More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1689 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1689  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
462 aa  939    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.08159 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2712  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.04 
 
 
465 aa  446  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.822199  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.03 
 
 
468 aa  415  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.14 
 
 
468 aa  411  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.67 
 
 
462 aa  412  1e-113  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.1 
 
 
465 aa  407  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.78 
 
 
466 aa  405  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.42 
 
 
462 aa  399  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1508  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.91 
 
 
480 aa  397  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.468663 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  46.88 
 
 
464 aa  395  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.97 
 
 
465 aa  394  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3018  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.61 
 
 
479 aa  388  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.340958 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2913  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.77 
 
 
479 aa  386  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00695223  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3894  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.97 
 
 
471 aa  387  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.287099 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2790  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.61 
 
 
479 aa  388  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0522  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.77 
 
 
480 aa  386  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.59 
 
 
465 aa  385  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.95 
 
 
465 aa  382  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.99 
 
 
474 aa  385  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4676  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.28 
 
 
462 aa  382  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6519  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.26 
 
 
478 aa  383  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0611  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.04 
 
 
463 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512717  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.14 
 
 
479 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0279881  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.87 
 
 
465 aa  378  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.97 
 
 
464 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0478321  normal  0.511647 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2968  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.75 
 
 
468 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462781  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5901  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.26 
 
 
478 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1614  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.75 
 
 
464 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0956162 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1878  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.04 
 
 
466 aa  374  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.932595  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1720  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.5 
 
 
465 aa  373  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.160596  normal  0.364813 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1096  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.9 
 
 
464 aa  374  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1813  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.23 
 
 
477 aa  370  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0853723  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.37 
 
 
470 aa  370  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.605056  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2766  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.13 
 
 
473 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1811  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.21 
 
 
465 aa  367  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.352769 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2807  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.21 
 
 
473 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1425  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.54 
 
 
466 aa  367  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.197772  hitchhiker  0.000000283985 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.25 
 
 
473 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2755  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.88 
 
 
466 aa  365  1e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0982206  hitchhiker  0.000532855 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1801  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.26 
 
 
482 aa  364  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  decreased coverage  0.000698264 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.35 
 
 
472 aa  363  4e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.97 
 
 
465 aa  363  5.0000000000000005e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3205  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.92 
 
 
473 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169727  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1608  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.05 
 
 
481 aa  362  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392675  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2549  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.16 
 
 
471 aa  362  1e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1626  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.12 
 
 
487 aa  359  4e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.139185  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06120  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.35 
 
 
464 aa  359  6e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140424  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0325  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  42.3 
 
 
457 aa  355  7.999999999999999e-97  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0507  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.06 
 
 
464 aa  354  1e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5367  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.49 
 
 
467 aa  354  2e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2063  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.75 
 
 
487 aa  354  2e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0435  hypothetical protein  44.61 
 
 
478 aa  353  2.9999999999999997e-96  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0273668 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.05 
 
 
481 aa  353  4e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.56 
 
 
469 aa  353  4e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.850345  decreased coverage  0.00227015 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.25 
 
 
470 aa  352  5.9999999999999994e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0616  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.85 
 
 
466 aa  352  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.07 
 
 
465 aa  350  2e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0853  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.35 
 
 
465 aa  350  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50611  normal  0.0780472 
 
 
-
 
NC_004310  BR1126  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.79 
 
 
487 aa  348  2e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2779  dihydrolipoamide dehydrogenase E3 component of 3 enzyme complexes  42.4 
 
 
463 aa  347  3e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.285583  normal  0.562583 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.79 
 
 
539 aa  346  4e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.33 
 
 
477 aa  345  7e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1045  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.89 
 
 
469 aa  345  1e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1081  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.96 
 
 
481 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378558  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.76 
 
 
467 aa  343  5e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2823  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.76 
 
 
465 aa  342  8e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0347  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.7 
 
 
470 aa  342  8e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0138  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.23 
 
 
491 aa  340  2e-92  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.18 
 
 
562 aa  341  2e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.86 
 
 
458 aa  340  2e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.41 
 
 
471 aa  341  2e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.9 
 
 
468 aa  340  2.9999999999999998e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0624  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.31 
 
 
466 aa  340  4e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  0.337004 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0644  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.31 
 
 
466 aa  340  4e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0631  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.31 
 
 
466 aa  340  4e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0991753  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2479  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.56 
 
 
467 aa  338  1.9999999999999998e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3687  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.19 
 
 
478 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.12 
 
 
486 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.206341  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43970  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.19 
 
 
478 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0508378  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3815  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.69 
 
 
468 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0794  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.76 
 
 
464 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0822036  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2011  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.98 
 
 
478 aa  335  1e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1616  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.41 
 
 
478 aa  335  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3772  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1439  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.67 
 
 
469 aa  335  1e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6148  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.56 
 
 
461 aa  334  2e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268459  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.54 
 
 
471 aa  334  2e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2501  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.56 
 
 
478 aa  333  5e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.63 
 
 
460 aa  332  7.000000000000001e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.151121  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2306  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.98 
 
 
473 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3510  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.56 
 
 
478 aa  332  9e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0716172  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4187  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.77 
 
 
478 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2201  2-oxoglutarate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  38.56 
 
 
478 aa  332  1e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00788973  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3758  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.77 
 
 
478 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.31 
 
 
467 aa  332  1e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.31 
 
 
467 aa  332  1e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0718  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.25 
 
 
470 aa  331  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21952e-17 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1667  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.56 
 
 
478 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164593  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6035  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.09 
 
 
466 aa  329  5.0000000000000004e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.08 
 
 
473 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.28 
 
 
459 aa  329  6e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>