More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2790 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  76 
 
 		 473 aa  754    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3205  dihydrolipoamide dehydrogenase  76.41 
 
 		 473 aa  757    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169727  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1608  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.96 
 
 		 481 aa  701    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6519  dihydrolipoamide dehydrogenase  86.61 
 
 		 478 aa  858    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1126  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.99 
 
 		 487 aa  713    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  90.19 
 
 		 479 aa  895    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0279881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1508  dihydrolipoamide dehydrogenase  78.56 
 
 		 480 aa  780    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.468663 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.14 
 
 		 481 aa  689    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2913  dihydrolipoamide dehydrogenase  94.99 
 
 		 479 aa  932    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00695223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1801  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.61 
 
 		 482 aa  690    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  decreased coverage  0.000698264 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1813  dihydrolipoamide dehydrogenase  73.86 
 
 		 477 aa  738    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0853723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5901  dihydrolipoamide dehydrogenase  85.98 
 
 		 478 aa  850    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0522  dihydrolipoamide dehydrogenase  73.87 
 
 		 480 aa  730    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3018  dihydrolipoamide dehydrogenase  99.37 
 
 		 479 aa  963    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.340958 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1081  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.78 
 
 		 481 aa  699    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2766  dihydrolipoamide dehydrogenase  74.95 
 
 		 473 aa  752    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3894  dihydrolipoamide dehydrogenase  78.08 
 
 		 471 aa  754    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287099 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  75.57 
 
 		 472 aa  745    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2807  dihydrolipoamide dehydrogenase  77.04 
 
 		 473 aa  757    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  75.91 
 
 		 477 aa  726    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.99 
 
 		 539 aa  712    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2063  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.4 
 
 		 487 aa  719    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1626  dihydrolipoamide dehydrogenase  74.07 
 
 		 487 aa  731    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.139185  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2790  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 479 aa  967    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.49 
 
 		 486 aa  675    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.206341  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1425  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.97 
 
 		 466 aa  633  1e-180  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.197772  hitchhiker  0.000000283985 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0611  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.97 
 
 		 463 aa  606  9.999999999999999e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512717  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2823  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.8 
 
 		 465 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1096  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.53 
 
 		 464 aa  599  1e-170  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1878  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.95 
 
 		 466 aa  595  1e-169  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.932595  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1720  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.51 
 
 		 465 aa  594  1e-169  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.160596  normal  0.364813 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.84 
 
 		 464 aa  593  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0478321  normal  0.511647 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.24 
 
 		 465 aa  592  1e-168  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1811  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.46 
 
 		 465 aa  589  1e-167  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.352769 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2968  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.59 
 
 		 468 aa  587  1e-166  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462781  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1614  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.59 
 
 		 464 aa  586  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0956162 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.96 
 
 		 465 aa  580  1e-164  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.54 
 
 		 469 aa  573  1.0000000000000001e-162  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.850345  decreased coverage  0.00227015 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.71 
 
 		 470 aa  570  1e-161  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.605056  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.58 
 
 		 465 aa  562  1.0000000000000001e-159  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.29 
 
 		 465 aa  558  1e-158  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2755  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.25 
 
 		 466 aa  521  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0982206  hitchhiker  0.000532855 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.88 
 
 		 465 aa  489  1e-137  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.79 
 
 		 466 aa  479  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.72 
 
 		 468 aa  479  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.15 
 
 		 465 aa  480  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4676  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.42 
 
 		 462 aa  476  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.16 
 
 		 474 aa  476  1e-133  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.79 
 
 		 462 aa  477  1e-133  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0325  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  51.69 
 
 		 457 aa  474  1e-132  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.16 
 
 		 462 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  50.63 
 
 		 464 aa  468  9.999999999999999e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2779  dihydrolipoamide dehydrogenase E3 component of 3 enzyme complexes  48.21 
 
 		 463 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.285583  normal  0.562583 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0992  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.9 
 
 		 468 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.06 
 
 		 468 aa  448  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0138  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.63 
 
 		 491 aa  441  9.999999999999999e-123  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0853  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.76 
 
 		 465 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50611  normal  0.0780472 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0435  hypothetical protein  47.91 
 
 		 478 aa  429  1e-119  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0273668 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.4 
 
 		 470 aa  415  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2712  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.19 
 
 		 465 aa  406  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.822199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.21 
 
 		 471 aa  393  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0463  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.61 
 
 		 457 aa  391  1e-107  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1689  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.61 
 
 		 462 aa  388  1e-106  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.08159 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1797  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.56 
 
 		 474 aa  386  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.45 
 
 		 467 aa  379  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.78 
 
 		 471 aa  379  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0884852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3815  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.41 
 
 		 468 aa  377  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0616  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.62 
 
 		 466 aa  371  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11020  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.96 
 
 		 465 aa  371  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.874516 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.92 
 
 		 465 aa  370  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06120  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.54 
 
 		 464 aa  370  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3518  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.86 
 
 		 464 aa  367  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120374  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0624  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.01 
 
 		 466 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  0.337004 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.79 
 
 		 473 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5367  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.14 
 
 		 467 aa  368  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0631  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.22 
 
 		 466 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0991753  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0644  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.22 
 
 		 466 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2479  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.75 
 
 		 467 aa  363  2e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0745  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.16 
 
 		 461 aa  363  5.0000000000000005e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0794  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.98 
 
 		 464 aa  363  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0822036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6148  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.79 
 
 		 461 aa  362  6e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268459  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1045  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.46 
 
 		 469 aa  362  7.0000000000000005e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.33 
 
 		 476 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0507  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.95 
 
 		 464 aa  360  2e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.33 
 
 		 476 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.33 
 
 		 476 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.8 
 
 		 476 aa  360  4e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0784  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.28 
 
 		 472 aa  359  6e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2306  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.83 
 
 		 473 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.41 
 
 		 460 aa  357  1.9999999999999998e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.151121  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1496  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.13 
 
 		 476 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.13 
 
 		 476 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.13 
 
 		 476 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.13 
 
 		 476 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5475  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.15 
 
 		 466 aa  356  5.999999999999999e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67474  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.13 
 
 		 476 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975022  hitchhiker  0.00623097 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.57 
 
 		 463 aa  356  5.999999999999999e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.8 
 
 		 476 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1494  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.84 
 
 		 473 aa  355  1e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.92 
 
 		 476 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>