More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4513 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
465 aa  937    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.63 
 
 
470 aa  540  9.999999999999999e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.99 
 
 
471 aa  528  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0884852  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.48 
 
 
471 aa  523  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.07 
 
 
466 aa  430  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.81 
 
 
465 aa  423  1e-117  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.8 
 
 
465 aa  421  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.88 
 
 
462 aa  419  1e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.97 
 
 
468 aa  416  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.93 
 
 
465 aa  412  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.62 
 
 
471 aa  414  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.15 
 
 
468 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.54 
 
 
465 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.57 
 
 
465 aa  404  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.53 
 
 
465 aa  398  9.999999999999999e-111  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2549  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.71 
 
 
471 aa  400  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.98 
 
 
465 aa  395  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.06 
 
 
474 aa  396  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.14 
 
 
469 aa  395  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.37 
 
 
473 aa  398  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  46.44 
 
 
464 aa  396  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.57 
 
 
462 aa  395  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4676  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.57 
 
 
462 aa  395  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.22 
 
 
468 aa  388  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.63 
 
 
467 aa  385  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.87 
 
 
468 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0027  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.3 
 
 
468 aa  387  1e-106  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.2 
 
 
470 aa  385  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.605056  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.4 
 
 
467 aa  385  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0183  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.3 
 
 
467 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.4 
 
 
467 aa  385  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  44.28 
 
 
468 aa  388  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.42 
 
 
467 aa  383  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4116  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.18 
 
 
468 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.608117  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.4 
 
 
467 aa  384  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2936  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.18 
 
 
468 aa  385  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5416  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.85 
 
 
466 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.813696  normal  0.542415 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0435  hypothetical protein  47.3 
 
 
478 aa  383  1e-105  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0273668 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3360  dihydrolipoyl dehydrogenanse  45.28 
 
 
466 aa  384  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0306833 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1104  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.44 
 
 
466 aa  382  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550844  normal  0.0253682 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4293  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.8 
 
 
473 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00988319  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5366  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.85 
 
 
466 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.997164 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4235  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.8 
 
 
473 aa  379  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4068  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.8 
 
 
473 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2306  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.28 
 
 
473 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3906  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.8 
 
 
473 aa  380  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3915  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.8 
 
 
473 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.616169  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4273  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.8 
 
 
473 aa  379  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4183  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.8 
 
 
473 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000040405 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.47 
 
 
473 aa  380  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4385  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.8 
 
 
473 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5274  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.85 
 
 
466 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409893  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.44 
 
 
467 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.23 
 
 
467 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.12 
 
 
464 aa  380  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5145  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.41 
 
 
466 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.671755  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0938  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.24 
 
 
471 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0961  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.8 
 
 
473 aa  378  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3400  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.15 
 
 
470 aa  379  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.131603  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4004  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.8 
 
 
473 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.02 
 
 
467 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3710  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.87 
 
 
467 aa  379  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.61 
 
 
459 aa  377  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.341599  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3815  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.23 
 
 
468 aa  375  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1132  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.04 
 
 
464 aa  377  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.02 
 
 
479 aa  376  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0279881  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.06 
 
 
466 aa  378  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0794  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.67 
 
 
464 aa  375  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0822036  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0522  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.78 
 
 
480 aa  375  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.74 
 
 
480 aa  377  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1667  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.31 
 
 
478 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164593  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2501  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.89 
 
 
478 aa  375  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3964  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.23 
 
 
468 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321391  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2133  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.32 
 
 
467 aa  376  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.191316  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1270  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.16 
 
 
459 aa  375  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211526  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0551  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.28 
 
 
464 aa  377  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4187  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.31 
 
 
478 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2201  2-oxoglutarate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  42.58 
 
 
478 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00788973  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2913  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.14 
 
 
479 aa  374  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00695223  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.16 
 
 
467 aa  375  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.11 
 
 
467 aa  373  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.3 
 
 
458 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1508  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.8 
 
 
480 aa  372  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.468663 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.44 
 
 
476 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1532  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.68 
 
 
460 aa  374  1e-102  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.631051 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0159  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.2 
 
 
467 aa  372  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659898  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.44 
 
 
476 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1510  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.44 
 
 
476 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.647996  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.32 
 
 
470 aa  370  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2011  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.16 
 
 
478 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3018  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.71 
 
 
479 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.340958 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06120  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.47 
 
 
464 aa  369  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140424  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1878  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.93 
 
 
466 aa  369  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.932595  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.8 
 
 
476 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11020  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.1 
 
 
465 aa  369  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.874516 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.83 
 
 
463 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.01 
 
 
476 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0180  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.38 
 
 
467 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3510  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.89 
 
 
478 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0716172  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.23 
 
 
476 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975022  hitchhiker  0.00623097 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>