More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2306 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_4235  dihydrolipoamide dehydrogenase  80.93 
 
 		 473 aa  773    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4068  dihydrolipoamide dehydrogenase  81.14 
 
 		 473 aa  774    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3906  dihydrolipoamide dehydrogenase  81.14 
 
 		 473 aa  774    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3915  dihydrolipoamide dehydrogenase  81.14 
 
 		 473 aa  774    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.616169  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  87.1 
 
 		 473 aa  861    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2306  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 473 aa  959    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4385  dihydrolipoamide dehydrogenase  81.14 
 
 		 473 aa  774    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  80.51 
 
 		 473 aa  770    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4293  dihydrolipoamide dehydrogenase  81.14 
 
 		 473 aa  774    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00988319  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0961  dihydrolipoamide dehydrogenase  80.51 
 
 		 473 aa  771    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4183  dihydrolipoamide dehydrogenase  81.14 
 
 		 473 aa  774    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000040405 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4273  dihydrolipoamide dehydrogenase  80.72 
 
 		 473 aa  772    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4004  dihydrolipoamide dehydrogenase  80.08 
 
 		 473 aa  768    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2549  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.31 
 
 		 471 aa  483  1e-135  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1079  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  48.95 
 
 		 473 aa  461  1e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1610  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.63 
 
 		 473 aa  456  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.184243  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1577  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.63 
 
 		 473 aa  456  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.84 
 
 		 465 aa  440  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.21 
 
 		 470 aa  426  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.44 
 
 		 474 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.99 
 
 		 465 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.28 
 
 		 462 aa  408  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.13 
 
 		 462 aa  406  1.0000000000000001e-112  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0325  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  45.73 
 
 		 457 aa  408  1.0000000000000001e-112  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.97 
 
 		 471 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  46.11 
 
 		 464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.24 
 
 		 464 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0478321  normal  0.511647 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.34 
 
 		 468 aa  404  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.28 
 
 		 465 aa  399  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1614  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.61 
 
 		 464 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0956162 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2968  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.82 
 
 		 468 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462781  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1878  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.61 
 
 		 466 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.932595  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.81 
 
 		 465 aa  399  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.38 
 
 		 468 aa  399  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.22 
 
 		 465 aa  398  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.05 
 
 		 466 aa  395  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.92 
 
 		 469 aa  397  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.850345  decreased coverage  0.00227015 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.74 
 
 		 465 aa  395  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0611  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.09 
 
 		 463 aa  390  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512717  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1096  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.34 
 
 		 464 aa  385  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1811  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.95 
 
 		 465 aa  382  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.352769 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1508  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.02 
 
 		 480 aa  385  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.468663 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.17 
 
 		 468 aa  383  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2766  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.43 
 
 		 473 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.32 
 
 		 470 aa  384  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.605056  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4676  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.4 
 
 		 462 aa  384  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2807  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.25 
 
 		 473 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06120  dihydrolipoamide dehydrogenase  44 
 
 		 464 aa  384  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.51 
 
 		 467 aa  383  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.47 
 
 		 465 aa  382  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1801  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.65 
 
 		 482 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  decreased coverage  0.000698264 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3205  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.83 
 
 		 473 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169727  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1126  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.76 
 
 		 487 aa  380  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2063  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.41 
 
 		 487 aa  381  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2823  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.4 
 
 		 465 aa  380  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1608  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.4 
 
 		 481 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0522  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.07 
 
 		 480 aa  379  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.76 
 
 		 539 aa  379  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.66 
 
 		 479 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0279881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.68 
 
 		 458 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1270  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.2 
 
 		 459 aa  382  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211526  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2913  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.66 
 
 		 479 aa  381  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00695223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0794  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.92 
 
 		 464 aa  376  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0822036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1813  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.48 
 
 		 477 aa  378  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0853723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5901  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.2 
 
 		 478 aa  378  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.89 
 
 		 467 aa  375  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1720  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.62 
 
 		 465 aa  375  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.160596  normal  0.364813 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6519  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.25 
 
 		 478 aa  373  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.95 
 
 		 473 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1830  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.55 
 
 		 466 aa  372  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2645  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  44.87 
 
 		 459 aa  375  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0617764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.03 
 
 		 467 aa  374  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.3 
 
 		 471 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2790  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.83 
 
 		 479 aa  373  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3815  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.72 
 
 		 468 aa  375  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.24 
 
 		 467 aa  375  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.12 
 
 		 476 aa  371  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3018  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.62 
 
 		 479 aa  371  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.340958 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.12 
 
 		 476 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.64 
 
 		 459 aa  372  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.32 
 
 		 476 aa  371  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.82 
 
 		 476 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.92 
 
 		 481 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1626  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.35 
 
 		 487 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.139185  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.95 
 
 		 463 aa  370  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0435  hypothetical protein  44.61 
 
 		 478 aa  367  1e-100  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0273668 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.3 
 
 		 486 aa  368  1e-100  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.206341  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.03 
 
 		 476 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4651  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.91 
 
 		 476 aa  368  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183592  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1719  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.41 
 
 		 476 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.03 
 
 		 476 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0992  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.42 
 
 		 468 aa  368  1e-100  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.16 
 
 		 472 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5367  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.25 
 
 		 467 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.91 
 
 		 476 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1081  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.36 
 
 		 481 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1432  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.49 
 
 		 476 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21637  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.4 
 
 		 459 aa  364  1e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.341599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.82 
 
 		 476 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.82 
 
 		 476 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>