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0961  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.83 
 
 
473 aa  266  5e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1797  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.67 
 
 
474 aa  266  5.999999999999999e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.82 
 
 
465 aa  266  5.999999999999999e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.18 
 
 
465 aa  265  8.999999999999999e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4192  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.23 
 
 
481 aa  265  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1878  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.43 
 
 
466 aa  265  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.932595  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1805  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.95 
 
 
616 aa  264  2e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.29 
 
 
466 aa  265  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>