More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2968 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.67 
 
 		 465 aa  637    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1614  dihydrolipoamide dehydrogenase  99.35 
 
 		 464 aa  931    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0956162 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  92.67 
 
 		 464 aa  880    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0478321  normal  0.511647 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1811  dihydrolipoamide dehydrogenase  80.65 
 
 		 465 aa  771    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.352769 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2968  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 468 aa  942    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462781  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1720  dihydrolipoamide dehydrogenase  81.51 
 
 		 465 aa  781    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.160596  normal  0.364813 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1096  dihydrolipoamide dehydrogenase  81.68 
 
 		 464 aa  786    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0611  dihydrolipoamide dehydrogenase  85.06 
 
 		 463 aa  820    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512717  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1878  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.88 
 
 		 466 aa  630  1e-179  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.932595  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2823  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.17 
 
 		 465 aa  623  1e-177  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.16 
 
 		 465 aa  615  1e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.09 
 
 		 465 aa  617  1e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3205  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.69 
 
 		 473 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169727  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1425  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.38 
 
 		 466 aa  614  9.999999999999999e-175  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.197772  hitchhiker  0.000000283985 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2766  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.98 
 
 		 473 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.52 
 
 		 470 aa  610  1e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.605056  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1813  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.68 
 
 		 477 aa  601  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0853723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.06 
 
 		 472 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2807  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.42 
 
 		 473 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.58 
 
 		 473 aa  598  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.18 
 
 		 469 aa  600  1e-170  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.850345  decreased coverage  0.00227015 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.8 
 
 		 465 aa  599  1e-170  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0522  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.13 
 
 		 480 aa  595  1e-169  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5901  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.55 
 
 		 478 aa  593  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6519  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.92 
 
 		 478 aa  590  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1508  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.17 
 
 		 480 aa  591  1e-167  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.468663 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.8 
 
 		 479 aa  589  1e-167  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0279881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3018  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.59 
 
 		 479 aa  587  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.340958 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2913  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.59 
 
 		 479 aa  585  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00695223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2790  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.59 
 
 		 479 aa  587  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.26 
 
 		 477 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2063  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.41 
 
 		 487 aa  578  1e-164  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1126  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.24 
 
 		 487 aa  576  1.0000000000000001e-163  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.49 
 
 		 539 aa  577  1.0000000000000001e-163  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3894  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.97 
 
 		 471 aa  576  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287099 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1626  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.62 
 
 		 487 aa  567  1e-160  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.139185  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1608  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.92 
 
 		 481 aa  559  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1081  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.71 
 
 		 481 aa  557  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1801  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.58 
 
 		 482 aa  558  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  decreased coverage  0.000698264 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.47 
 
 		 486 aa  554  1e-156  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.206341  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.66 
 
 		 481 aa  550  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2755  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.94 
 
 		 466 aa  519  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0982206  hitchhiker  0.000532855 
 
 
-
 
NC_002978  WD0325  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  53.74 
 
 		 457 aa  512  1e-144  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.72 
 
 		 465 aa  483  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.63 
 
 		 462 aa  479  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.96 
 
 		 465 aa  480  1e-134  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.79 
 
 		 474 aa  479  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2779  dihydrolipoamide dehydrogenase E3 component of 3 enzyme complexes  49.22 
 
 		 463 aa  474  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.285583  normal  0.562583 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.39 
 
 		 468 aa  474  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.86 
 
 		 468 aa  470  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.58 
 
 		 462 aa  469  1.0000000000000001e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  52.17 
 
 		 464 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0992  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.97 
 
 		 468 aa  467  9.999999999999999e-131  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.68 
 
 		 466 aa  467  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4676  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.98 
 
 		 462 aa  463  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0138  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.73 
 
 		 491 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.66 
 
 		 470 aa  418  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0435  hypothetical protein  47.29 
 
 		 478 aa  418  9.999999999999999e-116  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0273668 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0853  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.6 
 
 		 465 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50611  normal  0.0780472 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2712  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.29 
 
 		 465 aa  404  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.822199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.77 
 
 		 471 aa  403  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.76 
 
 		 471 aa  389  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0884852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.4 
 
 		 473 aa  391  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1797  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.82 
 
 		 474 aa  382  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0463  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.52 
 
 		 457 aa  385  1e-105  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2306  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.82 
 
 		 473 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2549  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.04 
 
 		 471 aa  379  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0794  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.36 
 
 		 464 aa  375  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0822036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1689  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.75 
 
 		 462 aa  375  1e-103  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.08159 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.59 
 
 		 467 aa  375  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1045  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.66 
 
 		 469 aa  374  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06120  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.01 
 
 		 464 aa  373  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3518  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.14 
 
 		 464 aa  372  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120374  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0784  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.16 
 
 		 472 aa  366  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0507  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.92 
 
 		 464 aa  365  1e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0624  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.87 
 
 		 466 aa  363  4e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  0.337004 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0644  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.87 
 
 		 466 aa  363  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0631  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.87 
 
 		 466 aa  363  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0991753  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6148  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.04 
 
 		 461 aa  361  1e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268459  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.48 
 
 		 465 aa  361  2e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4273  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.16 
 
 		 473 aa  360  3e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0961  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.16 
 
 		 473 aa  360  3e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11020  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.29 
 
 		 465 aa  360  4e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.874516 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4068  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.95 
 
 		 473 aa  359  5e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3906  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.95 
 
 		 473 aa  359  5e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3915  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.95 
 
 		 473 aa  359  5e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.616169  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4293  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.95 
 
 		 473 aa  359  5e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00988319  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4385  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.95 
 
 		 473 aa  359  5e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4183  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.95 
 
 		 473 aa  359  5e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000040405 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4004  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.95 
 
 		 473 aa  359  6e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4235  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.95 
 
 		 473 aa  359  7e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.38 
 
 		 471 aa  358  9.999999999999999e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0114  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.64 
 
 		 467 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0247817 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5475  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.55 
 
 		 466 aa  358  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67474  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5367  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.18 
 
 		 467 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1439  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.89 
 
 		 469 aa  356  5.999999999999999e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.1 
 
 		 473 aa  355  1e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.51 
 
 		 460 aa  353  2.9999999999999997e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.151121  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3815  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.37 
 
 		 468 aa  353  5e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4996  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.99 
 
 		 462 aa  352  5.9999999999999994e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>